BMKCloud Log in
条形بینر-03

محصولات

مقایسه جینومکس

مقایسه جینومیک په لفظي معنی د مختلف ډولونو بشپړ جینوم ترتیب او جوړښت پرتله کول دي.د دې ډسپلین موخه د جینوم په کچه د نسلونو تکامل، د جین فعالیت، د جین تنظیمي میکانیزم څرګندول د ترتیب جوړښتونو او عناصرو په ګوته کولو سره چې په مختلفو ډولونو کې ساتل شوي یا توپیر لري.د جینومیک نسبتا پرتله کولو مطالعې کې د جین کورنۍ تحلیلونه شامل دي، ارتقاء پرمختګ، د بشپړ جینوم نقل کول، انتخابي فشار، او نور.


د خدماتو توضیحات

د ډیمو پایلې

د قضیې مطالعه

د خدماتو ګټې

1 مقایسوي جینومیک

● د هراړخیز تحلیل بسته چې اته خورا عام تحلیلونه پکې شامل دي

● د پایلو په اړه د مفصل او په اسانۍ د پوهیدو وړ تفسیر سره په تحلیل کې لوړ اعتبار

● په ښه ډول ډیزاین شوي د خپرولو لپاره چمتو شوي ارقام

● د لوړ مهارت لرونکي بایو انفارماتیک ټیم د مختلف شخصي تحلیل غوښتنې پوره کوي

● په شننې کې د لوړ دقت سره د لنډ وخت بدلول

● د 90 څخه زیاتو بریالۍ قضیو سره پراخه تجربه د 900 څخه ډیر د راټول شوي خپاره شوي اغیز فکتور سره

د خدماتو مشخصات

اټکل شوی د بدلون وخت

د ډولونو شمیر

تحلیل کوي

30 کاري ورځې

۶ – ۱۲

د جین کورنۍ کلستر کول

د جین کورنۍ پراختیا او انقباض

د Phylogenetic ونې جوړول

د انحراف وخت اټکل (فوسیل کیلیبریشن ته اړتیا ده)

د LTR داخلولو وخت (د نباتاتو لپاره)

د بشپړ جینوم نقل (د نباتاتو لپاره)

انتخابي فشار

د ترکیب تحلیل

بایو انفارماتیک تحلیلونه

● د جین کورنۍ

● Phylogenetics

● د انحراف وخت

● انتخابي فشار

● د ترکیب تحلیل

流程图 مقایسوي جینومکس

د نمونې اړتیاوې او تحویلي

د نمونې اړتیاوې:

نسج یا DNA د جینوم ترتیب او راټولولو لپاره

د نسج لپاره

ډولونه

نسج

سروې

PacBio CCS

څاروی

عصبي نسج

0.5 ~ 1g

≥ 3.5 ګرامه

د عضلاتو نسج

≥ 5.0 ګرامه

≥ 5.0mL

د تی لرونکو وینه

≥ 0.5 ملی لیتر

د چرګانو / کبانو وینه

نبات

تازه پاڼي

1 ~ 2 ګرامه

≥ 5.0 ګرامه

 

پاڼی/ ډډ

1 ~ 2 ګرامه

≥ 10.0 ګرامه

 

ريښه/تخم

1 ~ 2 ګرامه

≥ 20.0 ګرامه

حجرې

کلتوري حجره

-

≥ 1 x 108

ډاټا

د جینوم ترتیب فایلونه (.fasta) او د تشریح فایلونه (.gff3) د نږدې اړوند ډولونو

د خدماتو کاري جریان

نمونه QC

د تجربې ډیزاین

د نمونې تحویل

د سپارلو نمونه

د کتابتون چمتو کول

د کتابتون جوړول

ترتیب کول

ترتیب کول

د معلوماتو تحلیل

د معلوماتو تحلیل

د پلور وروسته خدمتونه

د پلور وروسته خدمتونه


  • مخکینی:
  • بل:

  • *د ډیمو پایلې دلته ښودل شوي ټول د بایومارکر ټیکنالوژیو سره خپاره شوي جینومونو څخه دي

    1. د LTR داخلولو وخت اټکل: دا ارقام د نورو ډولونو په پرتله په وینینګ رائی جینوم کې د LTR-RTs داخلولو وختونو کې یو ځانګړی بایموډال ویش ښودل شوی.تر ټولو وروستۍ څوکه شاوخوا 0.5 ملیون کاله وړاندې ښکاره شوه.

    3LTR-انسرشن-وخت-تخمینه-ان-ویینینګ-رائی

    لي ګوانګ او نورد طبیعت جینیات، 2021

     

     

    2. د چایوټ (Sechium edule) په اړه د فیلوجیني او جین کورنۍ تحلیل : د چایوټ او د جین په کورنۍ کې د نورو 13 اړوندو ډولونو تحلیل کولو سره، چایوټ د مارانو (Trichosanthes anguina) سره خورا نږدې تړاو درلود.چایوټ د 27-45 Mya په شاوخوا کې د سانپ له غوښې څخه اخیستل شوی او ټول جینوم نقل (WGD) په 25±4 Mya کې په چایوټ کې لیدل شوی، چې په ccuibitaceae کې د WGD دریمه پیښه ده.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    فو او نور.د باغدارۍ څیړنه، 2021

     

     

    3. Synteny شننه: د میوو په وده کې د فایټو هورمونونو پورې اړوند ځینې جینونه په چایوټو، مارانو او اسکواش کې موندل شوي.د چایوټ او اسکواش تر مینځ اړیکه د چایوټ او مارغانو تر مینځ یو څه لوړه ده.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    فو او نور.د باغدارۍ څیړنه، 2021

     

     

    4. د جین کورنۍ شننه: په G.thurberi او G.davidsonii جینومونو کې د جین د کورنۍ پراختیا او انقباض په اړه د KEGG بډایه کول وښودله چې د سټرایډ بایوسینتیسز او براسینوسټرایډ بایوسینتیز پورې اړوند جینونه پراخ شوي.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    Yang Z et al.BMC بیولوژي، 2021

     

     

    5. د بشپړ جینوم نقل کولو تحلیل: د 4DTV او Ks توزیع تحلیل د جینوم نقل کولو ټوله پیښه ښودلې.د intraspecies لوړوالی د نقل پیښې ښودل شوي.د انواعو د ځنځیرونو لوړوالی د ځانګړتیاوو پیښې ښودل شوي.تحلیل په ډاګه کړه چې د نورو دریو نږدې ډولونو سره پرتله کول، O. europaea په دې وروستیو کې په لویه پیمانه د جین نقل کولو څخه تیریږي.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    راو جی او نور.د باغدارۍ څیړنه، 2021

    د BMK قضیه

    ګلاب پرته له ټوټو څخه: جینومیک بصیرت د رطوبت موافقت سره تړاو لري

    خپور شوی: د ملي ساینس بیاکتنه، 2021

    د ترتیب کولو تګلاره:

    بسیبې رنګه' (آر.ویچورینانجینوم:
    نږدې93 X PacBio + نږدې.90 ایکس نانوپور + 267 ایکس ایلومینا

    کلیدي پایلې

    1. د لوړ کیفیت R.wichuraiana جینوم د اوږده لوستلو ترتیب کولو تخنیکونو په کارولو سره جوړ شوی، کوم چې د 530.07 Mb اسمبلۍ تولیدوي (د اټکل شوي جینوم اندازه نږدې 525.9 Mb د فلو سیټومیټري او 525.5 د جینوم سروې له مخې شاوخوا 31.0٪ وه).د BUSCO اټکل شوی نمره 93.9٪ وه.د "زاړه بلش" (haploOB) سره پرتله کول، د دې جینوم کیفیت او بشپړتیا د اساس واحد اساس دقت او د LTR اسمبلی شاخص (LAI = 20.03) لخوا تایید شوی.R.wichuraiana جینوم 32,674 پروټین کوډینګ جینونه لري.

    2. د ملټي اومکس ګډ تحلیل، چې د نسبي جینومیکونو، ټرانسکرټومیکونو، د جنیتیک نفوس QTL تحلیلونو څخه جوړ دی، د R. wichuraiana او Rosa chinensis ترمنځ مهم ځانګړتیا څرګنده کړه.همدارنګه، په QTL کې د اړونده جینونو د بیان توپیر ممکن د ډډ د ډبرې نمونې سره تړاو ولري.

    7KEGG-بډایه کول-په جین-کورنۍ-پراختیا-او انقباض

    د Basyes Thornless او Rosa chinensis تر منځ مقایسه جینومیک تحلیل په شمول د ترکیب تحلیل، د جین کورنۍ کلستر، پراختیا او انقباض تحلیل، لوی شمیر توپیرونه په ګوته کړل، کوم چې په ګلاب کې د مهمو ځانګړتیاوو سره تړاو لري.په NAC او FAR1/FRS جین کورنۍ کې بې ساري پراخوالی د تور ځای په وړاندې مقاومت سره ډیر احتمال درلود.

    81 مقایسوي-جینومیک-تجزیه-د-BT-او-او-تر منځ 82 مقایسوي-جینومیک-تجزیه-د-BT-او-او-تر منځ 83 مقایسوي-جینومیک-تجزیه-د-BT-او-او-تر منځ

    د BT او haploOB جینومونو ترمنځ مقایسه جینومیک تحلیل.

    حواله

    ژونګ، ایم، او نور."بې له ټوټو ګلاب: جینومیک بصیرت د رطوبت موافقت سره تړاو لري"د ملي ساینس بیاکتنه، 2021؛، nwab092.

    نرخ ترلاسه کړئ

    خپل پیغام دلته ولیکئ او موږ ته یې واستوئ

    خپل پیغام موږ ته واستوئ: