● د مختلفو څیړنو اهدافو لپاره د ډیری ترتیب کولو ستراتیژی شتون لري
● باکتریا د 0 Gap تضمین سره جینوم بشپړوي.
● د باکتریا جینوم اسمبلۍ کې خورا تجربه لرونکي د 10,000 څخه ډیر بشپړ جینوم راټول شوي.
● د پلور وروسته مسلکي تخنیکي مالتړ ټیم چې د څیړنې نور ځانګړي اړتیاوې پوره کوي.
ترتیب کولستراتیژي | کتابتون | کیفیت تضمین شوی | اټکل شوی د بدلون وخت |
نانوپور 100X + Illumina 50X | نانوپور 20K PE150 | 0 تشه | 30 ورځې |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● د خامو معلوماتو کیفیت کنټرول
● د جینوم مجلس
● د جینوم اجزاو تحلیل
● د جین فعالیت تشریح
● مقایسه جینومیک تحلیل
لپارهد DNA استخراج:
د نمونې ډول | مقدار | تمرکز | پاکوالی |
د DNA استخراج | 2 ملی ګرامه | 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
د نسجونو نمونو لپاره:
د نمونې ډول | وړاندیز شوی نمونه درملنه | نمونه ذخیره او بار وړل |
باکتریا | باکتریا د مایکروسکوپ لاندې وڅیړئ او باکتریاوې د دوی د توزیع مرحله کې راټول کړئ د باکتریا کلتور (تقریبا 3-4.5e9 حجرې لري) په 1.5 یا 2 ملی لیتر ایپپینډورف کې انتقال کړئ.(په یخ کې وساتئ) ټیوب د 1 دقیقو لپاره په 14000 ګرامه کې سینټرفیوج کړئ ترڅو باکتریا راټول کړي او په احتیاط سره سپرناټینټ لرې کړي. ټیوب مهر کړئ او باکتریا لږترلږه د 30 دقیقو لپاره په مایع نایټروجن کې کنګل کړئ.ټیوب په -80 ℃ یخچال کې ذخیره کړئ. | نمونې په مایع نایتروجن کې د 3-4 ساعتونو لپاره کنګل کړئ او په مایع نایتروجن یا -80 درجې کې د اوږدې مودې لپاره ذخیره کړئ.د وچې یخ سره د نمونې لیږد اړین دی. |
1. د باکتریا جینوم سرکوس
2. د جین وړاندوینې کوډ کول
3. مقایسه جینومیک تحلیل: فیلوجینیټیک ونه