-
BSA
Platforma Bulked Segregant Analysis składa się z jednoetapowej analizy standardowej i zaawansowanej analizy z dostosowanymi ustawieniami parametrów.BSA to technika stosowana do szybkiej identyfikacji markerów genetycznych związanych z fenotypem.Główny przebieg BSA obejmuje: 1. wybranie dwóch grup osobników o skrajnie przeciwstawnych fenotypach;2. łączenie DNA, RNA lub SLAF-seq (opracowanego przez Biomarker) wszystkich osobników w celu utworzenia dwóch grup DNA;3. identyfikacja sekwencji różnicowych względem genomu referencyjnego lub pomiędzy nimi, 4. przewidywanie potencjalnych regionów połączonych za pomocą algorytmu indeksu ED i SNP;5. Analiza funkcjonalna i wzbogacanie genów w regionach kandydujących itp. Dostępna jest również bardziej zaawansowana eksploracja danych, w tym badanie przesiewowe markerów genetycznych i projektowanie starterów.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) została opracowana na podstawie wieloletniego doświadczenia w analizie projektów różnorodności mikrobiologicznej, która zawiera standaryzowaną analizę podstawową i analizę spersonalizowaną: analiza podstawowa obejmuje główny nurt analizy bieżących badań mikrobiologicznych, treść analizy jest bogata i wszechstronna, a wyniki analiz prezentowane są w formie raportów projektowych;Treść spersonalizowanej analizy jest zróżnicowana.Można elastycznie wybierać próbki i ustawiać parametry zgodnie z podstawowym raportem z analizy i celem badawczym, aby spełnić spersonalizowane wymagania.System operacyjny Windows, prosty i szybki.
-
Genetyka ewolucyjna
Genetyka ewolucyjna to kompleksowa usługa sekwencjonowania zaprojektowana w celu zapewnienia kompleksowej interpretacji informacji ewolucyjnych danych materiałów w oparciu o zmienności genetyczne, w tym SNP, InDels, SV i CNV.Zawiera wszystkie analizy fundamentalne potrzebne do opisu zmian ewolucyjnych i cech genetycznych populacji, takich jak struktura populacji, różnorodność genetyczna, powiązania filogenetyczne itp. Zawiera także badania przepływu genów, co umożliwia oszacowanie efektywnej wielkości populacji i czasu dywergencji.
-
Genomika porównawcza
Genomika porównawcza dosłownie oznacza porównanie kompletnych sekwencji genomu i struktur różnych gatunków.Dyscyplina ta ma na celu ujawnienie ewolucji gatunków, funkcji genów i mechanizmu regulacji genów na poziomie genomu poprzez identyfikację struktur sekwencji i elementów, które chronią lub różnicują różne gatunki.Typowe porównawcze badanie genomiki obejmuje analizy rodziny genów, rozwoju ewolucyjnego, duplikacji całego genomu, presji selekcyjnej itp.
-
Genetyka ewolucyjna
Platforma analiz populacyjnych i genetyki ewolucyjnej powstała w oparciu o ogromne doświadczenie gromadzone przez lata w zespole badawczo-rozwojowym BMK.Jest to narzędzie przyjazne dla użytkownika, szczególnie dla badaczy, którzy nie specjalizują się w bioinformatyce.Platforma ta umożliwia podstawową analizę związaną z genetyką ewolucyjną, w tym konstrukcję drzewa filogenetycznego, analizę nierównowagi powiązań, ocenę różnorodności genetycznej, selektywną analizę przemiatania, analizę pokrewieństwa, PCA, analizę struktury populacji itp.
-
Montaż genomu oparty na Hi-C
Hi-C to metoda zaprojektowana do przechwytywania konfiguracji chromosomów poprzez połączenie badania interakcji opartych na bliskości i sekwencjonowania o wysokiej przepustowości.Uważa się, że intensywność tych interakcji jest ujemnie skorelowana z fizyczną odległością na chromosomach.Dlatego dane Hi-C mogą pomóc w grupowaniu, porządkowaniu i orientacji złożonych sekwencji w szkicu genomu oraz zakotwiczeniu ich w określonej liczbie chromosomów.Technologia ta umożliwia składanie genomu na poziomie chromosomów w przypadku braku mapy genetycznej populacji.Każdy genom potrzebuje Hi-C.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Sekwencjonowanie genomu roślin/zwierząt de novo
De Nowosekwencjonowanie odnosi się do konstrukcji całego genomu gatunku przy użyciu technologii sekwencjonowania, np. PacBio, Nanopore, NGS itp., w przypadku braku genomu referencyjnego.Niezwykła poprawa długości odczytu technologii sekwencjonowania trzeciej generacji przyniosła nowe możliwości w składaniu złożonych genomów, takich jak genomy o wysokiej heterozygotyczności, wysokim współczynniku regionów powtarzalnych, poliploidach itp. Przy długości odczytu na poziomie kilkudziesięciu kilobaz te odczyty sekwencjonowania umożliwiają rozwiązywanie powtarzalnych elementów, regionów o nieprawidłowej zawartości GC i innych wysoce złożonych regionów.
Platforma: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekwencjonowanie całego egzomu człowieka
Sekwencjonowanie całego egzomu (WES) jest uważane za opłacalną strategię sekwencjonowania służącą identyfikacji mutacji chorobotwórczych.Chociaż eksony zajmują tylko około 1,7% całego genomu, bezpośrednio reprezentują profil całkowitych funkcji białek.Doniesiono, że w genomie człowieka ponad 85% mutacji związanych z chorobą występuje w regionie kodującym białko.
BMKGENE oferuje kompleksowe i elastyczne usługi sekwencjonowania całych egzonów człowieka z różnymi strategiami przechwytywania eksonów, dostępnymi w celu spełnienia różnych celów badawczych.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekwencjonowanie fragmentów amplifikowanych w specyficznym locus (SLAF-Seq)
Wysokowydajne genotypowanie, szczególnie w przypadku populacji na dużą skalę, jest podstawowym krokiem w badaniach asocjacji genetycznych, który zapewnia podstawę genetyczną do odkrywania genów funkcjonalnych, analizy ewolucyjnej itp. Zamiast głębokiego ponownego sekwencjonowania całego genomu, sekwencjonowanie genomu o ograniczonej reprezentacji (RRGS ) wprowadzono, aby zminimalizować koszt sekwencjonowania na próbkę, przy jednoczesnym zachowaniu rozsądnej wydajności w odkrywaniu markerów genetycznych.Zwykle osiąga się to poprzez wyodrębnienie fragmentu restrykcyjnego w danym zakresie wielkości, co nazywa się biblioteką zredukowanej reprezentacji (RRL).Sekwencjonowanie fragmentów amplifikowanych w specyficznym locus (SLAF-Seq) to opracowana przez siebie strategia genotypowania SNP z genomem referencyjnym lub bez niego.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq -
Illumina i BGI
Technologia sekwencjonowania Illumina, oparta na sekwencjonowaniu przez syntezę (SBS), to przyjęta na całym świecie innowacja NGS, odpowiedzialna za generowanie ponad 90% światowych danych sekwencjonowania.Zasada SBS polega na obrazowaniu znakowanych fluorescencyjnie odwracalnych terminatorów podczas dodawania każdego dNTP, a następnie rozszczepiania, aby umożliwić włączenie kolejnej zasady.Dzięki obecności wszystkich czterech odwracalnych dNTP związanych z terminatorem w każdym cyklu sekwencjonowania, naturalna konkurencja minimalizuje błąd włączania.Ta wszechstronna technologia obsługuje zarówno biblioteki z pojedynczym odczytem, jak i biblioteki z parami końcówek, obsługując szereg zastosowań genomicznych.Wysoka przepustowość i precyzja sekwencjonowania Illumina sprawiają, że jest to kamień węgielny badań genomiki, umożliwiając naukowcom odkrywanie zawiłości genomów z niezrównaną szczegółowością i wydajnością.
DNBSEQ, opracowany przez BGI, to kolejna innowacyjna technologia NGS, której udało się jeszcze bardziej obniżyć koszty sekwencjonowania i zwiększyć przepustowość.Przygotowanie bibliotek DNBSEQ obejmuje fragmentację DNA, przygotowanie ssDNA i amplifikację metodą toczącego się koła w celu uzyskania nanokulek DNA (DNB).Następnie ładuje się je na stałą powierzchnię, a następnie sekwencjonuje za pomocą kombinatorycznej syntezy sondy i kotwicy (cPAS).
Nasza gotowa usługa sekwencjonowania bibliotek ułatwia klientom przygotowanie bibliotek sekwencjonowania z różnych źródeł (między innymi mRNA, cały genom, amplikon).Następnie biblioteki te można wysłać do naszych centrów sekwencjonowania w celu kontroli jakości i sekwencjonowania na platformach Illumina lub BGI.
