-
Sekwencjonowanie immunoprecypitacji chromatyny (ChIP-seq)
ChIP-Seq zapewnia profilowanie całego genomu celów DNA pod kątem modyfikacji histonów, czynników transkrypcyjnych i innych białek związanych z DNA.Łączy w sobie selektywność immunoprecypitacji chromatyny (ChIP) w celu odzyskania specyficznych kompleksów białko-DNA z mocą sekwencjonowania nowej generacji (NGS) w celu wysokowydajnego sekwencjonowania odzyskanego DNA.Dodatkowo, ponieważ kompleksy białko-DNA odzyskiwane są z żywych komórek, miejsca wiązania można porównywać w różnych typach komórek i tkankach lub w różnych warunkach.Zastosowania obejmują regulację transkrypcji, ścieżki rozwojowe, mechanizmy chorobowe i nie tylko.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekwencjonowanie wodorosiarczynem całego genomu
Metylacja DNA na piątej pozycji w cytozynie (5-mC) ma zasadniczy wpływ na ekspresję genów i aktywność komórkową.Nieprawidłowe wzorce metylacji powiązano z kilkoma stanami i chorobami, takimi jak rak.WGBS stał się złotym standardem w badaniu metylacji całego genomu przy rozdzielczości pojedynczej zasady.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Test na chromatynę dostępną dla transpozazy z sekwencjonowaniem o dużej przepustowości (ATAC-seq)
ATAC-seq to wysokowydajna metoda sekwencjonowania służąca do analizy dostępności chromatyny w całym genomie, co jest ważne dla globalnej epigenetycznej kontroli ekspresji genów.Adaptery sekwencjonowania są wstawiane do otwartych obszarów chromatyny za pomocą hiperaktywnej transpozazy Tn5.Po amplifikacji PCR konstruuje się bibliotekę sekwencjonowania.Wszystkie otwarte regiony chromatyny można otrzymać w określonych warunkach czasoprzestrzennych, nie ograniczających się tylko do miejsc wiązania czynnika transkrypcyjnego lub określonego regionu zmodyfikowanego histonem.
-
Sekwencjonowanie wodorosiarczynem o zmniejszonej reprezentacji (RRBS)
Badania nad metylacją DNA zawsze były gorącym tematem w badaniach nad chorobami i są ściśle powiązane z ekspresją genów i cechami fenotypowymi.RRBS to dokładna, wydajna i ekonomiczna metoda badań metylacji DNA.Wzbogacenie promotora i regionów wyspowych CpG poprzez rozszczepienie enzymatyczne (Msp I), w połączeniu z sekwencjonowaniem wodorosiarczynem, zapewnia wykrywanie metylacji DNA z wysoką rozdzielczością.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
