Chociaż sekwencjonowanie mRNA oparte na NGS służy jako wszechstronne narzędzie do ilościowego oznaczania ekspresji genów, jego poleganie na krótkich odczytach ogranicza jego skuteczność w złożonych analizach transkryptomicznych.Z kolei sekwencjonowanie PacBio (Iso-Seq) wykorzystuje technologię długiego odczytu, umożliwiającą sekwencjonowanie transkryptów mRNA pełnej długości.Podejście to ułatwia wszechstronną eksplorację alternatywnego splicingu, fuzji genów i poliadenylacji, chociaż nie jest głównym wyborem do ilościowego oznaczania ekspresji genów.Kombinacja 2+3 wypełnia lukę pomiędzy Illuminą i PacBio, opierając się na odczytach PacBio HiFi w celu identyfikacji pełnego zestawu izoform transkryptów i sekwencjonowaniu NGS w celu ilościowego określenia tych samych izoform.
Platformy: PacBio Sequel II i Illumina NovaSeq