BMKCloud Log in
Baner-03

Aktualności

Sekwencjonowanie pełnej długości transkryptomu w oparciu o nanopory

Sekwencjonowanie nanoporów różni się od innych platform sekwencjonowania tym, że nukleotydy są odczytywane bezpośrednio bez syntezy DNA i generują długie odczyty z dokładnością do dziesiątek kilozasad.Umożliwia to bezpośredni odczyt pełnej długości transkryptów i stawienie czoła wyzwaniom w badaniach transkryptomicznych.

√ Niskie odchylenie specyficzne dla sekwencji

√ Pełny odczyt cDNA do badań struktury genów

√ Mniej danych wymaganych do objęcia tej samej liczby transkryptów

√ Identyfikacja wielu izoform na gen

√ Kwantyfikacja ekspresji na poziomie izoformy

nanopor-1

Typowy rurociąg bioinformatyczny

Pełnowymiarowy-trans-bix-1024x254

Najnowsze udane przypadki z technologiami biomarkerów

1. Analizy porównawcze pełnej długości transkryptomów ujawniają dynamikę rozwoju łodygi Gnetum luofuense

Czasopismo: Frontiers in Genetics

Opublikowano: marzec 2021

Słowa kluczowe: MinION |Alternatywne łączenie |APA |lncRNA |Transkrypty o różnej ekspresji

Przeczytaj pełny tekst

2. Jednokierunkowy ruch małych RNA z pędów do korzeni w heteroprzeszczepach międzygatunkowych

Czasopismo: Rośliny przyrodnicze

Opublikowano: styczeń 2021

Słowa kluczowe: Nanopor |Ilumina |wykrywanie pełnej długości mobilnego mRNA

3. Pełnowymiarowa analiza transkryptomu korzeni szparagów ujawnia molekularny mechanizm tolerancji soli wywołanej przez arbuskularne grzyby mikoryzowe

Czasopismo: Botanika Środowiskowa i Eksperymentalna

Opublikowano: styczeń 2021

Słowa kluczowe: MinION |Różnie wyrażone transkrypcje |Czynniki transkrypcyjne |Alternatywne łączenie

4. Charakterystyczne zmiany fizjologiczne i pełnowymiarowy transkryptom korzeni i liści róży (Rosa chinensis) w odpowiedzi na stres suszy

Czasopismo: Fizjologia roślin i komórek

Opublikowano: październik 2020

Słowa kluczowe: PromethION |Różnie wyrażone transkrypcje |Predykcja funkcjonalna |Splicowane izoformy |TF i lncRNA

5. Analiza i kompleksowe porównanie sekwencjonowania RNA transkryptomu Arabidopsis w oparciu o PacBio i nanopory

Czasopismo: Metoda roślinna

Opublikowano: kwiecień 2020

Słowa kluczowe: Siatka |PromethION |Kontynuacja PacBio |Illumina NovaSeq |Dopasowanie genomu |Identyfikacja transkrypcji |Alternatywne łączenie |SSR |LncRNA |Kwantyfikacja izoform

Wiadomości i najważniejsze informacje ma na celu podzielenie się najnowszymi pomyślnymi przypadkami z firmą Biomarker Technologies, uchwycenie nowatorskich osiągnięć naukowych, a także wybitnych technik zastosowanych podczas badania.


Czas publikacji: 08 stycznia 2022 r

Wyślij do nas wiadomość: