Produkty

Genom grzyba

Biomarker Technologies zapewnia badanie genomu, genomu drobnego i genomu pełnego pene grzyba, w zależności od konkretnego celu badawczego.Sekwencjonowanie, składanie i adnotację funkcjonalną genomu można osiągnąć poprzez połączenie sekwencjonowania nowej generacji + sekwencjonowania trzeciej generacji w celu uzyskania składania genomu na wysokim poziomie.Można również zastosować technologię Hi-C, aby ułatwić składanie genomu na poziomie chromosomów.

Platforma:Kontynuacja PacBio II

Nanopore PromethION P48

Platforma Illumina NovaSeq

Skontaktuj się z nami

Szczegóły usługi

Wyniki demonstracyjne

Zalety serwisu

● Dostępnych jest wiele strategii sekwencjonowania dla różnych celów badawczych

● Duże doświadczenie w składaniu genomu grzybów, zmontowano ponad 10 000 kompletnych genomów pene.

● Profesjonalny zespół wsparcia technicznego po sprzedaży, spełniający bardziej szczegółowe potrzeby badawcze.

Specyfikacje usług

Praca	Strategia sekwencjonowania	Jakość gwarantowana	Szacowany czas realizacji
Dobra mapa grzybów	Illumina 50X + Nanopor 100X	Kontig N50≥2 Mb	35 dni roboczych
Dobra mapa grzybów	PacBio HiFi 30X	Kontig N50≥2 Mb	35 dni roboczych
Pełna mapa penisa grzybiczego	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Współczynnik zakotwiczenia chromosomu > 90%	45 dni roboczych

Analizy bioinformatyczne

● Kontrola jakości surowych danych

● Składanie genomu

● Analiza komponentów genomu

● Adnotacja dotycząca funkcji genu

● Porównawcza analiza genomu

Przykładowe wymagania i dostawa

Przykładowe wymagania:

DlaEkstrakty DNA:

Typ próbki	Kwota	Stężenie	Czystość
Ekstrakty DNA	> 1,2 µg	> 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

W przypadku próbek tkanek:

Typ próbki

Zalecana obróbka próbki

Przechowywanie i wysyłka próbek

Grzyb jednokomórkowy

Obserwuj drożdże pod mikroskopem i zbieraj je w fazie wykładniczej

Przenieść hodowlę (zawierającą około 3-4,5e9 komórek) do 1,5 lub 2 ml eppendorfu.(Trzymaj na lodzie)

Wiruj probówkę przez 1 minutę przy 14000 g, aby zebrać bakterie i ostrożnie usunąć supernatant

Zakręcić probówkę i zamrozić bakterie w ciekłym azocie na co najmniej 1-3 godziny.Przechowywać tubkę w lodówce o temperaturze -80 ℃.

Zamrozić próbki w ciekłym azocie na 3-4 godziny i przechowywać w ciekłym azocie lub w -80 stopniach z rezerwacją długoterminową.Wymagana jest wysyłka próbek z suchym lodem.

Grzyb makro

Zalecana jest tkanka w fazie aktywnego wzrostu.

Opłucz tkankę wodą wolną od endotoksyn, a następnie 70% etonalem.

Zapisz próbkę w krioprobówkach.