Analiza mRNA eukariotów (z odniesieniem)
W oparciu o znaną sekwencję genomu i informacje o adnotacjach jako dane wejściowe wykorzystuje się dane nowej generacji o wysokiej przepustowości (RNA-Seq) i identyfikuje nowe miejsca transkrypcji (nowy gen) i nowe zdarzenia zmiennego splicingu.sekwencjonowanie oceny jakości danych;sekwencjonowanie danych i dopasowanie sekwencji wybranego genomu referencyjnego, identyfikacja granic eksonu/intronu, analiza splicingu wariantu genu, eksploracja regionów genów i nowych transkryptów, identyfikacja miejsc SNP transkrybowanego regionu, granica pomiędzy 3' i 5 geny oraz adnotacje funkcjonalne i analizę wzbogacania różnych próbek (grup).
Długie niekodujące RNA
Długie niekodujące RNA (lncRNA) to rodzaj transkryptów o długości większej niż 200 nt, które nie są w stanie kodować białek.Zgromadzone dowody sugerują, że większość lncRNA z dużym prawdopodobieństwem jest funkcjonalna.Wysokoprzepustowe technologie sekwencjonowania i narzędzia analizy bioinformatycznej umożliwiają nam skuteczniejsze ujawnianie sekwencji lncRNA i informacji o pozycjonowaniu, a także prowadzą nas do odkrywania lncRNA o kluczowych funkcjach regulacyjnych.BMKCloud z dumą udostępnia naszym klientom platformę do analizy sekwencjonowania lncRNA, umożliwiającą szybką, niezawodną i elastyczną analizę lncRNA.
Sekwencjonowanie amplikonu 16S/18S/ITS
Platforma analizy różnorodności mikrobiologicznej została opracowana na podstawie wieloletniego doświadczenia w analizie projektów dotyczących różnorodności drobnoustrojów, która zawiera standaryzowaną analizę podstawową i analizę spersonalizowaną: analiza podstawowa obejmuje główny nurt analizy bieżących badań mikrobiologicznych, treść analizy jest bogata i wszechstronna, a wyniki analiz są prezentowane w formie raportów z projektów;Treść spersonalizowanej analizy jest zróżnicowana.Można elastycznie wybierać próbki i ustawiać parametry zgodnie z podstawowym raportem z analizy i celem badawczym, aby spełnić spersonalizowane wymagania.System operacyjny Windows, prosty i szybki.
Metagenomika strzelbowa (NGS)
Dane metagenomiczne wykorzystuje się do analizy mieszanych materiałów genomowych pochodzących z próbek środowiskowych, co dostarcza szczegółowych informacji na temat różnorodności i liczebności gatunków, struktury populacji, pokrewieństwa filogenetycznego, genów funkcjonalnych i sieci korelacji z czynnikami środowiskowymi.
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Zintegrowany potok analiz opracowany dla specjalistów badawczych nieposiadających wcześniejszej wiedzy bioinformatycznej i działający na serwerze o wysokiej wydajności.Ułatwia szybką realizację zadań, takich jak kontrola jakości danych, dopasowanie sekwencji, wykrywanie zmienności SNP/InDel/SV, adnotacja i gen mutacji.
GWAS
Wykorzystując określone metodologie statystyczne, analiza GWAS ma na celu odkrycie zmian nukleotydowych w całym genomie skorelowanych z różnicami fenotypowymi.Odgrywa kluczową rolę w badaniu genów funkcjonalnych związanych ze złożonymi chorobami człowieka i skomplikowanymi cechami roślin i zwierząt.
BSA
Zintegrowana platforma analityczna zapewnia przyjazny dla użytkownika interfejs do standaryzowanej i spersonalizowanej analizy różnorodności.Analiza BSA polega na łączeniu osobników o skrajnych cechach fenotypowych z segregującej populacji.Porównując zróżnicowane loci pomiędzy połączonymi próbkami, podejście to szybko identyfikuje ściśle powiązane markery molekularne powiązane z genami docelowymi.Szeroko stosowany w mapowaniu genetycznym roślin i zwierząt, jest cennym narzędziem do hodowli wspomaganej markerami i pozycjonowania genów.
Genetyka ewolucyjna
Jest to zintegrowany proces analizy przeznaczony dla specjalistów zajmujących się badaniami naukowymi z ograniczoną wiedzą bioinformatyczną.Wykorzystując rozległe doświadczenie BMKGENE w projektach ewolucji genetycznej, platforma ta działa na serwerach o wysokiej wydajności, zapewniając szybkie i precyzyjne wykonywanie spersonalizowanych analiz.Obejmują one zadania takie jak konstrukcja drzewa filogenetycznego, analiza nierównowagi powiązań, ocena różnorodności genetycznej, selektywna identyfikacja przemiatania, analiza pokrewieństwa, analiza głównych składowych i charakterystyka struktury populacji.
