Ważną cechą ogrodniczą, która odróżnia pomarańcze pępkowe od innych popularnych odmian słodkich pomarańczy, jest obecność pępka na owocu.Cecha ta jest również ważnym kryterium klasyfikacji odmian ogrodniczych słodkiej pomarańczy.
Klienci BMKGENE wykorzystali opracowaną przez BMKGENE technologię sekwencjonowania SLAF do przeprowadzenia badania zatytułowanego „Wyszukiwanie genów związanych z jakością owoców słodkich pomarańczy w oparciu o sekwencjonowanie specyficznych fragmentów amplifikowanych locus.„
Badanie obejmowało sekwencjonowanie 240 zasobów plazmy zarodkowej słodkiej pomarańczy o dużej różnorodności genetycznej i różnym pochodzeniu geograficznym, w wyniku czego uzyskano 497,82 Mb danych o krótkim odczycie.Analiza danych wykazała 1 467 968 genotypów SNP w całym genomie.Wykorzystując analizę Fst, w badaniu zidentyfikowano 6 genów kandydujących związanych z obecnością pępka, masą owoców i kwasowością miareczkową, co stanowi podstawę do ukierunkowanego udoskonalania odmian słodkich pomarańczy.
W przypadku sekwencjonowania populacji na dużą skalę sekwencjonowanie fragmentów z amplifikacją specyficznego locus (SLAF) jest bardziej opłacalne i wysoce skuteczne w porównaniu z sekwencjonowaniem całego genomu (WGS).
KliknijTutajaby dowiedzieć się więcej o tym badaniu.
Czas publikacji: 05 grudnia 2023 r