Projekt BMKGENE zapewnił ONT sekwencjonowanie nanoporowego RNA o długim odczycie i usługę ATAC-seq na potrzeby badania „Epigenetyczna i transkrypcyjna aktywacja kinazy wydzielniczej FAM20C jako onkogenu w glejaku”, które opublikowano w „Journal of Genetics and Genomics”.
W tym badaniu skonstruowano atlas transkryptomu pełnej długości w sparowanych glejakach i zaobserwowano, że 22 geny ulegają ekspresji w górę za pomocą transkryptomu pełnej długości i analizy różnicowej APA.Analiza danych ATAC-seq ujawnia, że zarówno FAM20C, jak i NPTN są genami centralnymi z otwartością chromatyny i zróżnicowaną ekspresją.
Ponadto badania in vitro i in vivo sugerują, że FAM20C stymuluje proliferację i przerzuty komórek glejaka.Tymczasem NPTN, nowy gen supresorowy nowotworu, przeciwdziała funkcji FAM20C poprzez hamowanie zarówno proliferacji, jak i migracji glejaka.Blokada FAM20C poprzez neutralizację przeciwciał powoduje regresję nowotworów ksenoprzeszczepowych.Ponadto stwierdzono, że MAX, BRD4, MYC i REST są potencjalnymi czynnikami transaktywnymi w regulacji FAM20C.
Podsumowując, wyniki te odkrywają onkogenną rolę FAM20C w glejaku i rzucają nowe światło na leczenie glejaka poprzez zniesienie FAM20C.
KliknijTutajaby dowiedzieć się więcej o tym badaniu
Czas publikacji: 20 października 2023 r