BMKCloud Log in
Baner-03

Produkty

Sekwencjonowanie eukariotycznego mRNA – Illumina

Sekwencjonowanie mRNA umożliwia profilowanie wszystkich mRNA transkrypowanych z komórek w określonych warunkach.Jest to potężna technologia pozwalająca odkryć profil ekspresji genów, struktury genów i mechanizmy molekularne niektórych procesów biologicznych.Dotychczas sekwencjonowanie mRNA znalazło szerokie zastosowanie w badaniach podstawowych, diagnostyce klinicznej, opracowywaniu leków itp.

Platforma: Platforma Illumina NovaSeq


Szczegóły usługi

Bioinformatyka

Wyniki demonstracyjne

Zalety

● Duże doświadczenie: w BMK przetworzono ponad 200 000 próbek obejmujących różne typy próbek, w tym hodowle komórkowe, tkanki, płyny ustrojowe itp. oraz zamknięto ponad 7 000 projektów mRNA-Seq obejmujących różne obszary badawcze.

● Ścisły system kontroli jakości: Podstawowe punkty kontroli jakości na wszystkich etapach, w tym przygotowanie próbki, przygotowanie biblioteki, sekwencjonowanie i bioinformatyka, są ściśle monitorowane w celu zapewnienia wysokiej jakości wyników.

● Dostępnych jest wiele baz danych do opisywania funkcji i badań wzbogacania w celu spełnienia różnorodnych celów badawczych.

● Usługi posprzedażowe: Usługi posprzedażowe ważne przez 3 miesiące po zakończeniu projektu, obejmujące monitorowanie projektu, rozwiązywanie problemów, pytania i odpowiedzi dotyczące wyników itp.

Przykładowe wymagania i dostawa

Biblioteka Strategia sekwencjonowania Zalecane dane Kontrola jakości
Wzbogacony Poli A Illumina PE150

6 GB

Q30≥85%

Przykładowe wymagania:

Nukleotydy:

Stężenie (ng/μl)

Ilość (µg)

Czystość

Uczciwość

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Na żelu widoczne jest ograniczone lub żadne zanieczyszczenie białkiem lub DNA.

Dla roślin: RIN≥6,5;

Dla zwierząt: RIN≥7,0;

5,0 ≥ 28 S/18 S ≥ 1,0;

ograniczone lub żadne wzniesienie linii bazowej

Tkanka: Waga (sucha):≥1 g
*W przypadku tkanki o masie mniejszej niż 5 mg zalecamy przesłanie próbki tkanki zamrożonej w ciekłym azocie.

Zawiesina komórkowa:Liczba komórek = 3×106- 1×107
*Zalecamy wysyłkę zamrożonego lizatu komórkowego.W przypadku, gdy liczba komórek jest mniejsza niż 5 × 105.

Próbki krwi:Objętość ≥1 ml

Mikroorganizm:Masa ≥ 1 g

Zalecana dostawa próbek

Pojemnik: probówka wirówkowa o pojemności 2 ml (nie zaleca się stosowania folii aluminiowej)

Przykładowe oznakowanie: Grupa+replika, np. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Wysyłka:

  1. Suchy lód: Próbki należy zapakować do worków i zakopać w suchym lodzie.
  2. Probówki RNAstable: Próbki RNA można suszyć w probówkach do stabilizacji RNA (np. RNAstable®) i przesyłać w temperaturze pokojowej.

Przebieg prac serwisowych

Próbka kontroli jakości

Projekt eksperymentu

dostawa próbek

Dostawa próbek

Eksperyment pilotażowy

Ekstrakcja RNA

Przygotowanie biblioteki

Budowa biblioteki

Sekwencjonowanie

Sekwencjonowanie

Analiza danych

Analiza danych

Usługi posprzedażowe

Usługi posprzedażowe


  • Poprzedni:
  • Następny:

  • Bioinformatyka

    wps_doc_10

    Eukariont Przebieg analizy sekwencjonowania mRNA

    Bioinformatyka

    ØKontrola jakości surowych danych

    ØDopasowanie genomu odniesienia

    ØAnaliza struktury transkrypcji

    ØKwantyfikacja wyrażeń

    ØAnaliza wyrażeń różniczkowych

    ØAdnotacja funkcji i wzbogacanie

    1.Krzywa nasycenia danych mRNA

    3(1)

    2.Analiza wyrażeń różniczkowych – wykres wulkanu

    4(1)

    3.Adnotacja KEGG na DEG

    5(1)

    4.Klasyfikacja GO na DEG

    6(1)

    uzyskać wycenę

    Napisz tutaj swoją wiadomość i wyślij ją do nas

    Wyślij do nas wiadomość: