●Platformy:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten i BGI-DNB-T7
●Tryby sekwencjonowania:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kontrola jakości bibliotek przed sekwencjonowaniem
●Sekwencjonowanie dostarczania danych i kontrola jakości:dostarczanie raportu kontroli jakości i surowych danych w formacie fastq po demultipleksowaniu i filtrowaniu odczytów Q30.
●Wszechstronność usług sekwencjonowania:klient może wybrać sekwencję według linii, komórki przepływowej lub ilości danych.
●Wszechstronność platform:Biblioteki DNB można przenieść na platformy Illumina
●Bogate doświadczenie na platformie sekwencjonowania Illumina:z tysiącami zamkniętych projektów z różnymi gatunkami.
●Dostarczenie raportu kontroli jakości sekwencjonowania:ze wskaźnikami jakości, dokładnością danych i ogólną wydajnością projektu sekwencjonowania.
●Dojrzały proces sekwencjonowania:z krótkim czasem realizacji.
●Rygorystyczna kontrola jakości: wdrażamy surowe wymagania dotyczące kontroli jakości, aby zagwarantować niezmiennie wysoką jakość wyników.
Ilość danych (X) | Stężenie (qPCR/nM) | Tom |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Platforma | Stężenie (qPCR/nM) | Tom |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Oprócz stężenia i całkowitej ilości wymagany jest również odpowiedni wzór pików.
Przed sekwencjonowaniem, oceną ilości biblioteki i fragmentacją dostarczany jest raport na temat jakości biblioteki.
Tabela 1. Statystyki dotyczące danych sekwencjonowania.
Identyfikator próbki | BMKID | Surowe czyta | Surowe dane (bp) | Czyste odczyty (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Rysunek 1. Rozkład jakości według odczytów w każdej próbce
Rysunek 2. Bazowa dystrybucja treści
Rysunek 3. Rozkład odczytanej zawartości w danych sekwencjonujących