Transkryptom przestrzenny BMKMANU S1000
Schemat techniczny transkryptomu przestrzennego BMKMANU S1000
Zalety BMKMANU S1000
1) Rozdzielczość subkomórkowa: Każdy obszar przechwytywania zawierał > 2 miliony przestrzennych plamek z kodem kreskowym o średnicy 2,5 µm i odstępach między środkami plamek wynoszących 5 µm, umożliwiając przestrzenną analizę transkryptomu z rozdzielczością subkomórkową (5 µm).
2) Wielopoziomowa analiza rozdzielczości: Elastyczna analiza wielopoziomowa w zakresie od 100 μm do 5 μm w celu rozróżnienia różnych cech tkanek przy optymalnej rozdzielczości.
3) Kompleksowe profilowanie transkryptomu: Można analizować transkrypty pobrane z całego preparatu tkankowego, bez ograniczeń dotyczących liczby docelowych genów i obszaru docelowego.
Specyfikacje usług
| Biblioteka | Strategia sekwencjonowania | Zalecane wyjście danych |
| Biblioteka cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/próbkę |
Przykładowe wymagania
| Próbka | Numer | Rozmiar | Jakość RNA |
| OCT osadzony blok tkankowy | 2-3 bloki/próbkę | Około.6,8 x 6,8 x 6,8 mm3 | RIN≥7 |
Aby uzyskać więcej informacji na temat wskazówek dotyczących przygotowywania próbek i przebiegu usług, skontaktuj się z: aEkspert BMKGENE
Przebieg prac serwisowych
Projekt eksperymentu
Dostawa próbek
Przed eksperymentem
Przestrzenny kod kreskowy
Budowa biblioteki
Sekwencjonowanie
Analiza danych
Usługi posprzedażowe
Dane generowane przez BMKMANU S1000 są analizowane przy użyciu oprogramowania „BSTMatrix”, które zostało samodzielnie zaprojektowane przez BMKGENE, obejmujące:
1) Generowanie macierzy ekspresji genów
2) Przetwarzanie obrazu HE
3) Kompatybilny z oprogramowaniem do analizy innych firm
4) Internetowy „BSTViewer” pomaga uzyskać wyniki wizualizacji w różnych rozdzielczościach.
1. Grupowanie punktowe
2.Rozkład przestrzenny
Nuwaga: Rezolucjapoziom=13 (100 µm, lewy); 7 (50 µm, Prawidłowy)
3. Mapa termiczna grupowania wyrażeń markerów
4.Analiza danych międzypróbkowych
