ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq ਪਲੇਟਫਾਰਮ, PE150
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਕਿਸਮ: 350bp insert cDNA ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ (ਪੀਕ ਡਿਸਟ੍ਰੀਬਿਊਸ਼ਨ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦਾ ਹੈ)
ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ: ਪੇਅਰਡ-ਐਂਡ 150 bp
ਡਾਟਾ ਮਾਤਰਾ ਦੀ ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ ਕਰੋ: 2 Gb ਕੱਚਾ ਡਾਟਾ/ਨਮੂਨਾ
(1) ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ: ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡ ਵੰਡ, ਬੇਸ ਕੁਆਲਿਟੀ ਡਿਸਟ੍ਰੀਬਿਊਸ਼ਨ, ਆਰਆਰਐਨਏ ਅਨੁਪਾਤ ਮੁਲਾਂਕਣ;
(2) ਕ੍ਰਮ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਨਤੀਜੇ ਦੇ ਅੰਕੜੇ, ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਸੰਤ੍ਰਿਪਤਾ, ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਕਵਰੇਜ;
(3) ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);
(4) ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਸਮੀਕਰਨ ਵੰਡ (ਦੋ ਜਾਂ ਦੋ ਤੋਂ ਵੱਧ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਨਾਲ), ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਵੇਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਸਬੰਧਾਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਪੀਸੀਏ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ);
(5) ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਦੋ ਜਾਂ ਦੋ ਤੋਂ ਵੱਧ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਨਾਲ);
(6) ਜੀਨ ਸੈੱਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਵੇਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਫੰਕਸ਼ਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (COG, GO, KEGG), ਫੰਕਸ਼ਨ ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (GO, KEGG), ਫੰਕਸ਼ਨ ਐਨਰੀਚਮੈਂਟ ਕੋਰਡਲ ਗ੍ਰਾਫ, ਆਈਪਾਥ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ;
(7) sRNA ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: sRNA ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ, sRNA ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ (ਧਮਾਕਾ, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA ਸੈਕੰਡਰੀ ਬਣਤਰ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ, sRNA ਟੀਚਾ ਜੀਨ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ;
(8) ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਬਣਤਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਓਪਰੇਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਸ਼ੁਰੂ ਅਤੇ ਅੰਤ ਦੀਆਂ ਸਾਈਟਾਂ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ, UTR ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਪ੍ਰਮੋਟਰ ਕ੍ਰਮ ਪੂਰਵ ਅਨੁਮਾਨ, SNP/InDel ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (SNP/InDel ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ, SNP/InDel ਖੇਤਰੀ ਵੰਡ, SNP ਅੰਕੜਾ)।