ਜੀਨੋਮ ਵਿਕਾਸ
ਜੀਨੋਮ ਡੀ ਨੋਵੋ
ਅਸੈਂਬਲੀ|ਲਿੰਗ ਨਿਰਧਾਰਨ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੈਕਨੋਲੋਜੀ ਦੁਆਰਾ ਪੂਰੇ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਕੰਮ ਅਤੇ ਅੰਸ਼ਕ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕ ਸੇਵਾਵਾਂ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੀਆਂ ਗਈਆਂ ਸਨ।
ਸਾਰ
"ਸੀਡਰੈਗਨਜ਼ ਦੇ ਪ੍ਰਤੀਕ ਫੀਨੋਟਾਈਪ ਵਿੱਚ ਪੱਤਿਆਂ ਵਰਗੀ ਜੋੜ, ਇੱਕ ਦੰਦ ਰਹਿਤ ਨਲੀ ਵਾਲਾ ਮੂੰਹ, ਅਤੇ ਇੱਕ ਖੁੱਲ੍ਹੇ "ਬ੍ਰੂਡ ਪੈਚ" 'ਤੇ ਉਪਜਾਊ ਅੰਡਿਆਂ ਦਾ ਪ੍ਰਫੁੱਲਤ ਕਰਨਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।ਅਸੀਂ ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ (ਫਾਈਲੋਪਟੇਰੀਕਸ ਟੇਨੀਓਲੈਟਸ) ਅਤੇ ਇਸ ਦੀਆਂ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧਿਤ ਸਪੀਸੀਜ਼, ਐਲੀਗੇਟਰ ਪਾਈਪਫਿਸ਼ (ਸਿੰਗਨਾਥੋਇਡਸ ਬਾਇਕੁਲੇਟਸ) ਦੇ ਨੋਵੋ-ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਨਰ ਅਤੇ ਮਾਦਾ ਜੀਨੋਮ ਬਣਾਏ।ਇੱਕ ਵਿਕਾਸਵਾਦੀ ਨਵੀਨਤਾ ਤੋਂ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ, ਪੱਤੇ-ਵਰਗੇ ਅਨੁਪਾਤ, ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਫਿਨ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਜੀਨਾਂ ਦੇ ਇੱਕ ਸਮੂਹ ਨੂੰ ਸੰਭਾਵੀ ਟਿਸ਼ੂ ਦੀ ਮੁਰੰਮਤ ਅਤੇ ਇਮਿਊਨ ਡਿਫੈਂਸ ਜੀਨਾਂ ਲਈ ਟ੍ਰਾਂਸ ਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਚੁਣਿਆ ਗਿਆ ਹੈ।scpp5 ਲਈ ਜ਼ੈਬਰਾਫਿਸ਼ ਮਿਊਟੈਂਟਸ, ਜੋ ਕਿ ਸਾਰੇ ਸਿੰਗਨਾਥਿਡਸ ਵਿੱਚ ਗੁਆਚ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਵਿੱਚ ਫੈਰੀਨਜੀਅਲ ਦੰਦਾਂ ਦੀ ਘਾਟ ਜਾਂ ਵਿਗਾੜ ਪਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ, ਇਸ ਧਾਰਨਾ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਕਿ scpp5 ਦੇ ਨੁਕਸਾਨ ਨੇ ਸਿੰਗਨਾਥਿਡਜ਼ ਵਿੱਚ ਦੰਦਾਂ ਦੇ ਨੁਕਸਾਨ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਇਆ ਹੈ।ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ ਅਤੇ ਐਲੀਗੇਟਰ ਪਾਈਪਫਿਸ਼ ਦੁਆਰਾ ਸਾਂਝੇ ਕੀਤੇ ਗਏ ਇੱਕ ਨਰ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ amhr2y ਜੀਨ ਨੂੰ ਏਨਕੋਡਿੰਗ ਕਰਨ ਵਾਲਾ ਇੱਕ ਪੁਟਵੇਟਿਵ ਲਿੰਗ-ਨਿਰਧਾਰਤ ਸਥਾਨ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। "
ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਢੰਗ:
ਸਮੱਗਰੀ
Fਸਾਡਾ ਸਾਂਝਾ ਸੀਡਰੈਗਨ (ਪੀ. ਟੈਨੀਓਲਾਟਸ) ਅਤੇ ਦੋ ਮਗਰਮੱਛ ਪਾਈਪਫਿਸ਼ (S. biaculeatus) ਨਮੂਨੇ।ਦੋ ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ (ਇੱਕ ਨਰ ਅਤੇ ਇੱਕ ਮਾਦਾ) ਅਤੇ ਦੋ ਐਲੀਗੇਟਰ ਪਾਈਪਫਿਸ਼ (ਇੱਕ ਨਰ ਅਤੇ ਇੱਕ ਮਾਦਾ) ਵਿਅਕਤੀ ਪੂਰੇ-ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮ ਲਈ ਵਰਤੇ ਗਏ ਸਨ, ਅਤੇ ਦੋ ਹੋਰ ਮਰਦ ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਨੂੰ ਜੀਨੋਮ ਅਨੁਕ੍ਰਮਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਗਿਆ ਸੀ।
ਜੀਨੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਰਣਨੀਤੀ
270/350 bp ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (ਸੀਕਵਲ) ਜਾਂ ਨੈਨੋਪੋਰ 30 Kb (MinION)+ Hi-C (NovaSeq 6000) ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ, ਅਤੇ ਦੋ ਹੋਰ ਮਰਦ ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਨੂੰ ਜੀਨੋਮ ਰੀਸਕੁਏਂਸਿੰਗ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਗਿਆ ਸੀ।
ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
Fਜਾਂ ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ, ਦਿਮਾਗ, ਅੱਖ, ਗਿੱਲ, ਜਿਗਰ, ਦਿਲ, ਗੁਰਦੇ, ਮੇਸੈਂਟਰੀ, ਅੰਤੜੀ, ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ, ਖੰਭ, ਚਮੜੀ, ਪੱਤੇ ਵਰਗਾ ਅਪੈਂਡੇਜ, ਟੈਸਟਿਸ ਅਤੇ ਅੰਡਾਸ਼ਯ ਨੂੰ ਇਕੱਠਾ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।
ਜੀਨੋਮ ਡੀ ਨੋਵੋ ਅਸੈਂਬਲੀ ਰਣਨੀਤੀ
Cਅਨੁ (ਸੁਧਾਰ) + WTDBG2 (ਅਸੈਂਬਲੀ) + ਪਾਇਲਨ (ਪੋਲਿਸ਼) + ਲੈਚੇਸਿਸ (ਹਾਈ-ਸੀ)।
ਮੁੱਖ ਨਤੀਜੇ
ਚਿੱਤਰ 1. ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ (ਪੀ. ਟੇਨੀਓਲਾਟਸ) ਅਤੇ ਐਲੀਗੇਟਰ ਪਾਈਪਫਿਸ਼ (ਐਸ. ਬਾਇਕੁਲੇਟਸ) ਦੀਆਂ ਮੁੱਖ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਫਾਈਲੋਜੈਨੇਟਿਕ ਸਥਿਤੀਆਂ।
ਚਿੱਤਰ 2. ਆਮ ਸੀਡਰੈਗਨ (ਪੀ. ਟੇਨੀਓਲੈਟਸ) ਵਿੱਚ ਪੱਤੇ-ਵਰਗੇ ਅਨੁਪਾਤ ਦਾ ਰੂਪ ਵਿਗਿਆਨ ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਮੇਕਅੱਪ।
ਚਿੱਤਰ 3. ਸਾਧਾਰਨ ਸੀਡਰੈਗਨ (ਪੀ. ਟੈਨੀਓਲਾਟਸ) ਅਤੇ ਐਲੀਗੇਟਰ ਪਾਈਪਫਿਸ਼ (ਐਸ. ਬਾਇਕੁਲੇਟਸ) ਵਿੱਚ ਪੁਟੇਟਿਵ ਲਿੰਗ ਨਿਰਧਾਰਨ ਜੀਨ।
ਚਿੱਤਰ 4. ਜ਼ੈਬਰਾਫਿਸ਼ scpp5 ਹੋਮੋਜ਼ਾਈਗਸ ਮਿਊਟੈਂਟਸ ਵਿੱਚ ਫੈਰਨਜੀਅਲ ਟੂਥ ਫਿਨੋਟਾਈਪਸ।
ਪੋਸਟ ਟਾਈਮ: ਜਨਵਰੀ-08-2022