ਜੀ.ਡਬਲਿਊ.ਏ.ਐੱਸ
ਸਿਰਲੇਖ: ਪੂਰੀ-ਜੀਨੋਮ ਰੀਸੀਵੇਂਸਿੰਗ ਬ੍ਰਾਸਿਕਾ ਨੈਪਸ ਮੂਲ ਅਤੇ ਇਸਦੇ ਸੁਧਾਰ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਜੈਨੇਟਿਕ ਸਥਾਨਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ
ਰਸਾਲਾ: ਕੁਦਰਤ ਸੰਚਾਰ
NGS |WGS |ਅਨੁਪ੍ਰਯੋਗ |GWAS |ਪ੍ਰਤੀਲਿਪੀ |RNAseq |ਬ੍ਰਾਸਿਕਾ ਨੈਪਸ |ਵਿਕਾਸ |ਘਰੇਲੂ
ਇਸ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ, ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੈਕਨੋਲੋਜੀਜ਼ ਨੇ ਐੱਨ.ਜੀ.ਐੱਸ. ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ 'ਤੇ ਸੇਵਾਵਾਂ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੀਆਂ ਹਨ, ਨਾਲ ਹੀ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਡਾਟਾ 'ਤੇ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ 'ਤੇ ਤਕਨੀਕੀ ਸਹਾਇਤਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੀ ਹੈ।
ਪਿਛੋਕੜ
ਬ੍ਰਾਸਿਕਾ ਨੈਪਸ(ਰੇਪਸੀਡ) ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੇਲ ਬੀਜ ਫਸਲ ਹੈ ਅਤੇ ਪੌਲੀਪਲੋਇਡ ਪ੍ਰਜਾਤੀ, ਵਿਕਾਸ ਅਤੇ ਚੋਣ ਦੀਆਂ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਲਈ ਇੱਕ ਸ਼ਾਨਦਾਰ ਮਾਡਲ ਹੈ।ਹਾਲਾਂਕਿ, ਕੀ ਜੰਗਲੀ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਜਾਂ ਪਾਲਤੂ ਦਾਨ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਮਾਤਾ-ਪਿਤਾ ਦੇ ਪੂਰਵਜ ਸਨ ਅਤੇ ਰੇਪਸੀਡ ਵਿੱਚ ਪਾਲਤੂ ਪਾਲਣ ਅਤੇ ਸੁਧਾਰ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਣ ਵਾਲੇ ਜੀਨ ਅਜੇ ਵੀ ਅਣਜਾਣ ਹਨ।
ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਢੰਗ
ਸਮੱਗਰੀ:588ਬੀ ਨੈਪਸਇਸ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਸਨ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚ ਏਸ਼ੀਆ ਤੋਂ 466, ਯੂਰਪ ਤੋਂ 102, ਉੱਤਰੀ ਅਮਰੀਕਾ ਤੋਂ 13 ਅਤੇ ਆਸਟ੍ਰੇਲੀਆ ਤੋਂ 7 ਸ਼ਾਮਲ ਸਨ।ਵਿਕਾਸ ਦੀ ਆਦਤ ਦੇ ਰਿਕਾਰਡਾਂ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ, ਇਹਨਾਂ ਸਮੱਗਰੀਆਂ ਨੂੰ ਤਿੰਨ ਈਕੋਟਾਈਪਾਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਿਆ ਗਿਆ ਸੀ;ਬਸੰਤ (86 ਐਕਸੈਸ਼ਨ), ਸਰਦੀਆਂ (74 ਐਕਸੈਸ਼ਨ), ਅਤੇ ਅਰਧ-ਸਰਦੀਆਂ (428 ਐਕਸੈਸ਼ਨ)।
ਕ੍ਰਮ:ਔਸਤ ਲਗਭਗ.5× (3.37× ਤੋਂ 7.71× ਤੱਕ)
ਲੜੀਵਾਰ ਪਲੇਟਫਾਰਮ:ਇਲੁਮਿਨਾ ਹਿਸੇਕ 4000
ਡਾਟਾ ਉਤਪਾਦਨ:4.03 Tb ਸਾਫ਼ ਡਾਟਾ
SNP ਕਾਲਿੰਗ:BWA + GATK.5,294,158 SNPs ਅਤੇ 1,307,151 InDels ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ।
ਨਤੀਜੇ
ਬੀ ਨੈਪਸ ਦਾ ਮੂਲ
ਬੀ ਨੈਪਸਇੱਕ ਸਬਜੀਨੋਮ ਯੂਰਪੀਅਨ ਟਰਨਿਪ ਦੇ ਪੂਰਵਜ ਤੋਂ ਵਿਕਸਤ ਹੋਇਆ।ਯੂਰਪੀਅਨ ਟਰਨਿਪ ਤੋਂ ਲੈ ਕੇ ਤੱਕ ਇੱਕ ਜੀਨ ਪ੍ਰਵਾਹ ਘਟਨਾਬੀ ਨਪੂs ਇੱਕ ਸਬਜੀਨੋਮ ~ 106–1170 ਸਾਲ ਪਹਿਲਾਂ ਹੋਇਆ ਸੀ।ਬੀ ਨੈਪਸC ਸਬਜੀਨੋਮ ਇਹਨਾਂ ਵੰਸ਼ਾਂ ਦੇ ਸਾਂਝੇ ਪੂਰਵਜ ਤੋਂ ਵਿਕਸਤ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਦੇ ਪੂਰਵਜਬੀ ਨੈਪਸਚਾਰ ਬੀ. ਓਲੇਰੇਸੀਆ ਉਪ-ਜਾਤੀਆਂ ਦੇ ਸਾਂਝੇ ਪੂਰਵਜ ਤੋਂ ਵੰਡਿਆ ਗਿਆ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਦੇ ਪ੍ਰਵਾਹ ਨਾਲਬੀ ਨੈਪਸ~ 108-898 ਸਾਲ ਪਹਿਲਾਂ।ਬੀ ਨੈਪਸC ਸਬਜੀਨੋਮ ਦਾ ਇੱਕ ਸਬਜੀਨੋਮ ਨਾਲੋਂ ਵਧੇਰੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਮੂਲ ਹੈ।ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਦੋਨੋ ਦੋ ਸਬਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਜ਼ਬੂਤ ਅੜਚਣ ਵਿਕਸਿਤ ਹੋਈਬੀ ਨੈਪਸਵਿਕਾਸਸਰਦੀ ਅਤੇ ਅਰਧ-ਸਰਦੀਬੀ ਨੈਪਸਈਕੋਟਾਈਪ ~ 60 ਸਾਲ ਪਹਿਲਾਂ ਵੱਖ ਹੋ ਗਏ ਸਨ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਸਰਦੀਆਂ ਅਤੇ ਬਸੰਤਬੀ ਨੈਪਸ~ 416 ਸਾਲ ਪਹਿਲਾਂ, ਅਤੇ ਤੇਲ ਬੀਜ ਅਤੇ ਗੈਰ-ਤਿਲਹਨਬੀ ਨੈਪਸ~ 277 ਸਾਲ ਪਹਿਲਾਂ ਬਦਲ ਗਿਆ।
ਚਿੱਤਰ 2 588 ਬੀ. ਨੈਪੁਸ ਐਕਸੈਸ਼ਨ ਅਤੇ 199 ਬੀ. ਰੈਪਾ ਐਕਸੈਸ਼ਨ ਦੀ ਆਬਾਦੀ ਦਾ ਢਾਂਚਾ।
ਚਿੱਤਰ 3 588 ਬੀ. ਨੈਪਸ ਐਕਸੈਸ਼ਨਜ਼ ਅਤੇ 119 ਬੀ. ਓਲੇਰੇਸੀਆ ਐਕਸੈਸ਼ਨ ਦੀ ਆਬਾਦੀ ਦਾ ਢਾਂਚਾ
ਚੋਣ ਸੰਕੇਤ ਅਤੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਅਧਿਐਨ।
ਸੁਧਾਰ ਦੇ ਪਹਿਲੇ ਪੜਾਅ (FSI) ਦੌਰਾਨ, A ਸਬਜੀਨੋਮ ਨਾਲੋਂ B. ਨੈਪਸ ਸੀ ਸਬਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਵਧੇਰੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਖਤਮ ਹੋ ਗਈ ਸੀ।ਸੁਧਾਰ ਦੇ ਦੂਜੇ ਪੜਾਅ (SSI) ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ FSI ਦੌਰਾਨ ਘੱਟ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਆਈ ਹੈ।SSI-ਚੋਣ ਸਿਗਨਲ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਤਣਾਅ ਸਹਿਣਸ਼ੀਲਤਾ, ਵਿਕਾਸ ਅਤੇ ਪਾਚਕ ਮਾਰਗਾਂ ਵਿੱਚ ਭਰਪੂਰ ਸਨ।60 ਟਿਕਾਣੇ 10 ਟੀਚੇ ਦੇ ਗੁਣਾਂ ਨਾਲ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚ 5 ਬੀਜ ਦੀ ਉਪਜ, 3 ਤੋਂ ਸਿਲਿਕ ਲੰਬਾਈ, 4 ਤੇਲ ਦੀ ਸਮੱਗਰੀ ਨਾਲ, ਅਤੇ 48 ਬੀਜ ਦੀ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ।
ਚਿੱਤਰ 4 ਬੀ. ਨੈਪੁਸ ਦੇ SSI ਦੌਰਾਨ ਚੁਣੇ ਹੋਏ ਖੇਤਰਾਂ ਦੀ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਸਕੈਨਿੰਗ ਅਤੇ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਇੱਕ ਉੱਚ-ਤੇਲ-ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਡਬਲ-ਘੱਟ ਕਾਸ਼ਤਕਾਰੀ ਅਤੇ ਇੱਕ ਘੱਟ-ਤੇਲ-ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਡਬਲ-ਹਾਈ ਕਲਟੀਵਾਰ ਤੋਂ 11 ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦਾ RNAseq ਡੇਟਾ ਗਲੂਕੋਸੀਨੋਲੇਟ ਬਾਇਓਸਿੰਥੈਟਿਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਪਛਾਣੇ ਗਏ ਜੀਨਾਂ ਨੂੰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜ਼ਿਆਦਾ ਪ੍ਰਸਤੁਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।
ਚਿੱਤਰ 5 ਬੀ. ਨੈਪਸ ਦੇ ਈਕੋਟਾਈਪ ਸੁਧਾਰ ਦੀ ਚੋਣ ਦੇ ਤਹਿਤ ਫੁੱਲਾਂ ਦੇ ਸਮੇਂ ਦੇ ਨਿਯਮ ਦੀ ਸੰਖੇਪ ਜਾਣਕਾਰੀ
ਚਰਚਾ
ਇਸ ਅਧਿਐਨ ਨੇ ਮੂਲ ਅਤੇ ਸੁਧਾਰ ਇਤਿਹਾਸ ਨੂੰ ਸਮਝਣ ਲਈ ਇੱਕ ਕੀਮਤੀ ਸਰੋਤ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤਾਬੀ ਨੈਪਸਅਤੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਖੇਤੀ ਵਿਗਿਆਨਿਕ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਗੁਣਾਂ ਦੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਅਧਾਰਾਂ ਦੇ ਵਿਭਾਜਨ ਦੀ ਸਹੂਲਤ ਦੇਵੇਗਾ।ਅਨੁਕੂਲ ਰੂਪਾਂ, ਚੋਣ ਸੰਕੇਤਾਂ ਅਤੇ ਉਮੀਦਵਾਰ ਜੀਨਾਂ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ SNPs ਭਵਿੱਖ ਵਿੱਚ ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਣਗੇ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਇਸ ਹਾਲੀਆ ਐਲੋਪੋਲੀਪਲੋਇਡ ਫਸਲ ਅਤੇ ਇਸਦੇ ਰਿਸ਼ਤੇਦਾਰਾਂ ਦੀ ਉਪਜ, ਬੀਜ ਦੀ ਗੁਣਵੱਤਾ, ਤੇਲ ਦੀ ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਅਨੁਕੂਲਤਾ ਵਿੱਚ ਸੁਧਾਰ ਕਰਨ ਵਿੱਚ।
ਹਵਾਲਾ
ਪੂਰੀ-ਜੀਨੋਮ ਰੀਸੀਵੇਂਸਿੰਗ ਬ੍ਰਾਸਿਕਾ ਨੈਪੁਸ ਮੂਲ ਅਤੇ ਇਸਦੇ ਸੁਧਾਰ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਜੈਨੇਟਿਕ ਸਥਾਨਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ[J]।ਕੁਦਰਤ ਸੰਚਾਰ, 2019, 10(1)।
ਖਬਰਾਂ ਅਤੇ ਹਾਈਲਾਈਟਸ ਇਸ ਦਾ ਉਦੇਸ਼ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੈਕਨੋਲੋਜੀਜ਼ ਨਾਲ ਨਵੀਨਤਮ ਸਫਲ ਮਾਮਲਿਆਂ ਨੂੰ ਸਾਂਝਾ ਕਰਨਾ, ਅਧਿਐਨ ਦੌਰਾਨ ਲਾਗੂ ਕੀਤੀਆਂ ਗਈਆਂ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਾਪਤੀਆਂ ਨੂੰ ਹਾਸਲ ਕਰਨਾ ਹੈ।
ਪੋਸਟ ਟਾਈਮ: ਜਨਵਰੀ-05-2022