● ਉੱਚ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਅਸੈਂਬਲੀ-ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਅਤੇ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਜੀਨ ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਦੀ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣਾ
● ਬੰਦ ਬੈਕਟੀਰੀਅਲ ਜੀਨੋਮ ਆਈਸੋਲੇਸ਼ਨ
● ਵਿਭਿੰਨ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਵਧੇਰੇ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਅਤੇ ਭਰੋਸੇਮੰਦ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਜਰਾਸੀਮ ਸੂਖਮ ਜੀਵਾਂ ਜਾਂ ਐਂਟੀਬਾਇਓਟਿਕ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਖੋਜ
● ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਪਲੇਟਫਾਰਮ | ਕ੍ਰਮਬੱਧ | ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ੀ ਡੇਟਾ | ਟਰਨਅਰਾਊਂਡ ਟਾਈਮ |
ਨੈਨੋਪੋਰ | ਓ.ਐਨ.ਟੀ | 6 ਜੀ/10 ਜੀ | 65 ਕੰਮਕਾਜੀ ਦਿਨ |
● ਕੱਚਾ ਡਾਟਾ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ
● Metagenome ਅਸੈਂਬਲੀ
● ਗੈਰ-ਰਿਡੰਡੈਂਟ ਜੀਨ ਸੈੱਟ ਅਤੇ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
● ਸਪੀਸੀਜ਼ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
● ਜੈਨੇਟਿਕ ਫੰਕਸ਼ਨ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
● ਅੰਤਰ-ਸਮੂਹ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
● ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਕਾਰਕਾਂ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਨਮੂਨਾ ਲੋੜਾਂ:
ਲਈਡੀਐਨਏ ਕੱਡਣ:
ਨਮੂਨਾ ਦੀ ਕਿਸਮ | ਦੀ ਰਕਮ | ਧਿਆਨ ਟਿਕਾਉਣਾ | ਸ਼ੁੱਧਤਾ |
ਡੀਐਨਏ ਕੱਡਣ | 1-1.5 μg | 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
ਵਾਤਾਵਰਣ ਦੇ ਨਮੂਨੇ ਲਈ:
ਨਮੂਨਾ ਕਿਸਮ | ਸਿਫ਼ਾਰਿਸ਼ ਕੀਤੀ ਨਮੂਨਾ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ |
ਮਿੱਟੀ | ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਮਾਤਰਾ: ਲਗਭਗ.5 g;ਬਾਕੀ ਬਚੇ ਸੁੱਕੇ ਪਦਾਰਥ ਨੂੰ ਸਤ੍ਹਾ ਤੋਂ ਹਟਾਉਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ;ਵੱਡੇ ਟੁਕੜਿਆਂ ਨੂੰ ਪੀਸ ਲਓ ਅਤੇ 2 ਮਿਲੀਮੀਟਰ ਫਿਲਟਰ ਵਿੱਚੋਂ ਲੰਘੋ;ਰਿਜ਼ਰਵੇਸ਼ਨ ਲਈ ਨਿਰਜੀਵ EP-ਟਿਊਬ ਜਾਂ cyrotube ਵਿੱਚ ਅਲੀਕੋਟ ਦੇ ਨਮੂਨੇ। |
ਮਲ | ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਮਾਤਰਾ: ਲਗਭਗ.5 g;ਰਿਜ਼ਰਵੇਸ਼ਨ ਲਈ ਨਿਰਜੀਵ EP-ਟਿਊਬ ਜਾਂ ਕ੍ਰਾਇਓਟਿਊਬ ਵਿੱਚ ਅਲੀਕੋਟ ਨਮੂਨੇ ਇਕੱਠੇ ਕਰੋ। |
ਅੰਤੜੀ ਸਮੱਗਰੀ | ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਐਸੇਪਟਿਕ ਸਥਿਤੀ ਦੇ ਅਧੀਨ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਕਰਨ ਦੀ ਜ਼ਰੂਰਤ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।ਪੀਬੀਐਸ ਨਾਲ ਇਕੱਠੇ ਕੀਤੇ ਟਿਸ਼ੂ ਨੂੰ ਧੋਵੋ;ਪੀ.ਬੀ.ਐੱਸ. ਨੂੰ ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਜ ਕਰੋ ਅਤੇ EP-ਟਿਊਬਾਂ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰੇਸਿਪੀਟੈਂਟ ਨੂੰ ਇਕੱਠਾ ਕਰੋ। |
ਸਲੱਜ | ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਮਾਤਰਾ: ਲਗਭਗ.5 g;ਰਿਜ਼ਰਵੇਸ਼ਨ ਲਈ ਨਿਰਜੀਵ EP-ਟਿਊਬ ਜਾਂ ਕ੍ਰਾਇਓਟਿਊਬ ਵਿੱਚ ਅਲੀਕੋਟ ਸਲੱਜ ਦਾ ਨਮੂਨਾ ਇਕੱਠਾ ਕਰੋ |
ਵਾਟਰਬਾਡੀ | ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਦੀ ਸੀਮਤ ਮਾਤਰਾ ਵਾਲੇ ਨਮੂਨੇ ਲਈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਟੂਟੀ ਦਾ ਪਾਣੀ, ਖੂਹ ਦਾ ਪਾਣੀ, ਆਦਿ, ਘੱਟੋ-ਘੱਟ 1 L ਪਾਣੀ ਇਕੱਠਾ ਕਰੋ ਅਤੇ ਝਿੱਲੀ 'ਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਨੂੰ ਭਰਪੂਰ ਬਣਾਉਣ ਲਈ 0.22 μm ਫਿਲਟਰ ਵਿੱਚੋਂ ਲੰਘੋ।ਝਿੱਲੀ ਨੂੰ ਨਿਰਜੀਵ ਟਿਊਬ ਵਿੱਚ ਸਟੋਰ ਕਰੋ। |
ਚਮੜੀ | ਨਿਰਜੀਵ ਕਪਾਹ ਦੇ ਫੰਬੇ ਜਾਂ ਸਰਜੀਕਲ ਬਲੇਡ ਨਾਲ ਚਮੜੀ ਦੀ ਸਤ੍ਹਾ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਨਾਲ ਖੁਰਚੋ ਅਤੇ ਇਸਨੂੰ ਨਿਰਜੀਵ ਟਿਊਬ ਵਿੱਚ ਰੱਖੋ। |
ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਤਰਲ ਨਾਈਟ੍ਰੋਜਨ ਵਿੱਚ 3-4 ਘੰਟਿਆਂ ਲਈ ਫ੍ਰੀਜ਼ ਕਰੋ ਅਤੇ ਤਰਲ ਨਾਈਟ੍ਰੋਜਨ ਜਾਂ -80 ਡਿਗਰੀ ਤੱਕ ਲੰਬੇ ਸਮੇਂ ਲਈ ਰਿਜ਼ਰਵੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਸਟੋਰ ਕਰੋ।ਸੁੱਕੀ ਬਰਫ਼ ਨਾਲ ਨਮੂਨਾ ਸ਼ਿਪਿੰਗ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ।
1.ਹੀਟਮੈਪ: ਸਪੀਸੀਜ਼ ਰਿਚਨੇਸ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ2. ਕੇਈਜੀਜੀ ਪਾਚਕ ਮਾਰਗਾਂ ਨੂੰ ਐਨੋਟੇਟ ਕੀਤੇ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਜੀਨ3. ਸਪੀਸੀਜ਼ ਕੋਰਿਲੇਸ਼ਨ ਨੈੱਟਵਰਕ4. CARD ਐਂਟੀਬਾਇਓਟਿਕ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧੀ ਜੀਨਾਂ ਦਾ ਸਰਕੋਸ
BMK ਕੇਸ
ਨੈਨੋਪੋਰ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕਸ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਦੇ ਹੇਠਲੇ ਸਾਹ ਦੀ ਲਾਗ ਦੇ ਤੇਜ਼ ਕਲੀਨਿਕਲ ਨਿਦਾਨ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ
ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ:ਕੁਦਰਤ ਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ, 2019
ਤਕਨੀਕੀ ਹਾਈਲਾਈਟਸ
ਕ੍ਰਮ: ਨੈਨੋਪੋਰ ਮਿਨੀਅਨ
ਕਲੀਨਿਕਲ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕਸ ਬਾਇਓਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ: ਮੇਜ਼ਬਾਨ ਡੀਐਨਏ ਕਮੀ, WIMP ਅਤੇ ARMA ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਤੇਜ਼ ਖੋਜ: 6 ਘੰਟੇ
ਉੱਚ ਸੰਵੇਦਨਸ਼ੀਲਤਾ: 96.6%
ਮੁੱਖ ਨਤੀਜੇ
2006 ਵਿੱਚ, ਹੇਠਲੇ ਸਾਹ ਦੀ ਲਾਗ (LR) ਨੇ ਵਿਸ਼ਵ ਪੱਧਰ 'ਤੇ 3 ਮਿਲੀਅਨ ਮਨੁੱਖੀ ਮੌਤਾਂ ਦਾ ਕਾਰਨ ਬਣਾਇਆ।LR1 ਜਰਾਸੀਮ ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾਉਣ ਦਾ ਖਾਸ ਤਰੀਕਾ ਹੈ ਕਾਸ਼ਤ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਕਮਜ਼ੋਰ ਸੰਵੇਦਨਸ਼ੀਲਤਾ, ਲੰਬੇ ਸਮੇਂ ਲਈ ਮੋੜ ਅਤੇ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਐਂਟੀਬਾਇਓਟਿਕ ਥੈਰੇਪੀ ਵਿੱਚ ਮਾਰਗਦਰਸ਼ਨ ਦੀ ਘਾਟ ਹੈ।ਇੱਕ ਤੇਜ਼ ਅਤੇ ਸਹੀ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਨਿਦਾਨ ਲੰਬੇ ਸਮੇਂ ਤੋਂ ਇੱਕ ਜ਼ਰੂਰੀ ਲੋੜ ਹੈ।ਈਸਟ ਐਂਗਲੀਆ ਯੂਨੀਵਰਸਿਟੀ ਤੋਂ ਡਾ. ਜਸਟਿਨ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਸਾਥੀਆਂ ਨੇ ਜਰਾਸੀਮ ਦੀ ਖੋਜ ਲਈ ਨੈਨੋਪੋਰ-ਅਧਾਰਤ ਮੈਟੇਜਨੋਮਿਕ ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਸਫਲਤਾਪੂਰਵਕ ਵਿਕਸਤ ਕੀਤਾ।ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਵਰਕਫਲੋ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ, ਹੋਸਟ ਡੀਐਨਏ ਦਾ 99.99% ਖਤਮ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ.ਰੋਗਾਣੂਆਂ ਅਤੇ ਐਂਟੀਬਾਇਓਟਿਕ ਰੋਧਕ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਖੋਜ 6 ਘੰਟਿਆਂ ਵਿੱਚ ਪੂਰੀ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ।
ਹਵਾਲਾ
ਚਾਰਲਾਮਪੌਸ, ਟੀ., ਕੇ, ਜੀ.ਐਲ., ਰਿਚਰਡਸਨ, ਐਚ., ਆਇਡਿਨ, ਏ., ਅਤੇ ਓ'ਗ੍ਰੇਡੀ, ਜੇ.(2019)।ਨੈਨੋਪੋਰ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕਸ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਹੇਠਲੇ ਸਾਹ ਦੀ ਲਾਗ ਦੇ ਤੇਜ਼ ਕਲੀਨਿਕਲ ਨਿਦਾਨ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।ਕੁਦਰਤ ਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ, 37(7), 1.