-
ਪਲਾਂਟ/ਐਨੀਮਲ ਡੀ ਨੋਵੋ ਜੀਨੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਡੀ ਨੋਵੋਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਦਾ ਮਤਲਬ ਹੈ ਕਿ ਕਿਸੇ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਅਣਹੋਂਦ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਤਕਨੀਕਾਂ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ PacBio, ਨੈਨੋਪੋਰ, NGS, ਆਦਿ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਇੱਕ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਦੇ ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਨਿਰਮਾਣ ਨੂੰ।ਤੀਸਰੀ ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੀ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੀ ਰੀਡ ਲੰਬਾਈ ਵਿੱਚ ਕਮਾਲ ਦੇ ਸੁਧਾਰ ਨੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨੋਮਾਂ ਨੂੰ ਇਕੱਠਾ ਕਰਨ ਦੇ ਨਵੇਂ ਮੌਕੇ ਲਿਆਂਦੇ ਹਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਉੱਚ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਵਾਲੇ, ਦੁਹਰਾਉਣ ਵਾਲੇ ਖੇਤਰਾਂ ਦਾ ਉੱਚ ਅਨੁਪਾਤ, ਪੌਲੀਪਲੋਇਡਜ਼, ਆਦਿ। ਦਸਾਂ ਕਿਲੋਬੇਸ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਪੜ੍ਹਨ ਦੀ ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਨਾਲ, ਇਹ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਰੀਡਜ਼ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਦੁਹਰਾਉਣ ਵਾਲੇ ਤੱਤਾਂ, ਅਸਧਾਰਨ GC ਸਮੱਗਰੀ ਵਾਲੇ ਖੇਤਰ ਅਤੇ ਹੋਰ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਖੇਤਰਾਂ ਦਾ ਹੱਲ ਕਰਨਾ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: ਪੈਕਬੀਓ ਸੀਕਵਲ II / ਨੈਨੋਪੋਰ ਪ੍ਰੋਮੇਥੀਅਨ ਪੀ 48 / ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ 6000
-
ਹਾਈ-ਸੀ ਆਧਾਰਿਤ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ
ਹਾਈ-ਸੀ ਇੱਕ ਢੰਗ ਹੈ ਜੋ ਪ੍ਰੋਬਿੰਗ ਨੇੜਤਾ-ਅਧਾਰਿਤ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਅਤੇ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਜੋੜ ਕੇ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਸੰਰਚਨਾ ਨੂੰ ਹਾਸਲ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।ਮੰਨਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਇਹਨਾਂ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਤੀਬਰਤਾ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮਸ 'ਤੇ ਸਰੀਰਕ ਦੂਰੀ ਨਾਲ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਬੰਧਿਤ ਹੈ।ਇਸ ਲਈ, ਹਾਈ-ਸੀ ਡੇਟਾ ਇੱਕ ਡਰਾਫਟ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਇਕੱਠੇ ਕੀਤੇ ਕ੍ਰਮਾਂ ਦੇ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ, ਆਰਡਰਿੰਗ ਅਤੇ ਦਿਸ਼ਾ ਨਿਰਦੇਸ਼ਿਤ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਨੂੰ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਦੀ ਇੱਕ ਖਾਸ ਸੰਖਿਆ ਵਿੱਚ ਐਂਕਰਿੰਗ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਇਹ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਆਬਾਦੀ-ਅਧਾਰਤ ਜੈਨੇਟਿਕ ਨਕਸ਼ੇ ਦੀ ਅਣਹੋਂਦ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ-ਪੱਧਰ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ।ਹਰ ਇੱਕ ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਹਾਈ-ਸੀ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ 6000 / DNBSEQ
-
ਵਿਕਾਸਵਾਦੀ ਜੈਨੇਟਿਕਸ
ਈਵੇਲੂਸ਼ਨਰੀ ਜੈਨੇਟਿਕਸ ਇੱਕ ਪੈਕਡ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੇਵਾ ਹੈ ਜੋ SNPs, InDels, SVs ਅਤੇ CNVs ਸਮੇਤ ਜੈਨੇਟਿਕ ਭਿੰਨਤਾਵਾਂ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਦਿੱਤੀ ਗਈ ਸਮੱਗਰੀ ਦੀ ਵਿਕਾਸ ਸੰਬੰਧੀ ਜਾਣਕਾਰੀ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਵਿਆਖਿਆ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ।ਇਹ ਵਿਕਾਸਵਾਦੀ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਅਤੇ ਆਬਾਦੀ ਦੀਆਂ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਆਬਾਦੀ ਦੀ ਬਣਤਰ, ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ, ਫਾਈਲੋਜੀਨੀ ਸਬੰਧਾਂ, ਆਦਿ ਦਾ ਵਰਣਨ ਕਰਨ ਲਈ ਲੋੜੀਂਦੇ ਸਾਰੇ ਬੁਨਿਆਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਪ੍ਰਵਾਹ 'ਤੇ ਅਧਿਐਨ ਵੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਜੋ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਆਬਾਦੀ ਦੇ ਆਕਾਰ, ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੇ ਸਮੇਂ ਦੇ ਅਨੁਮਾਨ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
-
ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੀਨੋਮਿਕਸ
ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਦਾ ਸ਼ਾਬਦਿਕ ਅਰਥ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੇ ਸੰਪੂਰਨ ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮਾਂ ਅਤੇ ਬਣਤਰਾਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਨਾ ਹੈ।ਇਸ ਅਨੁਸ਼ਾਸਨ ਦਾ ਉਦੇਸ਼ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਵਿੱਚ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਜਾਂ ਭਿੰਨਤਾਵਾਂ ਵਾਲੇ ਕ੍ਰਮ ਢਾਂਚੇ ਅਤੇ ਤੱਤਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਕੇ ਜੀਨੋਮ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਈਵੇਲੂਸ਼ਨ, ਜੀਨ ਫੰਕਸ਼ਨ, ਜੀਨ ਰੈਗੂਲੇਟਰੀ ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਨਾ ਹੈ।ਆਮ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰ, ਵਿਕਾਸਵਾਦੀ ਵਿਕਾਸ, ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਨਕਲ, ਚੋਣਤਮਕ ਦਬਾਅ, ਆਦਿ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।
-
ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਵੱਖਰਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਬਲਕਡ ਸੈਗਰੀਗੈਂਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਬੀਐਸਏ) ਇੱਕ ਤਕਨੀਕ ਹੈ ਜੋ ਫਿਨੋਟਾਈਪ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਜਲਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।BSA ਦੇ ਮੁੱਖ ਵਰਕਫਲੋ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਹੀ ਵਿਰੋਧੀ ਫੀਨੋਟਾਈਪਾਂ ਵਾਲੇ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਦੇ ਦੋ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਚੁਣਨਾ, ਸਾਰੇ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਦੇ ਡੀਐਨਏ ਨੂੰ ਡੀਐਨਏ ਦੇ ਦੋ ਬਲਕ ਬਣਾਉਣ ਲਈ ਪੂਲਿੰਗ ਕਰਨਾ, ਦੋ ਪੂਲ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਵਿਭਿੰਨ ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।ਇਹ ਤਕਨੀਕ ਪੌਦਿਆਂ/ਜਾਨਵਰਾਂ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਏ ਗਏ ਜੀਨਾਂ ਦੁਆਰਾ ਮਜ਼ਬੂਤੀ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤੀ ਗਈ ਹੈ।
