ਡੀਐਨਏ/ਆਰਐਨਏ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ - ਨੈਨੋਪੋਰ ਸੀਕੁਏਂਸਰ
ਸੇਵਾ ਵੇਰਵੇ ਦੀਆਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ
| ਪਲੇਟਫਾਰਮ | ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦਾ ਆਕਾਰ | ਸਿਧਾਂਤਕ ਡੇਟਾ ਉਪਜ (ਪ੍ਰਤੀ ਸੈੱਲ) | ਸਿੰਗਲ-ਬੇਸ ਸ਼ੁੱਧਤਾ | ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ |
| ਨੈਨੋਪੋਰ | 8Kb, 10kb, 20kb, ਅਲਟਰਾਲੌਂਗ, cDNA-PCR | 70-90Gb/ਸੈੱਲ | 85-92% | ਐਸਵੀ ਕਾਲਿੰਗ, ਡੀ ਨੋਵੋ, ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਕ੍ਰਮ, ਆਈਸੋ-ਸੇਕ, ਜੀਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ, ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਦੀ ਖੋਜ |
ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
● ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਵਾਲੇ ਹਜ਼ਾਰਾਂ ਬੰਦ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟਾਂ ਦੇ ਨਾਲ PacBio ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਪਲੇਟਫਾਰਮ 'ਤੇ 5 ਸਾਲਾਂ ਤੋਂ ਵੱਧ ਦਾ ਅਨੁਭਵ।
● BMKGENE ਦੋਹਰੇ ਪਲੇਟਫਾਰਮ RNA/DNA ਪ੍ਰਮਾਣੀਕਰਣ ਦੇ ਨਾਲ, ਆਕਸਫੋਰਡ ਨੈਨੋਪੋਰ ਦਾ ਇੱਕ ਅਧਿਕਾਰਤ ਭਾਈਵਾਲ ਹੈ।
● ਪੂਰੇ ਸਾਜ਼ੋ-ਸਾਮਾਨ ਅਤੇ ਲੋੜੀਂਦੇ ਕ੍ਰਮ ਥ੍ਰੋਪੁੱਟ ਦੇ ਨਾਲ ਸੀਕਵੈਂਸਰਾਂ ਦੇ ਮੁੱਖ ਧਾਰਾ ਮਾਡਲ ਹਨ।
● ਨੈਨੋਪੋਰ ਪਲੇਟਫਾਰਮ 'ਤੇ ਅਧਾਰਤ, 10 ਤੋਂ ਵੱਧ ਜਾਨਵਰਾਂ ਅਤੇ ਪੌਦਿਆਂ ਦੇ ਡੇਨੋਵੋ ਖੋਜਾਂ ਨੂੰ ਅੰਤਰਰਾਸ਼ਟਰੀ ਪ੍ਰਸਿੱਧ ਰਸਾਲਿਆਂ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ।
ਨਮੂਨਾ ਲੋੜਾਂ
| ਨਮੂਨਾ ਦੀ ਕਿਸਮ | ਦੀ ਰਕਮ | ਇਕਾਗਰਤਾ (ਕੁਬਿਟ ®) | ਵਾਲੀਅਮ | ਸ਼ੁੱਧਤਾ | ਹੋਰ |
| ਜੀਨੋਮਿਕ ਡੀਐਨਏ | ਡਾਟਾ ਦੀ ਲੋੜ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦਾ ਹੈ | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5； 260 nm 'ਤੇ ਸਾਫ਼ ਸਿਖਰ, ਕੋਈ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ | ਇਕਾਗਰਤਾ ਨੂੰ ਕਿਊਬਿਟ ਅਤੇ ਕਿਊਬਿਟ/ਨੈਨੋਪੋਰ ≤ 2 ਦੁਆਰਾ ਮਾਪਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ |
| ਕੁੱਲ RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5；ਕੋਈ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ | RIN ਮੁੱਲ ≥7.5 |
ਸਰਵਿਸ ਵਰਕਫਲੋ
ਨਮੂਨਾ ਦੀ ਤਿਆਰੀ
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਉਸਾਰੀ
ਕ੍ਰਮਬੱਧ
ਡਾਟਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਡੀਐਨਏ ਨਮੂਨੇ ਦਾ ਡੇਟਾ ਗੁਣਵੱਤਾ ਮੁਲਾਂਕਣ
ਸਾਰਣੀ 1. ਸਾਫ਼ ਡੇਟਾ 'ਤੇ ਅੰਕੜੇ।
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 ਹੈ | 15,764 ਹੈ | 23,090 ਹੈ | 143,181 | 9 |
RNA ਨਮੂਨੇ ਦਾ ਡਾਟਾ ਗੁਣਵੱਤਾ ਮੁਲਾਂਕਣ
ਸਾਰਣੀ 1. ਸਾਫ਼ ਡੇਟਾ 'ਤੇ ਅੰਕੜੇ।
| ਫਾਈਲ ਦਾ ਨਾਮ | ਕਲਾਇੰਟ ਆਈ.ਡੀ | ReadNum | BaseNum | N50 | ਮੱਧਮ ਲੰਬਾਈ | ਅਧਿਕਤਮ ਲੰਬਾਈ | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 ਹੈ | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 ਹੈ | Q12 |
ਚਿੱਤਰ 1. ਲੰਬਾਈ ਦੀ ਵੰਡ ਪੜ੍ਹੋ
ਚਿੱਤਰ 2. ਸਾਫ਼ ਡੇਟਾ ਦੀ ਗੁਣਵੱਤਾ ਸਕੋਰ ਦੀ ਵੰਡ
ਚਿੱਤਰ 3. ਸਾਫ਼ ਡੇਟਾ ਦੀ ਲੰਬਾਈ ਅਤੇ ਗੁਣਵੱਤਾ ਸਕੋਰ ਦੀ ਵੰਡ
