ਉਤਪਾਦ

*ਇੱਥੇ ਦਿਖਾਏ ਗਏ ਡੈਮੋ ਨਤੀਜੇ ਸਾਰੇ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੈਕਨੋਲੋਜੀ ਨਾਲ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਜੀਨੋਮ ਤੋਂ ਹਨ

1.LTR ਸੰਮਿਲਿਤ ਕਰਨ ਦੇ ਸਮੇਂ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ: ਚਿੱਤਰ ਨੇ ਹੋਰ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ ਵੇਨਿੰਗ ਰਾਈ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ LTR-RTs ਸੰਮਿਲਨ ਸਮੇਂ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਵਿਲੱਖਣ ਬਿਮੋਡਲ ਵੰਡ ਦਿਖਾਇਆ ਹੈ।ਸਭ ਤੋਂ ਤਾਜ਼ਾ ਸਿਖਰ ਲਗਭਗ 0.5 ਮਿਲੀਅਨ ਸਾਲ ਪਹਿਲਾਂ ਪ੍ਰਗਟ ਹੋਇਆ ਸੀ।

ਲੀ ਗੁਆਂਗ ਐਟ ਅਲ.,ਕੁਦਰਤ ਜੈਨੇਟਿਕਸ, 2021

2. ਚਾਇਓਟ (ਸੇਚਿਅਮ ਐਡਿਊਲ) 'ਤੇ ਫਾਈਲੋਜੀਨੀ ਅਤੇ ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ : ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰ ਵਿੱਚ ਚਾਇਓਟ ਅਤੇ ਹੋਰ 13 ਸੰਬੰਧਿਤ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਕੇ, ਚਾਇਓਟ ਸੱਪ ਲੌਕੀ (ਟ੍ਰਾਈਕੋਸੈਂਥੇਸ ਐਨਗੁਇਨਾ) ਨਾਲ ਸਭ ਤੋਂ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਪਾਇਆ ਗਿਆ।27-45 ਮਿਆ ਦੇ ਆਸਪਾਸ ਚਾਇਓਟ ਸੱਪ ਲੌਕੀ ਤੋਂ ਲਿਆ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ 25±4 ਮਾਈਆ ਵਿੱਚ ਚਾਯੋਟ ਵਿੱਚ ਪੂਰਾ ਜੀਨੋਮ ਡੁਪਲੀਕੇਸ਼ਨ (ਡਬਲਯੂ.ਜੀ.ਡੀ.) ਦੇਖਿਆ ਗਿਆ ਸੀ, ਜੋ ਕਿ ਕੁਕੂਬੀਟਾਸੀ ਵਿੱਚ ਤੀਜੀ ਡਬਲਯੂਜੀਡੀ ਘਟਨਾ ਹੈ।

ਫੂ ਏ ਏਟ ਅਲ.,ਬਾਗਬਾਨੀ ਖੋਜ, 2021

3.ਸਿੰਟੇਨੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਫਲਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਫਾਈਟੋਹਾਰਮੋਨਸ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਕੁਝ ਜੀਨ ਚਯੋਟੇ, ਸੱਪ ਲੌਕੀ ਅਤੇ ਸਕੁਐਸ਼ ਵਿੱਚ ਪਾਏ ਗਏ ਸਨ।ਚਾਇਓਟ ਅਤੇ ਸਕੁਐਸ਼ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਚਾਇਓਟ ਅਤੇ ਸੱਪ ਲੌਕੀ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਨਾਲੋਂ ਥੋੜ੍ਹਾ ਉੱਚਾ ਹੈ।

ਫੂ ਏ ਏਟ ਅਲ.,ਬਾਗਬਾਨੀ ਖੋਜ, 2021

4.ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰ ਦੇ ਵਿਸਥਾਰ ਅਤੇ ਜੀ.ਥੁਰਬੇਰੀ ਅਤੇ ਜੀ.ਡੇਵਿਡਸੋਨੀ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਸੰਕੁਚਨ 'ਤੇ ਕੇਈਜੀਜੀ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਨੇ ਦਿਖਾਇਆ ਕਿ ਸਟੀਰੌਇਡ ਬਾਇਓਸਿੰਥੇਸਿਸ ਅਤੇ ਬ੍ਰੈਸੀਨੋਸਟੀਰੋਇਡ ਬਾਇਓਸਿੰਥੇਸਿਸ ਸੰਬੰਧਿਤ ਜੀਨਾਂ ਦਾ ਵਿਸਤਾਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।

ਯਾਂਗ ਜ਼ੈਡ ਐਟ ਅਲ.,BMC ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ, 2021

5. ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਡੁਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: 4DTV ਅਤੇ Ks ਵੰਡ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਪੂਰੀ ਜੀਨੋਮ ਡੁਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਘਟਨਾ ਨੂੰ ਦਿਖਾਇਆ।ਅੰਤਰਜਾਤੀ ਦੀਆਂ ਸਿਖਰਾਂ ਨੇ ਨਕਲ ਦੀਆਂ ਘਟਨਾਵਾਂ ਦਿਖਾਈਆਂ।ਅੰਤਰ-ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੀਆਂ ਸਿਖਰਾਂ ਨੇ ਪ੍ਰਜਾਤੀ ਦੀਆਂ ਘਟਨਾਵਾਂ ਦਿਖਾਈਆਂ।ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਸੰਕੇਤ ਦਿੱਤਾ ਹੈ ਕਿ ਹੋਰ ਤਿੰਨ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸੰਬੰਧਿਤ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਨਾਲ ਤੁਲਨਾ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਓ. ਯੂਰੋਪੀਆ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਜੀਨ ਡੁਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚੋਂ ਲੰਘਿਆ ਹੈ।

ਰਾਓ ਜੀ ਐਟ ਅਲ.,ਬਾਗਬਾਨੀ ਖੋਜ, 2021

BMK ਕੇਸ

ਚੁੰਧਿਆ ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ ਗੁਲਾਬ: ਜੀਨੋਮਿਕ ਇਨਸਾਈਟਸ ਨਮੀ ਦੇ ਅਨੁਕੂਲਨ ਨਾਲ ਜੁੜੀਆਂ ਹੋਈਆਂ ਹਨ

ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ: ਰਾਸ਼ਟਰੀ ਵਿਗਿਆਨ ਸਮੀਖਿਆ, 2021

ਲੜੀਬੱਧ ਰਣਨੀਤੀ:

'ਬੱਸੀ ਦਾਕੰਡੇ ਰਹਿਤ' (ਆਰ.ਵਿਚੁਰੈਣਨ) ਜੀਨੋਮ:
ਲਗਭਗ.93 X PacBio + ਲਗਭਗ.90 X ਨੈਨੋਪੋਰ + 267 X ਇਲੂਮਿਨਾ

ਮੁੱਖ ਨਤੀਜੇ

1. ਉੱਚ ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਾਲੇ R.wichuraiana ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਨਿਰਮਾਣ ਲੰਬੀ-ਪੜ੍ਹੀ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਜੋ ਕਿ 530.07 Mb ਦੀ ਅਸੈਂਬਲੀ ਪੈਦਾ ਕਰਦੀ ਹੈ (ਅੰਦਾਜਨ ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਆਕਾਰ ਫਲੋ ਸਾਇਟੋਮੈਟਰੀ ਦੁਆਰਾ ਲਗਭਗ 525.9 Mb ਅਤੇ ਜੀਨੋਮ ਸਰਵੇਖਣ ਦੁਆਰਾ 525.5 ਸੀ) ਲਗਭਗ 3% ਹੈਟਰੋਜ਼ਾਈ ਸੀ।BUSCO ਅਨੁਮਾਨਿਤ ਸਕੋਰ 93.9% ਸੀ।"ਓਲਡ ਬਲੱਸ਼" (ਹੈਪਲੋਓਬੀ) ਨਾਲ ਤੁਲਨਾ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਇਸ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਗੁਣਵੱਤਾ ਅਤੇ ਸੰਪੂਰਨਤਾ ਦੀ ਬੇਸ ਸਿੰਗਲ-ਬੇਸ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਅਤੇ LTR ਅਸੈਂਬਲੀ ਇੰਡੈਕਸ (LAI=20.03) ਦੁਆਰਾ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ।R.wichuraiana ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ 32,674 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਕੋਡਿੰਗ ਜੀਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।

2. ਮਲਟੀ-ਓਮਿਕਸ ਸੰਯੁਕਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੀਨੋਮਿਕਸ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ, ਜੈਨੇਟਿਕ ਆਬਾਦੀ ਦਾ QTL ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ, ਨੇ ਆਰ. ਵਿਚੁਰਾਈਆਨਾ ਅਤੇ ਰੋਜ਼ਾ ਚਿਨੇਨਸਿਸ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦਾ ਖੁਲਾਸਾ ਕੀਤਾ।ਨਾਲ ਹੀ, QTL ਵਿੱਚ ਸੰਬੰਧਿਤ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਸਮੀਕਰਨ ਪਰਿਵਰਤਨ ਸਟੈਮ ਪ੍ਰਿਕਲ ਪੈਟਰਨਿੰਗ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਣ ਦੀ ਸੰਭਾਵਨਾ ਸੀ।

ਬਾਸੀ ਦੇ ਥੌਰਨਲੈੱਸ ਅਤੇ ਰੋਜ਼ਾ ਚਾਈਨੇਸਿਸ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਸਿੰਟੇਨੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਜੀਨ ਫੈਮਿਲੀ ਕਲੱਸਟਰ, ਵਿਸਤਾਰ ਅਤੇ ਸੰਕੁਚਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਨੇ ਵੱਡੀ ਗਿਣਤੀ ਵਿੱਚ ਭਿੰਨਤਾਵਾਂ ਦਾ ਖੁਲਾਸਾ ਕੀਤਾ, ਜੋ ਗੁਲਾਬ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਣ ਗੁਣਾਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ।NAC ਅਤੇ FAR1/FRS ਜੀਨ ਪਰਿਵਾਰ ਵਿੱਚ ਵਿਲੱਖਣ ਪਸਾਰ ਬਲੈਕ ਸਪਾਟ ਦੇ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਣ ਦੀ ਬਹੁਤ ਸੰਭਾਵਨਾ ਸੀ।

Zhong, M. , et al."ਚਿੰਨੇ ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ ਗੁਲਾਬ: ਨਮੀ ਦੇ ਅਨੁਕੂਲਨ ਨਾਲ ਜੁੜੀਆਂ ਜੀਨੋਮਿਕ ਸੂਝ"ਰਾਸ਼ਟਰੀ ਵਿਗਿਆਨ ਸਮੀਖਿਆ, 2021;, nwab092.