ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପଟୋମ୍ କ୍ରମ - ଇଲୁମିନା |
ସେବା ସୁବିଧା
Øଗଣନା, ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ଏବଂ କ୍ରୋମୋଜୋମ-ଆଧାରିତ ଆପେକ୍ଷିକ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ଦୃଷ୍ଟିରୁ ସମସ୍ତ ପ୍ରକାରର RNA ଉପରେ ଆକଳନ |
Øଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ RNA ଗୁଡ଼ିକର ଚିହ୍ନଟ ଏବଂ ଅନୁରୂପ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି |
Øଜିନ୍ ସହ-ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ବିଶ୍ଳେଷଣ |
ØceRNA ନେଟୱର୍କ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
Øମୁଖ୍ୟ ଜିନ୍ ଗୁଡିକ ପଥ ବିଶ୍ଳେଷଣ ସହିତ ଜଡିତ |
ØBMKCloud- ଆଧାରିତ ଫଳାଫଳ ବିତରଣ: ପ୍ଲାଟଫର୍ମରେ କଷ୍ଟୋମାଇଜଡ୍ ଡାଟା-ଖଣି ଉପଲବ୍ଧ |
Øପ୍ରୋଜେକ୍ଟ ସମାପ୍ତ ହେବା ପରେ 3 ମାସ ପାଇଁ ବିକ୍ରୟ ପରେ ସେବା ବ valid ଧ |
ନମୁନା ଆବଶ୍ୟକତା ଏବଂ ବିତରଣ |
ନମୁନା ଆବଶ୍ୟକତା:
ନ୍ୟୁକ୍ଲିଓଟାଇଡ୍:
| ଶୁଦ୍ଧତା | ଅଖଣ୍ଡତା | ପ୍ରଦୂଷଣ | ପରିମାଣ |
| OD260 / 280≥1.7-2.5 ； OD260 / 230≥0.5-2.5 ； | ଉଦ୍ଭିଦ ପାଇଁ: RIN≥6.5;ପଶୁମାନଙ୍କ ପାଇଁ: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;ସୀମିତ କିମ୍ବା କ bas ଣସି ବେସ୍ ଲାଇନ୍ ଉଚ୍ଚତା ନାହିଁ | | ଜେଲରେ ସୀମିତ କିମ୍ବା କ protein ଣସି ପ୍ରୋଟିନ୍ କିମ୍ବା DNA ପ୍ରଦୂଷଣ ଦେଖାଯାଏ ନାହିଁ | | କନକ୍।≥100 ng / μl;ଭଲ୍ୟୁମ୍ ≥ 10 μl;ସମୁଦାୟ ≥ 2 μg |
ଟିସୁ: ଓଜନ (ଶୁଖିଲା): ≥1 ଗ୍ରାମ |
* 5 ମିଗ୍ରା ରୁ କମ୍ ଟିସୁ ପାଇଁ, ଆମେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ (ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ) ଟିସୁ ନମୁନା ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |
ସେଲ୍ ନିଲମ୍ବନ: ସେଲ୍ ଗଣନା = 3 × 107 |
* ଆମେ ଫ୍ରିଜ୍ ହୋଇଥିବା ସେଲ୍ ଲାଇସେଟ୍ ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |ଯଦି ସେହି ସେଲ୍ 5 × 105 ରୁ କମ୍ ଗଣନା କରେ, ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ କରିବାକୁ ପରାମର୍ଶ ଦିଆଯାଏ |
ରକ୍ତ ନମୁନା:
PA × geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ଏବଂ 2mL ରକ୍ତ (TRIzol: ରକ୍ତ = 3: 1)
ସୁପାରିଶ କରାଯାଇଥିବା ନମୁନା ବିତରଣ |
ଧାରଣକାରୀ:
2 ମିଲି ସେଣ୍ଟ୍ରିଫ୍ୟୁଜ୍ ଟ୍ୟୁବ୍ (ଟିଫିନ୍ ଫଏଲ୍ ସୁପାରିଶ କରାଯାଏ ନାହିଁ)
ନମୁନା ଲେବେଲିଂ: ଗୋଷ୍ଠୀ + ନକଲ ଯଥା A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
ପଠାଇବା:
1. ଶୁଖିଲା ବରଫ: ନମୁନାଗୁଡ଼ିକୁ ବ୍ୟାଗରେ ପ୍ୟାକ୍ କରି ଶୁଖିଲା ବରଫରେ ପୋତି ଦିଆଯିବା ଆବଶ୍ୟକ |
2. ଆରଏନ୍ଏଷ୍ଟେବଲ୍ ଟ୍ୟୁବ୍: RNA ନମୁନାଗୁଡିକ RNA ସ୍ଥିରତା ଟ୍ୟୁବରେ ଶୁଖାଯାଇପାରିବ (ଯଥା RNAstable®) ଏବଂ କୋଠରୀ ତାପମାତ୍ରାରେ ପଠାଯାଇପାରିବ |
ସେବା କାର୍ଯ୍ୟ ପ୍ରବାହ |
ପରୀକ୍ଷଣ ଡିଜାଇନ୍ |
ନମୁନା ବିତରଣ |
RNA ନିଷ୍କାସନ |
ଲାଇବ୍ରେରୀ ନିର୍ମାଣ
କ୍ରମ
ତଥ୍ୟ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
ବିକ୍ରୟ ପରେ ସେବା |
ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ |
 |
1. ସମସ୍ତ ପ୍ରକାରର RNA ଉପରେ ଆପେକ୍ଷିକ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ଉପରେ ଆକଳନ |
RNA ଅଭିବ୍ୟକ୍ତିର ପାର୍ଥକ୍ୟର ମହତ୍ତ୍ on ଉପରେ ସର୍କସ୍ |
2. ଇଣ୍ଟିଗ୍ରେଟେଡ୍ KEGG ପାଥୱେ ନେଟୱାର୍କ |
ଇଣ୍ଟିଗ୍ରେଟେଡ୍ KEGG ପାଥୱେ ନେଟୱାର୍କ |
3.ceRNA ନେଟୱର୍କ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
ceRNA ନେଟୱାର୍କ-ଆଧାରିତ DE-circRNA-miRNA-mRNA ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା |
BMK କେସ୍ |
ସର୍କର୍ଏନ୍ଏ ଏକ୍ସପ୍ରେସନ୍ ପାଟର୍ନ ଏବଂ ceRNA ଏବଂ miRNA - mRNA ନେଟୱାର୍କଗୁଡ଼ିକ ବ୍ରାସିକା କ୍ୟାମ୍ପେଷ୍ଟ୍ରିସର CMS ଲାଇନରେ ଆନ୍ଥର୍ ଡେଭଲପମେଣ୍ଟରେ ଜଡିତ |
ପ୍ରକାଶିତ:ଆନ୍ତର୍ଜାତୀୟ ଜର୍ଣ୍ଣାଲ୍ ଅଫ୍ ମଲିକୁଲାର ସାଇନ୍ସ ，2019
ଏକ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ଭାଇରାଲ୍ ସଂକ୍ରମଣର 6 ଦିନରେ NONMMUT015812-knockdown KP (shRNA-2) କୋଷ ଏବଂ ନକାରାତ୍ମକ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ (sh-Scr) କୋଷଗୁଡ଼ିକ ମିଳିଲା |
ମୁଖ୍ୟ ଫଳାଫଳଗୁଡିକ
ଏହି ଅଧ୍ୟୟନରେ ବ୍ରାସିକା କ୍ୟାମ୍ପେଷ୍ଟ୍ରିସ୍ L. ssp ରେ ପଲିମା ସାଇଟୋପ୍ଲାଜ୍ ପୁରୁଷ ବନ୍ଧ୍ୟାକରଣ (CMS) ରେଖା “Bcpol97-05A” ଏବଂ ଉର୍ବର ରେଖା “Bcajh97-01B” ପ୍ରତିଷ୍ଠା କରାଯାଇଥିଲା |ଚିନ୍ନାସିସ୍ ମାକିନୋ, ସିନ |B. rapa sspଚିନ୍ନାସିସ୍, ଏବଂ RNA ଏକ୍ସପ୍ରେସନ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ତୁଳନାତ୍ମକ ଷ୍ଟେରିଲ୍ ଲାଇନ୍ ଏବଂ ଉର୍ବର ଲାଇନ ମଧ୍ୟରେ ପୁରା ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପଟୋମ୍ କ୍ରମ ଦ୍ୱାରା ତୁଳନାତ୍ମକ କାର୍ଯ୍ୟ କରିଥାଏ |
1. ସମୁଦାୟ 31 ଟି ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ (DE) ସର୍କର୍ଏନ୍ଏସ୍, 47 DE miRNA ଏବଂ 4779 DE mRNA ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଇଥିଲା |
2. ଜିନ୍ ଅଣ୍ଟୋଲୋଜି (GO) ବିଶ୍ଳେଷଣ ଦର୍ଶାଇଲା ଯେ ଅଧିକାଂଶ DE ଜିନ୍ ପଲିଥିନ କାନ୍ଥ ବିକାଶରେ ଜଡିତ ଥିଲେ |
3. DE mRNA ଗୁଡ଼ିକର KEGG ପଥ ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣ (ଉର୍ବର ରେଖା ତୁଳନାରେ ଷ୍ଟେରାଇଲ୍ ଲାଇନ୍ରେ ଅପ୍-ରେଗୁଲେଡ୍ ଏବଂ ଡାଉନ୍-ରେଗୁଲେଟେଡ୍ mRNA ଅନ୍ତର୍ଭୂକ୍ତ କରି) ଦର୍ଶାଇଲା ଯେ “ଷ୍ଟାର୍ ଏବଂ ସୁକ୍ରୋସେମେଟାବୋଲିଜିମ୍”, “ଫେନିଲପ୍ରୋପାନଏଡ୍ ବାୟୋସାଇନ୍ଥେସିସ୍” ଏବଂ “ପେଣ୍ଟୋଜ ଏବଂ ଗ୍ଲୁକୁରୋନେଟ୍ ଇଣ୍ଟରକନଭର୍ସନ୍” | ”ଅଧିକ ସମୃଦ୍ଧ ମେଟାବୋଲିକ୍ ପଥଗୁଡିକ |
 ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ mRNA ଗୁଡ଼ିକର KEGG ପଥ ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣ | |  ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ mRNA ଗୁଡ଼ିକର ଜିନ୍ ଅନଟୋଲୋଜି (GO) ବର୍ଗୀକରଣ | |  DEcircRNA - DEmiRNA - DEmRNA ଟ୍ରିପଲ୍ ନେଟୱାର୍କର ଦୃଶ୍ୟ | |
ସନ୍ଦର୍ଭ
ଲିଆଙ୍ଗ୍ ୟ, ୱାଙ୍ଗ୍ ୟ, ଜୁ ଏଲ୍, ଇତ୍ୟାଦି |ସର୍କର୍ଏନ୍ଏ ଏକ୍ସପ୍ରେସନ୍ ପାଟର୍ନ ଏବଂ ceRNA ଏବଂ miRNA - mRNA ନେଟୱାର୍କଗୁଡ଼ିକ ବ୍ରାସିକା କ୍ୟାମ୍ପେଷ୍ଟ୍ରିସ୍ ର CMS ଲାଇନରେ ଆନ୍ଥର୍ ଡେଭଲପମେଣ୍ଟରେ ଜଡିତ |ଆନ୍ତର୍ଜାତୀୟ ଜର୍ଣ୍ଣାଲ୍ ଅଫ୍ ମଲିକୁଲାର ସାଇନ୍ସ, 2019, 20 (19): 4808- |DOI ： 10.3390 / ijms20194808 |
