Øନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ RNA ପାଇବାକୁ U ପାଇଁ 5 'ଶେଷରେ ପ୍ରଥମ ଆଧାରର ଏକ ଦୃ strong ପସନ୍ଦ ଅଛି |
ØmiRNA ଲକ୍ଷ୍ୟ ଜିନ୍ ଭବିଷ୍ୟବାଣୀ |
ØMRNA ସହିତ ମିଳିତ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିବାକୁ ଡାଟା ବ୍ୟବହୃତ ହୁଏ |
ØmiRNA ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି |
ØmiRNA ଲକ୍ଷ୍ୟ ଜିନ୍ ଭବିଷ୍ୟବାଣୀ |
ØBMKCloud- ଆଧାରିତ ଫଳାଫଳ ବିତରଣ: ପ୍ଲାଟଫର୍ମରେ କଷ୍ଟୋମାଇଜଡ୍ ଡାଟା-ଖଣି ଉପଲବ୍ଧ |
Øପ୍ରୋଜେକ୍ଟ ସମାପ୍ତ ହେବା ପରେ 3 ମାସ ପାଇଁ ବିକ୍ରୟ ପରେ ସେବା ବ valid ଧ |
ନ୍ୟୁକ୍ଲିଓଟାଇଡ୍:
ଶୁଦ୍ଧତା | ଅଖଣ୍ଡତା | ପ୍ରଦୂଷଣ | ପରିମାଣ |
OD260 / 280≥1.7-2.5 ; OD260 / 230≥0.5-2.5 ; | ଉଦ୍ଭିଦ ପାଇଁ: RIN≥6.5;ପଶୁମାନଙ୍କ ପାଇଁ: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;ସୀମିତ କିମ୍ବା କ bas ଣସି ବେସ୍ ଲାଇନ୍ ଉଚ୍ଚତା ନାହିଁ | | ଜେଲରେ ସୀମିତ କିମ୍ବା କ protein ଣସି ପ୍ରୋଟିନ୍ କିମ୍ବା DNA ପ୍ରଦୂଷଣ ଦେଖାଯାଏ ନାହିଁ | | କନକ୍।≥300 ng / μl;ଭଲ୍ୟୁମ୍ ≥ 10 μl;ମୋଟ ≥ 3 μg |
ଟିସୁ: ଓଜନ (ଶୁଖିଲା): ≥1 ଗ୍ରାମ |
* 5 ମିଗ୍ରା ରୁ କମ୍ ଟିସୁ ପାଇଁ, ଆମେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ (ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ) ଟିସୁ ନମୁନା ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |
ସେଲ୍ ନିଲମ୍ବନ: ସେଲ୍ ଗଣନା = 3 × 10 |7
* ଆମେ ଫ୍ରିଜ୍ ହୋଇଥିବା ସେଲ୍ ଲାଇସେଟ୍ ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |ଯଦି ସେହି ସେଲ୍ 5 × 10 ରୁ ଛୋଟ ଗଣନା କରେ |5, ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ ସୁପାରିଶ କରାଯାଏ |
ରକ୍ତ ନମୁନା:
PA × geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ଏବଂ 2mL ରକ୍ତ (TRIzol: ରକ୍ତ = 3: 1)
ଧାରଣକାରୀ:
2 ମିଲି ସେଣ୍ଟ୍ରିଫ୍ୟୁଜ୍ ଟ୍ୟୁବ୍ (ଟିଫିନ୍ ଫଏଲ୍ ସୁପାରିଶ କରାଯାଏ ନାହିଁ)
ନମୁନା ଲେବେଲିଂ: ଗୋଷ୍ଠୀ + ନକଲ ଯଥା A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
ପଠାଇବା:
1. ଶୁଖିଲା ବରଫ: ନମୁନାଗୁଡ଼ିକୁ ବ୍ୟାଗରେ ପ୍ୟାକ୍ କରି ଶୁଖିଲା ବରଫରେ ପୋତି ଦିଆଯିବା ଆବଶ୍ୟକ |
2. ଆରଏନ୍ଏଷ୍ଟେବଲ୍ ଟ୍ୟୁବ୍: RNA ନମୁନାଗୁଡିକ RNA ସ୍ଥିରତା ଟ୍ୟୁବରେ ଶୁଖାଯାଇପାରିବ (ଯଥା RNAstable®) ଏବଂ କୋଠରୀ ତାପମାତ୍ରାରେ ପଠାଯାଇପାରିବ |
ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ |
1.miRNA ପରିଚୟ
MiRDeep2 ଦ୍ୱାରା ପୂର୍ବାନୁମାନ କରାଯାଇଥିବା ଉପନ୍ୟାସ miRNA ଗୁଡ଼ିକର ପ୍ରତ୍ୟେକ ପ୍ରାର୍ଥୀ ଏହାର ସଂରଚନା ଏବଂ କ୍ରମର ଗଭୀରତା ଦେଖାଉଥିବା ଏକ pdf ଚିତ୍ର ଅଛି |
miRNA ପୂର୍ବବର୍ତ୍ତୀ ଗଠନ ଏବଂ କ୍ରମର ଗଭୀରତା |
2. DE-miRNA ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ର KEGG ସମୃଦ୍ଧ |
ଏହି ଅଧିବେଶନରେ, ବାୟୋମାର୍କର୍ ପ୍ରଥମେ DE-miRNA ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ସହିତ ପଥଗୁଡିକ ଅତ୍ୟଧିକ ଉପସ୍ଥାପନା ହୋଇଛି କି ନାହିଁ ପରୀକ୍ଷା କରିଥିଲେ |ସମୃଦ୍ଧତା ଡିଗ୍ରୀ ଏବଂ ପଥର ମହତ୍ତ୍ୱ ନିର୍ଣ୍ଣୟରେ ସମୃଦ୍ଧ କାରକ ଏବଂ ମତ୍ସ୍ୟ ପରୀକ୍ଷା ପ୍ରୟୋଗ କରାଯାଇଥିଲା |ସମୃଦ୍ଧ ଗଣନର ସମୀକରଣ ନିମ୍ନରେ ଦର୍ଶାଯାଇଛି |
DE-miRNA ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ଉପରେ KEGG ପଥ ସମୃଦ୍ଧ |
3. DE-miRNA ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ଉପରେ GO ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
DE-miRNA ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ଉପରେ GO ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣରେ କ୍ଲଷ୍ଟର ପ୍ରୋଫାଇଲର୍ ନିୟୋଜିତ ହୋଇଥିଲା |ଶବ୍ଦଗୁଡ଼ିକର କ୍ରମବିକାଶ ଗଠନ ଦେଖାଇବା ପାଇଁ ସମୃଦ୍ଧ ଶବ୍ଦଗୁଡ଼ିକର ନିର୍ଦ୍ଦେଶିତ ଆକାଇକ୍ଲିକ୍ ଗ୍ରାଫ୍ ସୃଷ୍ଟି ହେଲା |ଚିତ୍ରରେ, ବାଣର ଦିଗ ଶବ୍ଦଗୁଡ଼ିକ ମଧ୍ୟରେ ଅନ୍ତର୍ଭୂକ୍ତ ସମ୍ପର୍କକୁ ପ୍ରତିପାଦିତ କରେ, ଅର୍ଥାତ୍ ନୋଡଗୁଡ଼ିକ ସେମାନଙ୍କର ଉପର ନୋଡ ଅପେକ୍ଷା ଅଧିକ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ |DE-miRNA ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ଗୁଡିକର ନିର୍ଦ୍ଦେଶିତ ଏସିଲିକ୍ ଗ୍ରାଫ୍ ନିମ୍ନ ଚିତ୍ରରେ ଦର୍ଶାଯାଇଥିଲା |
DEG-miRNA ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ଗୁଡିକର TopGO ନିର୍ଦ୍ଦେଶିତ ଆକାଇକ୍ଲିକ୍ ଗ୍ରାଫ୍ |
BMK କେସ୍ |
ମାଂସ ଗୁଣବତ୍ତା ସହିତ ଜଡିତ MiRNA ଏବଂ ଜିନଗୁଡିକର ଏକୀକୃତ ବିଶ୍ଳେଷଣ ପ୍ରକାଶ କରେ ଯେ Gga-MiR-140-5p କୁକୁଡ଼ାମାନଙ୍କରେ ଇଣ୍ଟ୍ରାମୁସ୍କୁଲାର ଫ୍ୟାଟ୍ ଡିପୋଜିସନ ଉପରେ ପ୍ରଭାବ ପକାଇଥାଏ |
ପ୍ରକାଶିତ:ସେଲ୍ୟୁଲାର୍ ଫିଜିଓଲୋଜି ଏବଂ ବାୟୋକେମିଷ୍ଟ୍ରି ,2018
ମୁଖ୍ୟ ଫଳାଫଳଗୁଡିକ
ବିଳମ୍ବିତ ଅବସ୍ଥାରେ ଥିବା କୁକୁଡ଼ାମାନେ ନାବାଳିକା କୁକୁଡ଼ା ଅପେକ୍ଷା miRNA ର ନିମ୍ନ ବିଶ୍ global ସ୍ତରୀୟ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ସ୍ତର ପ୍ରଦର୍ଶନ କରିଥିଲେ |
MirNA-mrna ର ଏକ ନିୟାମକ ନେଟୱାର୍କ ଯାହା ମାଂସ ଗୁଣ ଉପରେ ପ୍ରଭାବ ପକାଇପାରେ |
gga-miR-140-5p RXRG କୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରି ଆଡିପୋସାଇଟ୍ ଭିନ୍ନତାକୁ ପ୍ରୋତ୍ସାହିତ କରେ |
gga-miR-140-5p RXRG ର 3'UTR କୁ ଟାର୍ଗେଟ୍ କରି ଚିକେନ୍ ଇନଷ୍ଟ୍ରାମୁସ୍କୁଲ୍ ପ୍ରିଡିପୋସାଇଟ୍ ଭିନ୍ନତାକୁ ପ୍ରୋତ୍ସାହିତ କରେ | |
ସନ୍ଦର୍ଭ
Zhang ାଙ୍ଗ୍ ଏମ୍, ଲି ଡିଏଚ୍, ଲି ଏଫ୍, ଇତ୍ୟାଦି |ମାଂସ ଗୁଣବତ୍ତା ସହିତ ଜଡିତ MiRNA ଏବଂ ଜିନଗୁଡିକର ଇଣ୍ଟିଗ୍ରେଟେଡ୍ ଆନାଲିସିସ୍ ପ୍ରକାଶ କରେ ଯେ Gga-MiR-140-5p କୁକୁଡ଼ାମାନଙ୍କରେ ଇଣ୍ଟ୍ରାମୁସ୍କୁଲାର ଫ୍ୟାଟ୍ ଡିପୋଜିସନ୍ ଉପରେ ପ୍ରଭାବ ପକାଇଥାଏ |ସେଲୁଲାର୍ ଫିଜିଓଲୋଜି ଏବଂ ବାୟୋକେମିଷ୍ଟ୍ରି, 2018: 2421-2433 |DOI : 10.1159 / 000489649