GWAS
ଆଖ୍ୟା: ସମ୍ପୁର୍ଣ୍ଣ-ଜିନୋମ ପୁନ res ସଂରକ୍ଷଣ ବ୍ରାସିକା ନାପସ୍ ଉତ୍ପତ୍ତି ଏବଂ ଏହାର ଉନ୍ନତିରେ ଜଡିତ ଜେନେଟିକ୍ ଲୋକି ପ୍ରକାଶ କରେ |
ପତ୍ରିକା: ପ୍ରକୃତି ଯୋଗାଯୋଗ |
NGS |WGS |ଅନୁସନ୍ଧାନ |GWAS |ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପଟୋମ୍ |RNAseq |ବ୍ରାସିକା ନାପସ୍ |ବିବର୍ତ୍ତନ |ଘରୋଇକରଣ
ଏହି ଅଧ୍ୟୟନରେ, ବାୟୋମାର୍କର ଟେକ୍ନୋଲୋଜିଗୁଡିକ NGS କ୍ରମରେ ସେବା ପ୍ରଦାନ କରିବା ସହିତ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ତଥ୍ୟ ଉପରେ ବାୟୋ ଇନଫର୍ମାଟିକ୍ସ ବିଶ୍ଳେଷଣ ଉପରେ ବ technical ଷୟିକ ସହାୟତା ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ |
ପୃଷ୍ଠଭୂମି
ବ୍ରାସିକା ନାପସ୍ |(ବଳାତ୍କାର) ଏକ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ତ oil ଳବୀଜ ଫସଲ ଏବଂ ପଲିପ୍ଲଏଡ୍ ସ୍ପେସିଫିକେସନ୍, ବିବର୍ତ୍ତନ ଏବଂ ଚୟନ ପ୍ରକ୍ରିୟାର ଅନୁସନ୍ଧାନ ପାଇଁ ଏକ ଉତ୍କୃଷ୍ଟ ମଡେଲ୍ |ଅବଶ୍ୟ, ବଣୁଆ ପ୍ରଜାତି କିମ୍ବା ଗୃହପାଳିତ ଦାତାମାନେ ପିତାମାତାଙ୍କ ବଂଶଧର ଅଟନ୍ତି ଏବଂ ଜିନ୍ ଯାହା ଘରୋଇକରଣ ଏବଂ ବଳାତ୍କାରରେ ଉନ୍ନତି ଆଣିବାରେ ସହାୟକ ହୋଇଥିଲା ତାହା ଏପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ଜଣା ପଡିନାହିଁ |
ଜିନିଷ ଓ ପ୍ରଣାଳୀ
ସାମଗ୍ରୀ:588B. napusଏହି ଅଧ୍ୟୟନରେ ଆକ୍ସେସନ୍ସ 466, ୟୁରୋପରୁ 102, ଉତ୍ତର ଆମେରିକାରୁ 13 ଏବଂ ଅଷ୍ଟ୍ରେଲିଆରୁ 7 ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ |ଅଭିବୃଦ୍ଧି ଅଭ୍ୟାସ ରେକର୍ଡ ଉପରେ ଆଧାର କରି, ଏହି ସାମଗ୍ରୀଗୁଡ଼ିକୁ ତିନୋଟି ଇକୋଟାଇପ୍ ରେ ବିଭକ୍ତ କରାଯାଇଥିଲା;ବସନ୍ତ (86 ଆକ୍ସେସନ୍), ଶୀତ (74 ଆକ୍ସେସନ୍), ଏବଂ ଅର୍ଦ୍ଧ-ଶୀତ (428 ଆକ୍ସେସନ୍) |
କ୍ରମ:ହାରାହାରି ପାଖାପାଖି |5 × (3.37 × ରୁ 7.71 × ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ)
ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ପ୍ଲାଟଫର୍ମ:ଇଲୁମିନା ହିସେକ୍ 4000 |
ତଥ୍ୟ ଉତ୍ପାଦନ:4.03 Tb ସଫା ତଥ୍ୟ |
SNP କଲିଂ:BWA + GATK |5,294,158 SNPs ଏବଂ 1,307,151 InDels ପ୍ରାପ୍ତ ହେଲା |
ଫଳାଫଳ
B. napus ର ଉତ୍ପତ୍ତି |
B. napusଇଉରୋପୀୟ ଶାଗୁଣାର ପୂର୍ବଜଙ୍କଠାରୁ ଏକ ସବଜେନୋମ୍ ବିକଶିତ ହେଲା |ୟୁରୋପୀୟ ଟର୍ନିପରୁ ଏକ ଜିନ୍ ଫ୍ଲୋ ଇଭେଣ୍ଟ |B. napus ଏକ ସବଜେନୋମ୍ ~ 106–1170 ବର୍ଷ ପୂର୍ବେ ଘଟିଥିଲା |B. napusସି ସବଜେନୋମ୍ ହୁଏତ ଏହି ବଂଶର ସାଧାରଣ ପିତୃପୁରୁଷଙ୍କଠାରୁ ବିକଶିତ ହୋଇଥାଇପାରେ |ର ପୂର୍ବପୁରୁଷB. napusସାମ୍ପ୍ରତିକ ଜିନ୍ ପ୍ରବାହ ସହିତ ଚାରୋଟି ବିB. napus~ 108–898 ବର୍ଷ ପୂର୍ବେ |B. napusଏକ ସବଜେନୋମ ଅପେକ୍ଷା ସି ସବଜେନୋମର ଏକ ଜଟିଳ ଉତ୍ପତ୍ତି ଅଛି |ଉଭୟ ଦୁଇଟି ସବଜେନୋମରେ ଏକ ଶକ୍ତିଶାଳୀ ବୋତଲ ବିକଶିତ ହେଲା |B. napusବିବର୍ତ୍ତନଶୀତ ଏବଂ ଅର୍ଦ୍ଧ-ଶୀତ |B. napusଇକୋଟାଇପ୍ ~ 60 ବର୍ଷ ପୂର୍ବେ ବିଭକ୍ତ ହୋଇଥିଲାବେଳେ ଶୀତ ଏବଂ ବସନ୍ତ |B. napus~ 416 ବର୍ଷ ପୂର୍ବେ ବିଭକ୍ତ, ଏବଂ ତେଲ ବିହନ ଏବଂ ଅଣ-ତେଲ ବିହନ |B. napus7 277 ବର୍ଷ ପୂର୍ବେ ବିଭକ୍ତ |
ଚିତ୍ର 2 588 ବି ନାପସ୍ ଆକ୍ସେସନ୍ସ ଏବଂ 199 ର B. ରାପା ଆକ୍ସେସନ୍ସର ଜନସଂଖ୍ୟା ଗଠନ |
ଚିତ୍ର 3 588 B. napus ଆକ୍ସେସନ୍ସ ଏବଂ B. oleracea ଆକ୍ସେସନ୍ସର ଜନସଂଖ୍ୟା structure ାଞ୍ଚା |
ଚୟନ ସଙ୍କେତ ଏବଂ ଜେନୋମ-ୱାଇଡ୍ ଆସୋସିଏସନ୍ ଅଧ୍ୟୟନ |
ଉନ୍ନତିର ପ୍ରଥମ ପର୍ଯ୍ୟାୟରେ (FSI), ଏ ସବଜେନୋମ ଅପେକ୍ଷା ବି ନାପସ ସି ସବଜେନୋମରେ ଅଧିକ ଜେନେଟିକ ବିବିଧତା ନଷ୍ଟ ହୋଇଗଲା |ଉନ୍ନତିର ଦ୍ୱିତୀୟ ପର୍ଯ୍ୟାୟ ଅପେକ୍ଷା FSI ସମୟରେ କମ୍ ଜେନେଟିକ୍ ଭିନ୍ନତା ଘଟିଥିଲା |ଚାପ ସହନଶୀଳତା, ବିକାଶ ଏବଂ ମେଟାବୋଲିକ୍ ପଥରେ SSI- ଚୟନ ସଙ୍କେତ ଅଞ୍ଚଳରେ ଜିନ୍ଗୁଡ଼ିକ ସମୃଦ୍ଧ ହୋଇଥିଲା |60 ଟି ଲୋକି 10 ଟି ଟାର୍ଗେଟ୍ ଗୁଣ ସହିତ ଗୁରୁତ୍ associated ପୂର୍ଣ ଭାବରେ ଜଡିତ, ସେଥିମଧ୍ୟରେ 5 ଟି ବିହନ ଅମଳ ସହିତ ଜଡିତ, 3 ରୁ ସିଲିକ୍ ଲମ୍ବ, 4 ଟି ତେଲ ବିଷୟବସ୍ତୁ ଏବଂ 48 ରୁ ବିହନ ଗୁଣ ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଇଥିଲା |
ଚିତ୍ର 4 B. napus ର SSI ସମୟରେ ମନୋନୀତ ଅଞ୍ଚଳଗୁଡିକର ଜେନୋମ-ୱାଇଡ୍ ସ୍କାନିଂ ଏବଂ ଟିପ୍ପଣୀ |
ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପଟୋମ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
ଏକ ଉଚ୍ଚ-ତ oil ଳ-ବିଷୟବସ୍ତୁ ଏବଂ ଦ୍ୱି-ନିମ୍ନ ଚାଷରୁ 11 ଟି ଟିସୁର RNAseq ତଥ୍ୟ ଏବଂ ଗ୍ଲୁକୋଜିନୋଲେଟ୍ ବାୟୋସାଇନ୍ଥେଟିକ୍ ପ୍ରକ୍ରିୟା ସହିତ ଜଡିତ ଏକ ସ୍ୱଳ୍ପ ତେଲ-ବିଷୟବସ୍ତୁ ଏବଂ ଦ୍ୱିଗୁଣ ଉଚ୍ଚ କୃଷି ଚିହ୍ନିତ ଜିନ୍ ଗୁଡିକ ଯଥେଷ୍ଟ ଅଧିକ ପ୍ରତିନିଧିତ୍। ହୋଇଥିଲେ |
ବି। ନାପସ୍ ର ଇକୋଟାଇପ୍ ଉନ୍ନତିର ଚୟନ ଅନ୍ତର୍ଗତ ଫୁଲ-ସମୟ ନିୟାମନର ସମୀକ୍ଷା |
ଆଲୋଚନା
ଏହାର ଉତ୍ପତ୍ତି ଏବଂ ଉନ୍ନତି ଇତିହାସ ବୁ understanding ିବା ପାଇଁ ଏହି ଅଧ୍ୟୟନ ଏକ ମୂଲ୍ୟବାନ ଉତ୍ସ ପ୍ରଦାନ କଲା |B. napusଏବଂ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ଆଗ୍ରୋନୋମିକ୍ ଜଟିଳ ଗୁଣଗୁଡିକର ଜେନେଟିକ୍ ଆଧାରଗୁଡିକର ବିଚ୍ଛେଦକୁ ସହଜ କରିବ |ଅନୁକୂଳ ପ୍ରକାର, ଚୟନ ସଙ୍କେତ ଏବଂ ପ୍ରାର୍ଥୀ ଜିନ୍ ସହିତ ଜଡିତ ମହତ୍ S ପୂର୍ଣ୍ଣ SNP ଗୁଡିକ ଭବିଷ୍ୟତରେ ବିଶେଷ ଭାବରେ ଅମଳ, ବିହନ ଗୁଣ, ତ oil ଳର ବିଷୟବସ୍ତୁ ଏବଂ ଏହି ଆଲୋପୋଲାଇପ୍ଲଏଡ୍ ଫସଲ ଏବଂ ଏହାର ସମ୍ପର୍କୀୟଙ୍କ ଆଡାପ୍ଟାବିଲିଟିରେ ଉନ୍ନତି ଆଣିବାରେ ସହାୟକ ହେବ |
ସନ୍ଦର୍ଭ
ସମ୍ପୁର୍ଣ୍ଣ-ଜେନୋମ ପୁନ res ନିର୍ମାଣ ବ୍ରାସିକା ନାପସ୍ ଉତ୍ପତ୍ତି ଏବଂ ଏହାର ଉନ୍ନତିରେ ଜଡିତ ଜେନେଟିକ୍ ଲୋକି ପ୍ରକାଶ କରେ |ପ୍ରକୃତି ଯୋଗାଯୋଗ |, 2019, 10 (1)
ସମ୍ବାଦ ଏବଂ ହାଇଲାଇଟ୍ | ବାୟୋମାର୍କର ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ସହିତ ଅତ୍ୟାଧୁନିକ ସଫଳ ମାମଲା ବାଣ୍ଟିବା, ଉପନ୍ୟାସ ବ scientific ଜ୍ଞାନିକ ସଫଳତା ଏବଂ ଅଧ୍ୟୟନ ସମୟରେ ପ୍ରୟୋଗ କରାଯାଇଥିବା ବିଶିଷ୍ଟ କ ques ଶଳଗୁଡ଼ିକୁ କ୍ୟାପଚର କରିବା |
ପୋଷ୍ଟ ସମୟ: ଜାନ -05-2022 |