ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ଇକୋଲୋଜି |
କୃଷି ତୀବ୍ରତା ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ନେଟୱାର୍କ ଜଟିଳତା ଏବଂ ମୂଳରେ କି-ଷ୍ଟୋନ୍ ଟ୍ୟାକ୍ସର ପ୍ରଚୁରତାକୁ ହ୍ରାସ କରେ |
ପୂର୍ଣ୍ଣ ଦ length ର୍ଘ୍ୟ ଆମ୍ପଲିକନ୍ କ୍ରମ (ITS) | |PacBio HIFI |
ହାଇଲାଇଟ୍ସ |
Aଖରାପ ପୁଷ୍ଟିକର ବ୍ୟବହାର ଦକ୍ଷତା, ଭୂତଳ ଜଳ ଇଉଟ୍ରୋଫିକେସନ୍, ମୃତ୍ତିକାର ଗୁଣର ଅବନତି ଇତ୍ୟାଦି ସହିତ ଏହାର ପ୍ରତିକୂଳ ପରିବେଶ ପ୍ରଭାବ ଯୋଗୁଁ କୃଷିଭିତ୍ତିକ ତୀବ୍ରତା ବୃଦ୍ଧି ପାଇବାରେ ଲାଗିଛି।ଏଗ୍ରୋ-ସିଷ୍ଟମର ଉତ୍ପାଦକତା ଏବଂ ସ୍ଥାୟୀତ୍ୱରେ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟ ଏକ ଅପରିହାର୍ଯ୍ୟ ଭୂମିକା ଗ୍ରହଣ କରିଥାଏ |ତଥାପି, ଏହା ଅସ୍ପଷ୍ଟ ଯେ ବିଭିନ୍ନ ଚାଷ ପ୍ରଣାଳୀ ମୂଳ ମାଇକ୍ରୋବୋଏଟା ଉପରେ କେତେ ପ୍ରଭାବ ପକାଇଥାଏ |
ପରୀକ୍ଷାମୂଳକ ଡିଜାଇନ୍ |
ପରୀକ୍ଷଣ |
Sତେଲ ଏବଂ ମୂଳ (DNA) ନମୁନା ଗହମ କ୍ଷେତରୁ 60 ଟି କୃଷି ଚାଷ ଜମିରୁ (ପ୍ରତ୍ୟେକ 20)
Gରୋପିଂ: 1. ସମ୍ମିଳନୀ (ଚାଷ ସହିତ);2. ସମ୍ମିଳନୀ (ଚାଷ ନକରିବା);3. ଜ Organ ବିକ ଚାଷ ଜମି |
Sସମାନତା ରଣନୀତି: ପୂର୍ଣ୍ଣ ଦ length ର୍ଘ୍ୟ ଆମ୍ପଲିକନ୍ କ୍ରମ (ITS)
Pରାଇମର୍ସ: ITS1F-ITS4 (ସମଗ୍ର ITS ଅଞ୍ଚଳକୁ ଟାର୍ଗେଟ କରି ~ 630 bp)
Sସମାନ୍ତରାଳ ପ୍ଲାଟଫର୍ମ: PacBio RS II |
ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ ଆନାଲିସିସ୍ |
ଫଳାଫଳ
On ସାଇଟରେ ହାରାହାରି 357 OTU ଏବଂ ସମସ୍ତ 60 ଟି ସାଇଟର ମୋଟ 837 OTU ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଇଥିଲା |ମୂଳ ଫଙ୍ଗଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟର ଆଲଫା ବିବିଧତା ତିନୋଟି ଚାଷ ପ୍ରଣାଳୀ ମଧ୍ୟରେ ବିଶେଷ ପାର୍ଥକ୍ୟ ଦେଖାଉ ନଥିଲା |ଅବଶ୍ୟ, ବିଟା ବିବିଧତା ବିଶ୍ଳେଷଣରେ ତିନୋଟି ପୃଥକ କ୍ଲଷ୍ଟର ଗଠନ କରାଯାଇଥିଲା, ଯାହା ମୂଳ ଫଙ୍ଗଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟର ଗଠନ ଉପରେ ଚାଷ ପ୍ରଣାଳୀର ଏକ ଦୃ strong ପ୍ରଭାବକୁ ସୂଚାଇଥାଏ |
ଚିତ୍ର 1. ମୂଳ ଫଙ୍ଗଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟ ଉପରେ ଆଲଫା ବିବିଧତା (ଶାନନ୍ ଇଣ୍ଡେକ୍ସ ଏବଂ ସମ୍ପ୍ରଦାୟର ରଚନା) ଏବଂ ବିଟା ବିବିଧତା ବିଶ୍ଳେଷଣ (ମୂଖ୍ୟ ସଂଯୋଜନାଗୁଡିକର କାନୋନିକାଲ୍ ଆନାଲିସିସ୍) |
Tତିନୋଟି ଚାଷ ପ୍ରଣାଳୀରେ ଫଙ୍ଗଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟର ସାମଗ୍ରିକ ନେଟୱାର୍କ ଉପରେ ଆଧାର କରି en କିଷ୍ଟୋନ୍ ଟ୍ୟାକ୍ସକୁ ବ୍ୟାଖ୍ୟା କରାଯାଇଥିଲା: ସର୍ବୋଚ୍ଚ ଡିଗ୍ରୀ ସହିତ ସର୍ବୋଚ୍ଚ 10 ଟି ନୋଡ୍, ସର୍ବୋଚ୍ଚ ଘନିଷ୍ଠତା ଏବଂ ସର୍ବନିମ୍ନତା ମଧ୍ୟରେ କେନ୍ଦ୍ରୀୟତା |ସେଥିମଧ୍ୟରୁ ସାତଟି ମାଇକ୍ରୋରିଜାଲ୍ ଅର୍ଡରର ଥିଲା |
ଚିତ୍ର 2. ତିନୋଟି ଚାଷ ପ୍ରଣାଳୀର ମୂଳ ଫଙ୍ଗଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟ ଉପରେ ସାମଗ୍ରିକ ନେଟୱାର୍କ |
Fଆର୍ମିଂ-ସିଷ୍ଟମ୍ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ନେଟୱାର୍କଗୁଡ଼ିକ ଜ organic ବ ନେଟୱାର୍କରେ ଯଥେଷ୍ଟ ଅଧିକ ସଂଯୋଗକୁ ସୂଚାଇଥାଏ ଯାହାକି ନୋ-ଟିଲ୍ ଏବଂ ପାରମ୍ପାରିକ ନେଟୱାର୍କ ଅପେକ୍ଷା ଦୁଇଗୁଣ ଧାର ଏବଂ ଅଧିକ ସଂଯୁକ୍ତ ନୋଡ୍ ସହିତ |ଅଧିକନ୍ତୁ, ଜ organic ବିକ କୃଷି ନେଟୱାର୍କ ବାକି ତୁଳନାରେ ଅଧିକ କୀ ଷ୍ଟୋନ୍ ଟ୍ୟାକ୍ସ (ହୀରା) ଧାରଣ କରିଥିଲା, ଯାହା ଏହାର ଜଟିଳତା ଏବଂ ସଂଯୋଗକୁ ସମର୍ଥନ କରେ |
ଚିତ୍ର 3. ଚାଷ ପ୍ରଣାଳୀ-ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ମୂଳ ଫଙ୍ଗଲ୍ ନେଟୱାର୍କ |
Aକୃଷି ତୀବ୍ରତା ଏବଂ ମୂଳ ଫଙ୍ଗଲ୍ ନେଟୱାର୍କ ସଂଯୋଗ ମଧ୍ୟରେ ଦୃ strong ନକାରାତ୍ମକ ସଙ୍ଗଠନ ପରିଲକ୍ଷିତ ହୋଇଥିଲା |ଅନିୟମିତ ଜଙ୍ଗଲ ବିଶ୍ଳେଷଣରେ କିଷ୍ଟୋନ୍ ଟ୍ୟାକ୍ସର ମୁଖ୍ୟ ଡ୍ରାଇଭରଗୁଡିକ ପ୍ରକାଶ ପାଇଲା: ମୃତ୍ତିକା ଫସଫରସ୍, ବଲ୍କ ସାନ୍ଦ୍ରତା, pH ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋରିଜାଲ୍ ଉପନିବେଶ |
ଚିତ୍ର 4. ତିନୋଟି କୃଷି ପ୍ରଣାଳୀରେ କୃଷିର ତୀବ୍ରତା ଏବଂ ନେଟୱର୍କ ସଂଯୋଗ (A ଏବଂ B);ଅନିୟମିତ ଜଙ୍ଗଲ ବିଶ୍ଳେଷଣ (C) ଏବଂ କୃଷି ତୀବ୍ରତା ଏବଂ AMF ଉପନିବେଶ (D) ମଧ୍ୟରେ ସମ୍ପର୍କ |
ଟେକ୍ନୋଲୋଜି |
ପୂର୍ଣ୍ଣ ଦ length ର୍ଘ୍ୟ ଆମ୍ପଲିକନ୍ କ୍ରମ |
As “ତୃତୀୟ ଜେନେରେସନ୍ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ” ମଞ୍ଚକୁ ଆସୁଛି, ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଅଞ୍ଚଳରେ ସୀମିତତା ଏବଂ ଡି ନୋଭୋ ଆସେମ୍ବଲିରେ ଥିବା ଅସୁବିଧା ଦୂର ହୋଇଛି |ପାସିଫିକ୍ ବାୟୋ ସାଇନ୍ସ (ପ୍ୟାକ୍ବିଓ) କ୍ରମର ପଠନକୁ ସଫଳତାର ସହିତ ଦଶ କିଲୋବାଜ୍ ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ବିସ୍ତାର କରିଛି, ଯାହା ଆମକୁ 16s rRNA (1,000 bp-1,500 bp) ର ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ କିମ୍ବା 18S rRNA (1,500 bp-2,000 bp) ଏବଂ ITS ରେ ପୂର୍ଣ୍ଣ ଦ s ର୍ଘ୍ୟ ପଠନ ପାଇବାକୁ ଅନୁମତି ଦିଏ | ଇଉକାରିଓଟିକ୍ସରେ ଅଞ୍ଚଳଗୁଡିକ (400 bp-900 bp) |ଜେନେଟିକ୍ କ୍ଷେତ୍ରର ବିସ୍ତୃତ ଦୃଶ୍ୟ ପ୍ରଜାତିର ଟିପ୍ପଣୀ ଏବଂ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଜିନ୍ଗୁଡ଼ିକର ରେଜୋଲୁସନକୁ ବହୁଗୁଣିତ କଲା |ଆଧାର ସଠିକତା ଉପରେ ଦୀର୍ଘ ସମୟର ଚିନ୍ତାର ବିଷୟ PacBio CCS ସ୍ୱୟଂ ସଂଶୋଧନ ଦ୍ୱାରା ସମାଧାନ ହୋଇଛି, ଯାହାକି 99% ରୁ ଅଧିକ ପଠନ ସଠିକତା ସହିତ HIFI ପଠନ ସୃଷ୍ଟି କରିଥାଏ |
OTU ଟିପ୍ପଣୀରେ ପ୍ରଦର୍ଶନ
Tଉଭୟ ଲମ୍ବା ପ s ଼ିବା ଏବଂ ଉଚ୍ଚ-ଥ୍ରୋପପୁଟର ସୁବିଧାଗୁଡ଼ିକ, ଟିପ୍ପଣୀର ସଠିକତା ନାଟକୀୟ ଭାବରେ ବୃଦ୍ଧି ହୋଇପାରେ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ପରିଚୟରେ ଏକ “ପ୍ରଜାତି-ସ୍ତର” ରେଜୋଲୁସନ ହାସଲ କରାଯାଇପାରେ |
ସନ୍ଦର୍ଭ
ବାନାର୍ଜୀ, ସମୀରନ୍, ଇତ୍ୟାଦି |କୃଷି ତୀବ୍ରତା ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ନେଟୱାର୍କର ଜଟିଳତା ଏବଂ ମୂଳରେ କିଷ୍ଟୋନ୍ ଟ୍ୟାକ୍ସର ପ୍ରଚୁରତାକୁ ହ୍ରାସ କରିଥାଏ |ISME ଜର୍ନାଲ୍ (2019) |
ଟେକ୍ ଏବଂ ହାଇଲାଇଟ୍ | ବିଭିନ୍ନ ରିଜାଚ୍ ମ ena ଦାନରେ ବିଭିନ୍ନ ହାଇ-ଥ୍ରୋପଟ୍ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ ଟେକ୍ନୋଲୋଜିର ସଦ୍ୟତମ ସଫଳ ପ୍ରୟୋଗ ବାଣ୍ଟିବା ଏବଂ ପରୀକ୍ଷାମୂଳକ ଡିଜାଇନ୍ ଏବଂ ଡାଟା ଖଣିରେ ଉଜ୍ଜ୍ୱଳ ଧାରଣା ବାଣ୍ଟିବାକୁ ଲକ୍ଷ୍ୟ ରଖିଛି |
ପୋଷ୍ଟ ସମୟ: ଜାନ -08-2022 |