ଡି ନୋଭୋ |ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ ଏକ ରେଫରେନ୍ସ ଜିନୋମର ଅନୁପସ୍ଥିତିରେ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ବ୍ୟବହାର କରି ଏକ ପ୍ରଜାତିର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ୍ ନିର୍ମାଣକୁ ବୁ refers ାଏ |ତୃତୀୟ ପି generation ଼ିର ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ଟେକ୍ନୋଲୋଜିର ପ read ଼ା ଦ length ର୍ଘ୍ୟର ଉଲ୍ଲେଖନୀୟ ଉନ୍ନତି ଜଟିଳ ଜେନୋମଗୁଡିକ ଏକତ୍ର କରିବାରେ ନୂତନ ସୁଯୋଗ ଆଣିଛି, ଯେପରିକି ଉଚ୍ଚ ହେଟେରୋଜାଇଗୋସିଟି, ପୁନରାବୃତ୍ତି ଅଞ୍ଚଳର ଉଚ୍ଚ ଅନୁପାତ, ପଲିପ୍ଲଏଡ୍ ଇତ୍ୟାଦି ଦଶ କିଲୋବାଜ୍ ସ୍ତରରେ ପଠନ ଦ length ର୍ଘ୍ୟ ସହିତ, ଏହି କ୍ରମାନ୍ୱୟରେ ପଠନଗୁଡ଼ିକ ସକ୍ଷମ ହୋଇଥାଏ | ପୁନରାବୃତ୍ତି ଉପାଦାନଗୁଡ଼ିକର ସମାଧାନ, ଅସ୍ୱାଭାବିକ ଜିସି ବିଷୟବସ୍ତୁ ସହିତ ଅଞ୍ଚଳ ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ଜଟିଳ ଅଞ୍ଚଳ |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ : PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
ହାଇ-ସି ହେଉଛି ଏକ ପଦ୍ଧତି ଯାହା କ୍ରୋମୋଜୋମ୍ ବିନ୍ୟାସକରଣକୁ ନିକଟତର-ଆଧାରିତ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଏବଂ ଉଚ୍ଚ-ଥ୍ରୋପପୁଟ୍ କ୍ରମକୁ ମିଶ୍ରଣ କରି ଡିଜାଇନ୍ କରାଯାଇଛି |ଏହି ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାଗୁଡ଼ିକର ତୀବ୍ରତା କ୍ରୋମୋଜୋମରେ ଶାରୀରିକ ଦୂରତା ସହିତ ନକାରାତ୍ମକ ଭାବରେ ସମ୍ବନ୍ଧିତ ବୋଲି ବିଶ୍ believed ାସ କରାଯାଏ |ତେଣୁ, ହାଇ-ସି ଡାଟା ଏକ ଡ୍ରାଫ୍ଟ ଜିନୋମରେ ଏକତ୍ରିତ କ୍ରମର କ୍ଲଷ୍ଟରିଙ୍ଗ, ଅର୍ଡର ଏବଂ ଆଭିଏଣ୍ଟେସନ୍ ଏବଂ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ସଂଖ୍ୟକ କ୍ରୋମୋଜୋମ୍ ଉପରେ ଲଙ୍କାକରିବା ପାଇଁ ମାର୍ଗଦର୍ଶନ କରିପାରିବ |ଜନସଂଖ୍ୟା ଆଧାରିତ ଜେନେଟିକ୍ ମାନଚିତ୍ରର ଅନୁପସ୍ଥିତିରେ ଏହି ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ଏକ କ୍ରୋମୋଜୋମ୍ ସ୍ତରୀୟ ଜିନୋମ ସମାବେଶକୁ ସଶକ୍ତ କରେ |ପ୍ରତ୍ୟେକ ଜିନୋମକୁ ଏକ ହାଇ-ସି ଦରକାର |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ : Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ |
ବିବର୍ତ୍ତନଶୀଳ ଜେନେଟିକ୍ସ ହେଉଛି ଏକ ପ୍ୟାକ୍ ହୋଇଥିବା ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ସେବା ଯାହାକି SNPs, InDels, SVs ଏବଂ CNVs ସହିତ ଜେନେଟିକ ପରିବର୍ତ୍ତନ ଉପରେ ଆଧାର କରି ପ୍ରଦତ୍ତ ସାମଗ୍ରୀର ବିବର୍ତ୍ତନ ସୂଚନା ଉପରେ ଏକ ବିସ୍ତୃତ ବ୍ୟାଖ୍ୟା ପ୍ରଦାନ ପାଇଁ ପରିକଳ୍ପିତ |ଏହା ବିବର୍ତ୍ତନିକ ପରିବର୍ତ୍ତନ ଏବଂ ଜନସଂଖ୍ୟାର ଜେନେଟିକ ବ features ଶିଷ୍ଟ୍ୟ ବର୍ଣ୍ଣନା କରିବା ପାଇଁ ଆବଶ୍ୟକ କରୁଥିବା ସମସ୍ତ ମ fundamental ଳିକ ବିଶ୍ଳେଷଣ ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ, ଯେପରିକି ଜନସଂଖ୍ୟା ଗଠନ, ଜେନେଟିକ୍ ବିବିଧତା, ଫିଲୋଜେନି ସମ୍ପର୍କ ଇତ୍ୟାଦି ଏଥିରେ ଜିନ୍ ପ୍ରବାହ ଉପରେ ଅଧ୍ୟୟନ ମଧ୍ୟ ରହିଥାଏ, ଯାହାକି ପ୍ରଭାବଶାଳୀ ଜନସଂଖ୍ୟା ଆକାର, ବିଭେଦ ସମୟର ଆକଳନକୁ ଶକ୍ତି ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ |
ତୁଳନାତ୍ମକ ଜେନୋମିକ୍ସର ଅର୍ଥ ହେଉଛି ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ଜେନୋମ କ୍ରମ ଏବଂ ବିଭିନ୍ନ ପ୍ରଜାତିର ସଂରଚନାକୁ ତୁଳନା କରିବା |ଏହି ଅନୁଶାସନ ପ୍ରଜାତିର ବିବର୍ତ୍ତନ, ଜିନ୍ କାର୍ଯ୍ୟ, ଜିନୋମ ସ୍ତରରେ ଜିନ୍ ନିୟାମକ ପ୍ରଣାଳୀକୁ କ୍ରମାନ୍ୱୟରେ ସଂରଚନା ଏବଂ ଉପାଦାନଗୁଡ଼ିକୁ ଚିହ୍ନଟ କରି ଲକ୍ଷ୍ୟ ରଖିଥାଏ ଯାହା ବିଭିନ୍ନ ପ୍ରଜାତି ମଧ୍ୟରେ ସଂରକ୍ଷିତ କିମ୍ବା ଭିନ୍ନ ହୋଇଥାଏ |ସାଧାରଣ ତୁଳନାତ୍ମକ ଜେନୋମିକ୍ସ ଅଧ୍ୟୟନରେ ଜିନ୍ ପରିବାର, ବିବର୍ତ୍ତନ ବିକାଶ, ପୁରା ଜିନୋମ୍ ନକଲ, ଚୟନକାରୀ ଚାପ ଇତ୍ୟାଦି ବିଶ୍ଳେଷଣ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ |
ବଲ୍କେଡ୍ ସେଗ୍ରେଗାଣ୍ଟ ଆନାଲିସିସ୍ (BSA) ହେଉଛି ଫେନୋଟାଇପ୍ ସହିତ ଜଡିତ ଜେନେଟିକ୍ ମାର୍କର୍ଗୁଡ଼ିକୁ ଶୀଘ୍ର ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ ବ୍ୟବହୃତ ଏକ କ que ଶଳ |BSA ର ମୁଖ୍ୟ କାର୍ଯ୍ୟଧାରା ଦୁଇଟି ବିରୋଧୀ ଫେନୋଟାଇପ୍ ସହିତ ବ୍ୟକ୍ତିବିଶେଷଙ୍କ ଦୁଇ ଗୋଷ୍ଠୀ ଚୟନ କରିବା, ସମସ୍ତ ବ୍ୟକ୍ତିବିଶେଷଙ୍କ DNA କୁ ଦୁଇଟି ବଲ୍କ DNA ଗଠନ କରିବା, ଦୁଇଟି ପୁଲ ମଧ୍ୟରେ ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ କ୍ରମ ଚିହ୍ନଟ କରିବା |ଉଦ୍ଭିଦ / ପ୍ରାଣୀ ଜିନୋମରେ ଲକ୍ଷ୍ୟ ରଖାଯାଇଥିବା ଜିନ୍ ଦ୍ୱାରା ଜେନେଟିକ୍ ମାର୍କର୍ ଚିହ୍ନଟ କରିବାରେ ଏହି କ que ଶଳ ବ୍ୟାପକ ଭାବରେ ବ୍ୟବହୃତ ହୋଇଛି |