ØCircRNA mRNA ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ସହିତ ଅତ୍ୟନ୍ତ ଜଡିତ |
ØCircRNA - miRNA - mRNA ର ନିୟାମକ ପ୍ରଣାଳୀରେ ଅଂଶଗ୍ରହଣ |
Øଜଣାଶୁଣା circRNA ଏବଂ ଉପନ୍ୟାସ circRNA ପୂର୍ବାନୁମାନ ଉପରେ ପରିଚୟ ଏବଂ ପରିସଂଖ୍ୟାନ |
ØBMKCloud- ଆଧାରିତ ଫଳାଫଳ ବିତରଣ: ପ୍ଲାଟଫର୍ମରେ କଷ୍ଟୋମାଇଜଡ୍ ଡାଟା-ଖଣି ଉପଲବ୍ଧ |
Øପ୍ରୋଜେକ୍ଟ ସମାପ୍ତ ହେବା ପରେ 3 ମାସ ପାଇଁ ବିକ୍ରୟ ପରେ ସେବା ବ valid ଧ |
ନ୍ୟୁକ୍ଲିଓଟାଇଡ୍:
ଶୁଦ୍ଧତା | ଅଖଣ୍ଡତା | ପ୍ରଦୂଷଣ | ପରିମାଣ |
OD260 / 280≥1.7-2.5;OD260 / 230≥0.5-2.5; | ଉଦ୍ଭିଦଗୁଡିକ ପାଇଁ: RIN≥ |6.5;ପଶୁମାନଙ୍କ ପାଇଁ: RIN≥ |7;28S / 18S≥1.0;ସୀମିତ କିମ୍ବା କ bas ଣସି ବେସ୍ ଲାଇନ୍ ଉଚ୍ଚତା ନାହିଁ | | ଜେଲରେ ସୀମିତ କିମ୍ବା କ protein ଣସି ପ୍ରୋଟିନ୍ କିମ୍ବା DNA ପ୍ରଦୂଷଣ ଦେଖାଯାଏ ନାହିଁ | | କନକ୍।≥100ng / μl;ଭଲ୍ୟୁମ୍ ≥ 10 μl;ସମୁଦାୟ ≥2μg |
ଟିସୁ: ଓଜନ (ଶୁଖିଲା): ≥1 ଗ୍ରାମ |
* 5 ମିଗ୍ରା ରୁ କମ୍ ଟିସୁ ପାଇଁ, ଆମେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ (ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ) ଟିସୁ ନମୁନା ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |
ସେଲ୍ ନିଲମ୍ବନ: ସେଲ୍ ଗଣନା = 3 × 10 |7
* ଆମେ ଫ୍ରିଜ୍ ହୋଇଥିବା ସେଲ୍ ଲାଇସେଟ୍ ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |ଯଦି ସେହି ସେଲ୍ 5 × 10 ରୁ ଛୋଟ ଗଣନା କରେ |5, ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ ସୁପାରିଶ କରାଯାଏ |
ରକ୍ତ ନମୁନା:
PA×geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ଏବଂ 2mL ରକ୍ତ (TRIzol:ରକ୍ତ= 3: 1 |)
ସୁପାରିଶ କରାଯାଇଥିବା ନମୁନା ବିତରଣ |
ପାତ୍ର: 2 ମିଲି ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ ଟ୍ୟୁବ୍ (ଟିଫିନ୍ ଫଏଲ୍ ସୁପାରିଶ କରାଯାଏ ନାହିଁ)
ନମୁନା ଲେବେଲିଂ: ଗୋଷ୍ଠୀ + ନକଲ ଯଥା A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
ପଠାଇବା:
ଶୁଖିଲା ବରଫ: ନମୁନାଗୁଡ଼ିକୁ ବ୍ୟାଗରେ ପ୍ୟାକ୍ କରି ଶୁଖିଲା ବରଫରେ ପୋତି ଦିଆଯିବା ଆବଶ୍ୟକ |
RNA ସ୍ଥିର ଟ୍ୟୁବ୍: RNA ନମୁନାଗୁଡିକ RNA ସ୍ଥିରତା ଟ୍ୟୁବରେ ଶୁଖାଯାଇପାରିବ (ଯଥା RNAstable®) ଏବଂ କୋଠରୀ ତାପମାତ୍ରାରେ ପଠାଯାଇପାରିବ |
ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ |
1.CircRNA ହୋଷ୍ଟଗୁଡିକ |
ଏହା ରିପୋର୍ଟ ହୋଇଛି ଯେ ଅଧିକାଂଶ ସର୍କର୍ଏନ୍ଏସ୍ ଇଣ୍ଟ୍ରନ୍ କିମ୍ବା ଇଣ୍ଟରଜେନିକ୍ ଅଞ୍ଚଳ ଅପେକ୍ଷା ଏକ୍ସନ୍ସରୁ ଉତ୍ପନ୍ନ |ଅଧିକନ୍ତୁ, କ୍ରୋମୋଜୋମ୍ ମଧ୍ୟରେ ସର୍କର୍ଏନ୍ଏର ବଣ୍ଟନ ଯଥେଷ୍ଟ ଭିନ୍ନ ହୋଇଥାଏ |ତେଣୁ, ବିଭିନ୍ନ ନମୁନା ମଧ୍ୟରେ ସର୍କର୍ଏନ୍ଏ ହୋଷ୍ଟଗୁଡିକର ବିଭିନ୍ନ ବଣ୍ଟନକୁ ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନ କରିବା, ଏହାର ମୂଲ୍ୟ ବିଭିନ୍ନ ଜିନ୍ ଅଞ୍ଚଳରେ ଏବଂ ବିଭିନ୍ନ କ୍ରୋମୋଜୋମରେ ବଣ୍ଟନ ସହିତ ଏହାର ମୂଲ୍ୟବୋଧ ଅଟେ |
CircRNA ହୋଷ୍ଟର ବଣ୍ଟନ |
2. DE-circRNA ଉପରେ କ୍ଲଷ୍ଟରିଂ ଆନାଲିସିସ୍ |
ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ ସର୍କର୍ଏନ୍ଏସ୍ ର ହାଇରାର୍କିକାଲ୍ କ୍ଲଷ୍ଟରିଙ୍ଗ୍ |
3. DE-circRNA ହୋଷ୍ଟ ଜିନ୍ ଉପରେ GO ଟିପ୍ପଣୀ |
DE-circRNA ହୋଷ୍ଟ ଜିନ୍ ର GO ଶ୍ରେଣୀକରଣ |
BMK କେସ୍ |
ହେପାଟୋସେଲୁଲାର୍ କରସିନୋମା ରେ CPSF4 ସର୍କର୍ଏନ୍ଏ ଗଠନ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋ ଆରଏନ୍ଏ ମଧ୍ୟସ୍ଥି ଜିନ୍ ସାଇଲେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରେ |
ପ୍ରକାଶିତ: ଅନକୋଜେନ |, 2021
ମୁଖ୍ୟ ଫଳାଫଳଗୁଡିକ
1.CPSF4 ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି HCC ରେ ନିୟନ୍ତ୍ରିତ ହୋଇଛି ଏବଂ CPSF4 ର ଉଚ୍ଚ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି HCC ରୋଗୀମାନଙ୍କ ଖରାପ ପୂର୍ବାନୁମାନ ସହିତ ଜଡିତ |
C।
3. ସେଲ୍ ସଂସ୍କୃତି ଏବଂ ଜେନୋଗ୍ରାଫ୍ଟ ମାଉସ୍ ମଡେଲଗୁଡିକରେ ପରୀକ୍ଷଣଗୁଡିକ ଦର୍ଶାଇଲା ଯେ CPSF4 HCC କୋଷଗୁଡ଼ିକର ବିସ୍ତାରକୁ ପ୍ରୋତ୍ସାହିତ କରେ ଏବଂ ଟ୍ୟୁମରିଜେନିସିଟି ବୃଦ୍ଧି କରେ |ଅଧିକନ୍ତୁ, CPSF4 ଏହାର ଡାଉନ୍ଷ୍ଟ୍ରିମ୍ ସର୍କର୍ଏନ୍ଏର HCC ରେ ଟ୍ୟୁମର ଦମନକାରୀ ପ୍ରଭାବକୁ ବିରୋଧ କରେ |
miRNA ସ୍ତର ଏବଂ ପ୍ରୋଟିନ୍ ସ୍ତର | |
ୱାଙ୍ଗ ଏକ୍ସ, ଡୋଙ୍ଗ ଜେ, ଲି ଏକ୍ସ, ଇତ୍ୟାଦି |CPSF4 ହେପାଟୋସେଲୁଲାର୍ କରସିନୋମା [J] ରେ ସର୍କର୍ଏନ୍ଏ ଗଠନ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋ ଆରଏନ୍ଏ ମଧ୍ୟସ୍ଥି ଜିନ୍ ସାଇଲେନ୍ସିଂକୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରେ |Oncogene.DOI : 10.1038 / s41388-021-01867-6