Heatmap-skuff brukes til varmekarttegning, som kan filtrere, normalisere og klynge matrisedata. Den brukes mest til klyngeanalyse av genuttrykksnivå mellom forskjellige prøver.
Feste biologiske funksjoner til sekvenser i FASTA-fil ved å justere sekvenser til database, inkludert NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) er en algoritme og et program for å finne regioner med lignende biologiske sekvenser.Den sammenligner disse sekvensene med sekvensdatabaser og beregner den statistiske signifikansen.BLAST består av fire typer verktøy basert på sekvenstype: blastn, lastp, blastx og tblastn.