Plattform: NovaSeq-plattform, PE150
Bibliotektype: 200-400bp bisulfittbehandlet DNA-bibliotek
Sekvenseringsstrategi: Paired-End 150 bp
Anbefalt datautgang: 10 Gb rådata/prøve
DNA-mengde: ≥ 2 ug
DNA-konsentrasjon:≥ 20ng/μl.
Renhet: OD260/280 = 1,8 til 2,0 uten nedbrytning eller RNA-kontaminering
a.Referansestatistikk for genomjustering
Statistikk over kartlegging leser
Sstatistikk for sekvenseringsdybde og dekning av C-sted
Aakkumulert dekning
Dfordøyelseseffektivitet for hver prøve
b.Deteksjon av metyleringssted
Liste over metyleringsnivåer på C-stedet
BS konvertering
c.Metyleringskart
Genome element
d.Sammenligning av metyleringsnivåer mellom prøver
Pluftvis Korrelasjon av CG-metylering
d.Differensiell metyleringsanalyse
Sstatistikk for DMR