-
Enkeltkjerne RNA-sekvensering
Fremskrittet innen enkeltcellefangst og individuell bibliotekkonstruksjonsteknikk kombinert med sekvensering med høy gjennomstrømning tillater genekspresjonsstudier på celle-for-celle basis.Den muliggjør en dypere og fullstendig systemanalyse på komplekse cellepopulasjoner, der den i stor grad unngår maskering av deres heterogenitet ved å ta gjennomsnittet av alle celler.
Noen celler er imidlertid ikke egnet til å gjøres om til encellesuspensjon, så andre prøveforberedelsesmetoder - kjerneekstraksjon fra vev er nødvendig, det vil si at kjernen ekstraheres direkte fra vev eller celle og klargjøres til enkeltkjernesuspensjon for enkelt- cellesekvensering.
BMK tilbyr 10× Genomics ChromiumTM basert encellet RNA-sekvenseringstjeneste.Denne tjenesten har blitt mye brukt i studier på sykdomsrelaterte studier, som immuncelledifferensiering, tumorheterogenitet, vevsutvikling, etc.
Romlig transkriptombrikke: 10× Genomics
Plattform: Illumina NovaSeq-plattformen
-
BMKMANU S1000 Romlig transkriptom
Romlig transkriptomikk står i forkant av vitenskapelig innovasjon, og gir forskere mulighet til å fordype seg i intrikate genuttrykksmønstre i vev samtidig som de bevarer deres romlige kontekst.Blant ulike plattformer har BMKGene utviklet BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, med enforbedret oppløsningpå 5 µM, når det subcellulære området og muliggjørinnstillinger for flernivåoppløsning.S1000-brikken, med omtrent 2 millioner flekker, bruker mikrobrønner lagdelt med perler lastet med romlig strekkodede fangprober.Et cDNA-bibliotek, beriket med romlige strekkoder, utarbeides fra S1000-brikken og sekvenseres deretter på Illumina NovaSeq-plattformen.Kombinasjonen av romlig strekkodede prøver og UMI-er sikrer nøyaktigheten og spesifisiteten til dataene som genereres.BMKManu S1000-brikkens unike egenskap ligger i dens allsidighet, og tilbyr flernivåoppløsningsinnstillinger som kan finjusteres til forskjellige vev og detaljnivåer.Denne tilpasningsevnen posisjonerer brikken som et enestående valg for ulike romlige transkriptomiske studier, og sikrer presis romlig klynging med minimalt med støy.
Ved å bruke BMKManu S1000-brikken og andre romlige transkriptomikk-teknologier kan forskere få en bedre forståelse av den romlige organiseringen av celler og de komplekse molekylære interaksjonene som skjer i vev, og gir uvurderlig innsikt i mekanismene som ligger til grunn for biologiske prosesser på et bredt spekter av felt, inkludert onkologi, nevrovitenskap, utviklingsbiologi, immunologi og botaniske studier.
Plattform: BMKManu S1000-brikke og Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Spatial transcriptomics er en banebrytende teknologi som lar forskere undersøke genuttrykksmønstre i vev samtidig som de bevarer deres romlige kontekst.En kraftig plattform i dette domenet er 10x Genomics Visium kombinert med Illumina-sekvensering.Prinsippet til 10X Visium ligger på en spesialisert brikke med et angitt fangstområde hvor vevssnitt plasseres.Dette fangstområdet inneholder strekkodede flekker, som hver tilsvarer en unik romlig plassering i vevet.De fangede RNA-molekylene fra vevet merkes deretter med unike molekylære identifikatorer (UMI) under omvendt transkripsjonsprosessen.Disse strekkodede flekkene og UMI-ene muliggjør presis romlig kartlegging og kvantifisering av genuttrykk ved en enkeltcelleoppløsning.Kombinasjonen av romlig strekkodede prøver og UMI-er sikrer nøyaktigheten og spesifisiteten til dataene som genereres.Ved å bruke denne Spatial Transcriptomics-teknologien kan forskere få en dypere forståelse av den romlige organiseringen av celler og de komplekse molekylære interaksjonene som forekommer i vev, og tilby uvurderlig innsikt i mekanismene som ligger til grunn for biologiske prosesser på flere felt, inkludert onkologi, nevrovitenskap, utviklingsbiologi, immunologi og botaniske studier.
Plattform: 10X Genomics Visium og Illumina NovaSeq
