-
BSA
Bulked Segregant Analysis-plattformen består av ett-trinns standardanalyse og avansert analyse med tilpasset parameterinnstilling.BSA er en teknikk som brukes for raskt å identifisere fenotype-assosierte genetiske markører.Hovedarbeidsflyten til BSA inneholder: 1. velge to grupper av individer med ekstremt motstridende fenotyper;2. sammenslåing av DNA, RNA eller SLAF-seq (utviklet av biomarkør) fra alle individer for å danne to deler av DNA;3. identifisere differensielle sekvenser mot referansegenom eller i mellom, 4. forutsi kandidatkoblede regioner ved hjelp av ED og SNP-indeksalgoritme;5. Funksjonell analyse og berikelse av gener i kandidatregioner, etc. Mer avansert gruvedrift i data inkludert genetisk markørscreening og primerdesign er også tilgjengelig.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS)-plattformen er utviklet med mange års erfaring innen mikrobiell mangfoldsprosjektanalyse, som inneholder standardisert grunnleggende analyse og personalisert analyse: grunnleggende analyse dekker det vanlige analyseinnholdet i gjeldende mikrobiell forskning, analyseinnholdet er rikt og omfattende, og analyseresultater presenteres i form av prosjektrapporter;Innholdet i personalisert analyse er mangfoldig.Prøver kan velges og parametere kan settes fleksibelt i henhold til den grunnleggende analyserapporten og forskningsformålet, for å realisere personlige krav.Windows-operativsystem, enkelt og raskt.
-
Evolusjonær genetikk
Evolusjonær genetikk er en pakket sekvenseringstjeneste designet for å gi en omfattende tolkning av evolusjonær informasjon om gitte materialer basert på genetiske variasjoner, inkludert SNP-er, InDels, SV-er og CNV-er.Den gir all grunnleggende analyse som kreves for å beskrive evolusjonære endringer og genetiske trekk ved populasjoner, slik som populasjonsstruktur, genetisk mangfold, fylogeniske forhold, etc. Den inneholder også studier om genflyt, som muliggjør estimering av effektiv populasjonsstørrelse, divergenstid.
-
Komparativ genomikk
Komparativ genomikk betyr bokstavelig talt å sammenligne de komplette genomsekvensene og strukturene til forskjellige arter.Denne disiplinen tar sikte på å avsløre artsutvikling, genfunksjon, genreguleringsmekanisme på genomnivå ved å identifisere sekvensstrukturene og elementene som bevarte eller differensierte på tvers av forskjellige arter.Typisk komparativ genomikkstudie inkluderer analyser i genfamilie, evolusjonær utvikling, duplisering av hele genom, selektivt trykk, etc.
-
Evolusjonær genetikk
Populasjons- og evolusjonær genetisk analyseplattform er etablert på grunnlag av massiv erfaring samlet i BMK FoU-team i årevis.Det er et brukervennlig verktøy spesielt for forskere som ikke har hovedfag i bioinformatikk.Denne plattformen muliggjør grunnleggende evolusjonær genetikkrelatert grunnleggende analyse inkludert fylogenetisk trekonstruksjon, koblingsuvektsanalyse, genetisk mangfoldsvurdering, selektiv sveipanalyse, slektskapsanalyse, PCA, populasjonsstrukturanalyse, etc.
-
Hi-C basert Genome Assembly
Hi-C er en metode designet for å fange kromosomkonfigurasjon ved å kombinere sonderende nærhetsbaserte interaksjoner og sekvensering med høy gjennomstrømning.Intensiteten til disse interaksjonene antas å være negativt korrelert med fysisk avstand på kromosomene.Derfor kan Hi-C-data veilede klynging, rekkefølge og orientering av sammensatte sekvenser i et utkast til genom og forankre disse på et visst antall kromosomer.Denne teknologien styrker en genomsamling på kromosomnivå i fravær av populasjonsbasert genetisk kart.Hvert genom trenger en Hi-C.
Plattform: Illumina NovaSeq-plattformen / DNBSEQ
-
Plante/dyr De Novo Genome Sequencing
De Novosekvensering refererer til konstruksjon av en arts hele genom ved bruk av sekvenseringsteknologier, f.eks. PacBio, Nanopore, NGS, etc., i fravær av et referansegenom.Den bemerkelsesverdige forbedringen i leselengde til tredjegenerasjons sekvenseringsteknologier har ført til nye muligheter i å sette sammen komplekse genomer, slik som de med høy heterozygositet, høyt forhold mellom repeterende regioner, polyploider, etc. Med leselengde på titalls kilobaser-nivå, muliggjør disse sekvenseringsavlesningene oppløsning av repeterende elementer, regioner med unormalt GC-innhold og andre svært komplekse regioner.
Plattform: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq-plattformen
-
Human Whole Exome Sequencing
Whole exome Sequencing (WES) betraktes som en kostnadseffektiv sekvenseringsstrategi for å identifisere sykdomsfremkallende mutasjoner.Selv om eksoner bare tar opp omtrent 1,7% av hele genomet, representerer det profilen til totale proteinfunksjoner direkte.I humant genom er det rapportert at mer enn 85% av sykdomsrelaterte mutasjoner forekommer i proteinkodende region.
BMKGENE tilbyr omfattende og fleksible menneskelige heleksome-sekvenseringstjenester med forskjellige eksonfangststrategier tilgjengelig for å møte ulike forskningsmål.
Plattform: Illumina NovaSeq-plattformen
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
High-throughput genotyping, spesielt på storskala populasjoner, er et grunnleggende trinn i genetisk assosiasjonsstudier, som gir genetisk grunnlag for funksjonell genfunn, evolusjonsanalyse, etc. I stedet for dyp helgenom-re-sekvensering, redusert representasjonsgenomsekvensering (RRGS) ) er introdusert for å minimere sekvenseringskostnaden per prøve, samtidig som den opprettholder rimelig effektivitet ved oppdagelse av genetisk markør.Dette oppnås vanligvis ved å trekke ut restriksjonsfragmenter innenfor gitt størrelsesområde, som kalles redusert representasjonsbibliotek (RRL).Spesifikt-locus amplifisert fragmentsekvensering (SLAF-Seq) er en egenutviklet strategi for SNP-genotyping med eller uten et referansegenom.
Plattform: Illumina NovaSeq-plattformen -
Illumina og BGI
Illumina sekvenseringsteknologi, basert på Sequencing by Synthesis (SBS), er en globalt omfavnet NGS-innovasjon, ansvarlig for å generere over 90 % av verdens sekvenseringsdata.Prinsippet til SBS involverer avbildning av fluorescensmerkede reversible terminatorer når hver dNTP tilsettes og deretter spaltes for å tillate inkorporering av neste base.Med alle fire reversible terminator-bundne dNTP-er tilstede i hver sekvenseringssyklus, minimerer naturlig konkurranse inkorporeringsskjevhet.Denne allsidige teknologien støtter både enkeltleste og parede biblioteker, og passer til en rekke genomiske applikasjoner.Illumina-sekvenseringens evner og presisjon med høy gjennomstrømning posisjonerer den som en hjørnestein i genomisk forskning, og gir forskere mulighet til å avdekke vanskelighetene til genomene med uovertruffen detaljer og effektivitet.
DNBSEQ, utviklet av BGI, er en annen innovativ NGS-teknologi som har klart å redusere sekvenseringskostnadene ytterligere og øke gjennomstrømningen.Utarbeidelse av DNBSEQ-biblioteker involverer DNA-fragmentering, klargjøring av ssDNA og rullende sirkelamplifisering for å oppnå DNA-nanokulene (DNB).Disse blir deretter lastet på en solid overflate og deretter sekvensert ved kombinatorisk probe-ankersyntese (cPAS).
Vår ferdiglagde bibliotekssekvenseringstjeneste gjør det lettere for kunder å forberede sekvenseringsbibliotekene sine fra forskjellige kilder (mRNA, hele genom, amplicon, blant andre).Deretter kan disse bibliotekene sendes til våre sekvenseringssentre for kvalitetskontroll og sekvensering i Illumina- eller BGI-plattformer.
