Høydepunkter
I dette to timer lange nettseminaret er det vår store ære å ha invitert seks eksperter innen avlingsgenomikk.Våre foredragsholdere vil gi en grundig tolkning av to Rye genomiske studier, som nylig ble publisert påNaturgenetikk:
1. Genomsamling i kromosomskala gir innsikt i rugbiologi, evolusjon og agronomisk potensial
2. En genomsamling av høy kvalitet fremhever ruggenomiske egenskaper og agronomisk viktige gener
Vi er også glade for å ha senior FoU-forsker fra Biomarker Technologies til å dele sin erfaring med de novo genomsammenstilling.
Dagsorden
09:00 CET
Velkomstkommentarer
Zheng Hong-kun
Grunnlegger og administrerende direktør Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
President, School of Advanced Agricultural Sciences Peking University
09:15
Forbedrer forbedring av rug, triticale og hvete ved å bruke høykvalitets referansegenomsekvens
I dette nettseminaret ga Prof. Wang oss en generell oppdatering om nåværende status for triticeae genomisk forskning og demonstrerte suksessen og gjennombruddene til de to fremragende arbeidene med Rye-genomstudier, som nylig ble publisert på Nature Genetics og introduserer hele forskningen grupper som leder og bidrar i arbeidet.
09:25
Korngenomikk @ IPK Gatersleben
Korngress fra Triticeae-stammen har vært en viktig matkilde i tempererte områder, som lenge har vært sett på som et hotspot i avlingsforbedring og avl.Blant alle kultiverte arter er denne stammen kjent for sine ekstremt komplekse genomiske egenskaper, inkludert store genomstørrelser, høyt innhold av TE, polyploidi, etc. I denne økten ga Prof. Nils Stein oss en generell introduksjon om IPK Gatersleben og gjeldende status for korn. genomisk forskning@IPK Gatersleben.
09:35
Genomsamling i kromosomskala gir innsikt i rugbiologi, evolusjon og agronomisk potensial
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)Rug (Secale cereale L.) er en eksepsjonelt klimabestandig kornavling, som brukes mye for å produsere forbedrede hvetesorter via introgressiv hybridisering, og har hele repertoaret av gener som er nødvendig for å muliggjøre hybridforedling.Rug er allogam og først nylig domestisert, noe som gir kultivert rug tilgang til en mangfoldig og utnyttbar villgenpool.For ytterligere å forsterke rugs agronomiske potensiale produserte vi en kromosomskala-annotert samling av 7,9 Mbp ruggenomet, og validerte omfattende kvaliteten ved hjelp av en rekke molekylærgenetiske ressurser.Vi demonstrerer anvendelser av denne ressursen med et bredt spekter av undersøkelser.Vi presenterer funn om kultivert rugs ufullstendige genetiske isolasjon fra ville slektninger, mekanismer for genomets strukturelle evolusjon, patogenresistens, lavtemperaturtoleranse, fruktbarhetskontrollsystemer for hybridavl og utbyttefordelene ved rug-hvete-introgresjoner.
10:05
En genomsamling av høy kvalitet fremhever ruggenomiske egenskaper og agronomisk viktige gener
Rug er en verdifull mat- og fôravling, en viktig genetisk ressurs for forbedring av hvete og triticale, og et uunnværlig materiale for effektive komparative genomiske studier i gress.Her sekvenserte vi genomet til Weining rug, en elite kinesisk rugsort.De sammensatte contigs (7,74 Gb) utgjorde 98,47% av den estimerte genomstørrelsen (7,86 Gb), med 93,67% av contigs (7,25 Gb) tildelt syv kromosomer.Repeterende elementer utgjorde 90,31 % av det samlede genomet.Sammenlignet med tidligere sekvenserte Triticeae-genomer, viste retrotransposoner fra Daniela, Sumaya og Sumana sterk ekspansjon i rug.Ytterligere analyser av Weining-samlingen kaster nytt lys på genomomfattende genduplikasjoner og deres innvirkning på stivelsesbiosyntesegener, fysiske organisasjoner av komplekse prolamin-loki, genuttrykksfunksjoner som ligger til grunn for tidlig overskriftstrekk, og antatte domestiseringsassosierte kromosomale regioner og loki i rug.Denne genomsekvensen lover å akselerere genomikken og avlsstudiene av rug og relaterte kornavlinger.
10:35
Utfordringer, løsninger og fremtid for genom de novo-montering
Genom av høy kvalitet er grunnlaget for genomiske studier.Selv om den raske utviklingen innen sekvensering og algoritme har gitt en mye enklere og mer effektiv genomsammenstilling, øker også kravene til nøyaktighet og fullstendighet for sammenstilling med utdyping av forskningsmål.I denne foredraget vil jeg diskutere de nåværende populære teknologiene innen genomsamling med flere vellykkede tilfeller og ta et glimt av den fremtidige utviklingen.
Innleggstid: Jan-08-2022