BMKCloud Log in
条形banner-03

Nyheter

Nanopore-basert transkriptomsekvensering i full lengde

Nanopore-sekvensering skiller seg fra andre sekvenseringsplattformer ved at nukleotidene leses direkte uten DNA-syntese og genererer lange lesninger ved titalls kilobaser.Dette gir direkte lesing av full-lengde transkripsjoner og takler utfordringene i transkriptomiske studier.

√ Lav sekvensspesifikk skjevhet

√ Full-lengde avlesning av cDNA til for studier av genstruktur

√ Mindre data kreves for å dekke samme antall transkripsjoner

√ Identifikasjon av flere isoformer per gen

√ Uttrykk kvantifisering på isoform-nivå

nanopore-1

Typisk bioinformatikkpipeline

Full-lengde-trans-bix-1024x254

Siste vellykkede tilfeller med biomarkørteknologier

1. Sammenlignende analyser av full-lengde transkriptomer avslører Gnetum luofuense stammens utviklingsdynamikk

Tidsskrift: Frontiers in Genetics

Publisert: mars 2021

Nøkkelord: MinION |Alternativ skjøting |APA |lncRNA |Differensielt uttrykte transkripsjoner

Les fulltekst

2. Enveis bevegelse av små RNA-er fra skudd til røtter i interspesifikke heterografter

Tidsskrift: Naturplanter

Publisert: januar 2021

Nøkkelord: Nanopore |Illumina |full-lengde mobil mRNA-deteksjon

3. Full-lengde transkriptomanalyse av aspargesrøtter avslører den molekylære mekanismen for salttoleranse indusert av arbuskulære mykorrhizale sopp

Tidsskrift: Environmental and Experimental Botany

Publisert: januar 2021

Nøkkelord: MinION |Differensielt uttrykte transkripsjoner |Transkripsjonsfaktorer |Alternativ skjøting

4. Fysiologiske karakteristiske endringer og full-lengde transkriptom av rose (Rosa chinensis) røtter og blader som svar på tørkestress

Tidsskrift: Plante- og cellefysiologi

Publisert: oktober 2020

Nøkkelord: PromethION |Differensielt uttrykte transkripsjoner |Funksjonell prediksjon |Skjøte isoformer |TF og lncRNA

5. Analyse og omfattende sammenligning av PacBio og nanoporebasert RNA-sekvensering av Arabidopsis-transkriptomet

Journal: Plantemetode

Publisert: april 2020

Nøkkelord: GridION |PromethION |PacBio-oppfølger |Illumina NovaSeq |Genomjustering |Transkripsjonsidentifikasjon |Alternativ skjøting |SSR |LncRNA |Isoform kvantifisering

Nyheter og høydepunkter tar sikte på å dele de siste vellykkede tilfellene med Biomarker Technologies, fange nye vitenskapelige prestasjoner samt fremtredende teknikker brukt under studien.


Innleggstid: Jan-08-2022

Send din melding til oss: