MIKROBIELL
Bakteriell kompatibilitet og immobilisering med biokull forbedret nedbrytning av tebukonazol, jordmikrobiomsammensetning og funksjon
Full-lengde 16S amplicon sekvensering |PacBio HiFi |Alfa-mangfold |Beta-mangfold
I denne studien ble 16S amplikonsekvensering i full lengde av PacBio og bioinformatisk analyse levert av Biomarker Technologies.
Høydepunkter
Biokull-immobiliserte tebukonazol-nedbrytende bakterier Alcaligenes faecalis WZ-2 ble studert på biologisk nedbrytningseffektivitet og innvirkning på tebukonazolforurenset jord sammenlignet med fritt nedbrytende stamme WZ-2.
1. Biochar-immobilisert WZ-2 viste en mer effektiv nedbrytning i tebukonazol sammenlignet med fri WZ-2 ved å redusere tebukonazols halveringstid i jord fra 18,7 dager til 13,3 dager.
2. Biochar-immobilisert WZ-2 var i stand til å gjenopprette naturlige mikrobielle enzymaktiviteter i jord, inkludert urease, dehydrogenase og invertase, etc.
3. Mikrobiell profil i biokull-immobilisert WZ-2-behandlet jord bestemt ved full-lengde 16S-sekvensering støttet sterkt at dette systemet kunne gjenopprette jordhelsen ved å forbedre bakteriesamfunnets struktur under tebukonazol-forurensning.
Eksperiment (sekvensrelatert)
Gruppering: CK: Naturlig jord;T: Jord tilsatt tebukonazol;S: Tebukonazol inneholdt jord med fri stamme WZ-2;BC: Tebukonazol inneholdt jord med biokull;BCS: Tebukonazol inneholdt jord med biokull immobilisert WZ-2.
Prøvetaking: Total jord-DNA-ekstraksjon amplifisert med 16S rDNA-primere
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') og 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),representerende 16S rDNA i full lengde
Sekvenseringsplattform: PacBio RS II
Sekvenseringsstrategi: CCS HIFI leser
Dataanalyse:BMKCloudBioinformatisk plattform gjør gullfisk til et utmerket genetisk modellsystem for fiskens fysiologi og evolusjon.
Resultat
Jords mikrobielle samfunnsstruktur ble bestemt ved 16S rDNA-sekvensering.OTU-rikdom og alfa-diversitetsindeks, inkludert Chao1, Ace, Shannon og Simpson-indekser ble evaluert for å avsløre artsmangfoldet i hvert system.Etter 60 dagers inkubasjon viste alle indekser lignende trend, dvs. tebukonazol kunne indusere reduksjon i artsrikdom og mangfold i jord.Ved å legge til stamme WZ-2 ble imidlertid jordbakteriesamfunnet delvis gjenvunnet når det gjelder både rikdom og mangfold.Begrenset forskjell ble observert mellom BC, BCS og CK, noe som indikerer at biokull og biokull-immobilisert WZ-2 effektivt kunne gjenopprette jords biologiske helse.
Unweighted Pair-group Method with Arithmetic Means (UPGMA) ble brukt i denne studien for å vise beta-mangfold blant grupper.Som vist i den følgende figuren, delte BC, BSC og CK mer likt mønster av mikrobiell sammensetning sammenlignet med gruppe T og S, noe som ytterligere indikerte at introduksjon av biokull i tebukonazol-forurenset jordbioremediering i stor grad kunne lette utvinning av mikrobielle samfunn i jorda.
Figur.UPGMA klynging av bakteriesamfunn på filumnivå under forskjellig behandling
Henvisning
Sun, Tong, et al."Bakteriell kompatibilitet og immobilisering med biokull forbedret nedbrytning av tebukonazol, jordmikrobiomsammensetning og funksjon."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Nyheter og høydepunkter har som mål å dele de siste vellykkede tilfellene med Biomarker Technologies, fange nye vitenskapelige prestasjoner samt fremtredende teknikker brukt under studien.
Innleggstid: Jan-08-2022