-
Proteomikk
Proteomikk innebærer anvendelse av teknologier for kvantifisering av det totale proteininnholdet i en celle, vev eller en organisme.Proteomikk-baserte teknologier brukes i ulike kapasiteter for ulike forskningsmiljøer som påvisning av ulike diagnostiske markører, kandidater for vaksineproduksjon, forståelse av patogenisitetsmekanismer, endring av uttrykksmønstre som respons på ulike signaler og tolkning av funksjonelle proteinveier i ulike sykdommer.For tiden er kvantitative proteomikkteknologier hovedsakelig delt inn i TMT, Label Free og DIA kvantitative strategier.
-
Metabolomikk
Metabolomet er det terminale nedstrømsproduktet av genomet og består av det totale komplementet av alle lavmolekylære molekyler (metabolitter) i en celle, vev eller organisme.Metabolomics har som mål å måle en bred bredde av små molekyler i sammenheng med fysiologiske stimuli eller sykdomstilstander.Metabolomikk-metodologier faller inn i to distinkte grupper: ikke-målrettet metabolomikk, en tiltenkt omfattende analyse av alle målbare analytter i en prøve, inkludert kjemiske ukjente ved bruk av GC-MS/LC-MS, og målrettet metabolomikk, måling av definerte grupper av kjemisk karakteriserte og biokjemisk annoterte metabolitter.
-
Bulk Segregant-analyse
Bulked segregant analyse (BSA) er en teknikk som brukes for raskt å identifisere fenotype-assosierte genetiske markører.Hovedarbeidsflyten til BSA inneholder å velge ut to grupper av individer med ekstremt motstridende fenotyper, slå sammen DNAet til alle individer for å danne to bulker av DNA, identifisere differensielle sekvenser mellom to bassenger.Denne teknikken har blitt mye brukt for å identifisere genetiske markører som er sterkt assosiert med målrettede gener i plante-/dyre-genomer.
-
DNA/RNA-sekvensering – Nanopore-sekvensering
ONT-sekvensering er et enkelt molekyl i sanntid for elektrisk signalsekvenseringsteknologi basert på nanoporer, sekvenseringsprinsippet for hver plattform er det samme.Dobbelttrådet DNA/RNA vil binde seg til nanoporøst protein innebygd i biofilmen og vikle seg av under ledning av motorprotein, under påvirkning av spenningsforskjell fra begge sider av biofilmen, passerer DNA/RNA-tråder gjennom nanoporekanalproteinet ved en viss vurdere.På grunn av forskjellene i de kjemiske egenskapene til de forskjellige basene på DNA/RNA-strengen, vil når en enkelt base eller DNA-molekyl passerer gjennom nanoporekanalen, forårsake endring av forskjellige elektriske signaler.Ved å detektere og korrespondere med disse signalene kan de tilsvarende basetypene beregnes, og sanntidsdeteksjonen av sekvensen kan fullføres.
-
DNA/RNA-sekvensering -PacBio Sequencer
PacBio sekvenseringsplattform er en langlest sekvenseringsplattform, som også er kjent som en av Third-Generation Sequencing (TGS)-teknologiene.Kjerneteknologien, enkeltmolekyl-sanntid (SMRT), muliggjør generering av avlesninger med titalls kilo-base i lengde.På grunnlag av "Sequencing-by-Synthesis" oppnås enkeltnukleotidoppløsning ved hjelp av Zero-mode waveguide (ZMW), hvor bare begrenset volum ved bunnen (stedet for molekylsyntese), er opplyst.I tillegg unngår SMRT-sekvensering i stor grad sekvensspesifikk skjevhet i NGS-systemet, ved at de fleste PCR-amplifikasjonstrinn ikke er nødvendig i bibliotekkonstruksjonsprosessen.
Plattform: Oppfølger II, Revio
