BMKGENE ga romlige transkriptomsekvenseringstjenester for studien "STEEL muliggjør høyoppløsningsavgrensning av spatiotemporale transkriptomiske data", som ble publisert i Briefings in Bioinformatics.
Denne studien foreslo en uovervåket og mangfoldig læringsbasert algoritme, Spatial Transcriptome cEll type clustering (STEEL), som identifiserer domener fra romlig transkriptom ved å gruppere perler som viser både svært like genuttrykksprofiler og nær romlig avstand på samme måte som grafer.
En omfattende evaluering av STEEL på romlige transkriptomiske datasett fra 10X Visium-plattformen viser at den ikke bare oppnår en høy oppløsning for å karakterisere fine strukturer i musehjernen, men også muliggjør integrering av flere vevsbilder individuelt analysert til en større.
Med utviklingen av romlige transkriptomteknologier vil metoden vår ha stor anvendelighet i domeneidentifikasjon og genuttrykksatlasrekonstruksjon.
Klikkherfor å lære mer om denne studien.
Innleggstid: 20. oktober 2023