En viktig hagebrukskarakteristikk som skiller navleappelsiner fra andre vanlige søte appelsinvarianter er tilstedeværelsen av en navle på frukten.Denne funksjonen er også et viktig kriterium for klassifisering av søte oransje hagebruksvarianter.
BMKGENEs kunder brukte BMKGENEs egenutviklede SLAF-sekvenseringsteknologi for å gjennomføre en studie med tittelen "Gruvegener relatert til fruktkvalitet i søte appelsiner basert på spesifikk Locus Amplified Fragment Sequencing."
Studien involverte sekvensering av 240 søte oransje kimplasmaressurser med stort genetisk mangfold og ulik geografisk opprinnelse, noe som resulterte i 497,82 Mb med kortlest data.Analyse av dataene ga 1 467 968 SNP-genotyper over hele genomet.Ved å bruke Fst-analyse identifiserte studien 6 kandidatgener relatert til tilstedeværelsen av en navle, fruktvekt og titrerbar surhet, og ga grunnlag for målrettet forbedring av søte appelsinvarianter.
For storskala populasjonssekvensering er spesifikk locus amplifisert fragmentsekvensering (SLAF) mer kostnadseffektiv og høyeffektiv sammenlignet med helgenomsekvensering (WGS).
Klikkherfor å lære mer om denne studien.
Innleggstid: Des-05-2023