● Svært erfaren: Over 200 000 prøver har blitt behandlet i BMK som dekker ulike prøvetyper, inkludert cellekultur, vev, kroppsvæske, etc. og over 7000 mRNA-Seq-prosjekter stengt som dekker ulike forskningsområder.
● Strengt kvalitetskontrollsystem: Kjernekvalitetskontrollpunkter gjennom alle trinn, inkludert prøveforberedelse, bibliotekforberedelse, sekvensering og bioinformatikk er under nøye overvåking for å levere resultater av høy kvalitet.
● Flere databaser tilgjengelig for funksjonsannotering og berikelsesstudier for å oppfylle ulike forskningsmål.
● Ettersalgstjenester: Ettersalgstjenester gyldig i 3 måneder etter ferdigstillelse av prosjektet, inkludert prosjektoppfølging, feilsøking, spørsmål og svar på resultater osv.
Bibliotek | Sekvenseringsstrategi | Data anbefales | Kvalitetskontroll |
Poly A beriket | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85 % |
Nukleotider:
Kons.(ng/μl) | Mengde (μg) | Renhet | Integritet |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Begrenset eller ingen protein- eller DNA-kontaminering vist på gel. | For planter: RIN≥6,5; For dyr: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; begrenset eller ingen grunnlinjehøyde |
Vev: Vekt (tørr):≥1 g
*For vev mindre enn 5 mg anbefaler vi å sende hurtigfrosset (i flytende nitrogen) vevsprøve.
Cellesuspensjon:Celletall = 3×106- 1×107
*Vi anbefaler å sende frosset cellelysat.I tilfelle den cellen teller mindre enn 5×105.
Blodprøver:Volum ≥1 ml
Mikroorganisme:Masse ≥ 1 g
Beholder: 2 ml sentrifugerør (tinnfolie anbefales ikke)
Prøvemerking: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Forsendelse:
Bioinformatikk
Eukaryot Arbeidsflyt for mRNA-sekvensanalyse
Bioinformatikk
ØKvalitetskontroll av rådata
ØReferansegenomjustering
ØTranskripsjonsstrukturanalyse
ØKvantifisering av uttrykk
ØDifferensiell uttrykksanalyse
ØFunksjonsanmerkning og berikelse
1.mRNA Data Metningskurve
2.Differensialekspresjonsanalyse-Vulkanplott
3.KEGG-kommentar på DEG
4.GO-klassifisering på DEG