BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Eukaryotisk mRNA-sekvensering-Illumina

mRNA-sekvensering muliggjør profilering av alle mRNA-er transkribert fra celler under spesifikke forhold.Det er en kraftig teknologi for å avsløre genekspresjonsprofil, genstrukturer og molekylære mekanismer for visse biologiske prosesser.Til dags dato har mRNA-sekvensering vært mye brukt i grunnleggende forskning, klinisk diagnostikk, medikamentutvikling, etc.

Plattform: Illumina NovaSeq-plattformen


Tjenestedetaljer

Bioinformatikk

Demo resultater

Fordeler

● Svært erfaren: Over 200 000 prøver har blitt behandlet i BMK som dekker ulike prøvetyper, inkludert cellekultur, vev, kroppsvæske, etc. og over 7000 mRNA-Seq-prosjekter stengt som dekker ulike forskningsområder.

● Strengt kvalitetskontrollsystem: Kjernekvalitetskontrollpunkter gjennom alle trinn, inkludert prøveforberedelse, bibliotekforberedelse, sekvensering og bioinformatikk er under nøye overvåking for å levere resultater av høy kvalitet.

● Flere databaser tilgjengelig for funksjonsannotering og berikelsesstudier for å oppfylle ulike forskningsmål.

● Ettersalgstjenester: Ettersalgstjenester gyldig i 3 måneder etter ferdigstillelse av prosjektet, inkludert prosjektoppfølging, feilsøking, spørsmål og svar på resultater osv.

Prøvekrav og levering

Bibliotek Sekvenseringsstrategi Data anbefales Kvalitetskontroll
Poly A beriket Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Eksempelkrav:

Nukleotider:

Kons.(ng/μl)

Mengde (μg)

Renhet

Integritet

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Begrenset eller ingen protein- eller DNA-kontaminering vist på gel.

For planter: RIN≥6,5;

For dyr: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begrenset eller ingen grunnlinjehøyde

Vev: Vekt (tørr):≥1 g
*For vev mindre enn 5 mg anbefaler vi å sende hurtigfrosset (i flytende nitrogen) vevsprøve.

Cellesuspensjon:Celletall = 3×106- 1×107
*Vi anbefaler å sende frosset cellelysat.I tilfelle den cellen teller mindre enn 5×105.

Blodprøver:Volum ≥1 ml

Mikroorganisme:Masse ≥ 1 g

Anbefalt prøvelevering

Beholder: 2 ml sentrifugerør (tinnfolie anbefales ikke)

Prøvemerking: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Forsendelse:

  1. Tørris: Prøver må pakkes i poser og begraves i tørris.
  2. RNAstabile rør: RNA-prøver kan tørkes i RNA-stabiliseringsrør (f.eks. RNAstable®) og sendes i romtemperatur.

Servicearbeidsflyt

Prøve QC

Eksperimentdesign

prøvelevering

Prøvelevering

Piloteksperiment

RNA-ekstraksjon

Bibliotekforberedelse

Bygging av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Bioinformatikk

    wps_doc_10

    Eukaryot Arbeidsflyt for mRNA-sekvensanalyse

    Bioinformatikk

    ØKvalitetskontroll av rådata

    ØReferansegenomjustering

    ØTranskripsjonsstrukturanalyse

    ØKvantifisering av uttrykk

    ØDifferensiell uttrykksanalyse

    ØFunksjonsanmerkning og berikelse

    1.mRNA Data Metningskurve

    3(1)

    2.Differensialekspresjonsanalyse-Vulkanplott

    4(1)

    3.KEGG-kommentar på DEG

    5(1)

    4.GO-klassifisering på DEG

    6(1)

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: