BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Illumina og BGI

Illumina sekvenseringsteknologi, basert på Sequencing by Synthesis (SBS), er en globalt omfavnet NGS-innovasjon, ansvarlig for å generere over 90 % av verdens sekvenseringsdata.Prinsippet til SBS involverer avbildning av fluorescensmerkede reversible terminatorer når hver dNTP tilsettes og deretter spaltes for å tillate inkorporering av neste base.Med alle fire reversible terminator-bundne dNTP-er tilstede i hver sekvenseringssyklus, minimerer naturlig konkurranse inkorporeringsskjevhet.Denne allsidige teknologien støtter både enkeltleste og parede biblioteker, og passer til en rekke genomiske applikasjoner.Illumina-sekvenseringens evner og presisjon med høy gjennomstrømning posisjonerer den som en hjørnestein i genomisk forskning, og gir forskere mulighet til å avdekke vanskelighetene til genomene med uovertruffen detaljer og effektivitet.

DNBSEQ, utviklet av BGI, er en annen innovativ NGS-teknologi som har klart å redusere sekvenseringskostnadene ytterligere og øke gjennomstrømningen.Utarbeidelse av DNBSEQ-biblioteker involverer DNA-fragmentering, klargjøring av ssDNA og rullende sirkelamplifisering for å oppnå DNA-nanokulene (DNB).Disse blir deretter lastet på en solid overflate og deretter sekvensert ved kombinatorisk probe-ankersyntese (cPAS).

Vår ferdiglagde bibliotekssekvenseringstjeneste gjør det lettere for kunder å forberede sekvenseringsbibliotekene sine fra forskjellige kilder (mRNA, hele genom, amplicon, blant andre).Deretter kan disse bibliotekene sendes til våre sekvenseringssentre for kvalitetskontroll og sekvensering i Illumina- eller BGI-plattformer.


Tjenestedetaljer

Demo resultat

Egenskaper

Plattformer:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten og BGI-DNB-T7

Sekvenseringsmoduser:PE50, PE100, PE150, PE250

Kvalitetskontroll av bibliotek før sekvensering

Sekvenseringsdatalevering og kvalitetskontroll:levering av QC-rapport og rådata i fastq-format etter demultipleksing og filtrering av Q30-lesninger.

 

Tjenestefordeler

Allsidighet av sekvenseringstjenester:kunden kan velge å sekvensere etter bane, flytcelle eller datamengde.

Allsidighet av plattformer:DNB-biblioteker kan overføres til Illumina-plattformer

Omfattende erfaring med Illumina sekvenseringsplattform:med tusenvis av lukkede prosjekter med ulike arter. 

Levering av sekvenserings-QC-rapport:med kvalitetsmålinger, datanøyaktighet og generell ytelse for sekvenseringsprosjektet.

Moden sekvenseringsprosess:med kort omløpstid.

Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer strenge kvalitetskontrollkrav for å garantere levering av konsekvent høykvalitetsresultater.

Eksempelkrav*

Delvis kjørefeltsekvensering

Datamengde (X)

Konsentrasjon (qPCR/nM)

Volum

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Enkeltfelt (Illumina)

Plattform

Konsentrasjon (qPCR/nM)

Volum

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 I tillegg til konsentrasjon og totalmengde kreves det også et passende toppmønster.

 

Ta kontakt med oss ​​hvis prøvene dine ikke oppfyller kravene til utgangsmateriale.

Tjenestearbeidsflyt

prøveforberedelse

Kvalitetskontroll av biblioteket

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Datakvalitetskontroll

Prøve QC

Prosjektleveranse


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Bibliotek QC-rapport

    En rapport om kvaliteten på biblioteket leveres før sekvensering, vurdering av bibliotekmengde og fragmentering.

     

    Sekvenserings-QC-rapport

     

    Tabell 1. Statistikk over sekvenseringsdata.

    Eksempel-ID

    BMKID

    Rå leser

    Rådata (bp)

    Rene avlesninger (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6 861 036 000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Figur 1. Kvalitetsfordeling langs avlesninger i hver prøve

    A9

    Figur 2. Basisinnholdsdistribusjon

    A10

    Figur 3. Fordeling av lest innhold i sekvenseringsdata

    A11

     

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: