●Plattformer:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten og BGI-DNB-T7
●Sekvenseringsmoduser:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kvalitetskontroll av bibliotek før sekvensering
●Sekvenseringsdatalevering og kvalitetskontroll:levering av QC-rapport og rådata i fastq-format etter demultipleksing og filtrering av Q30-lesninger.
●Allsidighet av sekvenseringstjenester:kunden kan velge å sekvensere etter bane, flytcelle eller datamengde.
●Allsidighet av plattformer:DNB-biblioteker kan overføres til Illumina-plattformer
●Omfattende erfaring med Illumina sekvenseringsplattform:med tusenvis av lukkede prosjekter med ulike arter.
●Levering av sekvenserings-QC-rapport:med kvalitetsmålinger, datanøyaktighet og generell ytelse for sekvenseringsprosjektet.
●Moden sekvenseringsprosess:med kort omløpstid.
●Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer strenge kvalitetskontrollkrav for å garantere levering av konsekvent høykvalitetsresultater.
Datamengde (X) | Konsentrasjon (qPCR/nM) | Volum |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Plattform | Konsentrasjon (qPCR/nM) | Volum |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
I tillegg til konsentrasjon og totalmengde kreves det også et passende toppmønster.
En rapport om kvaliteten på biblioteket leveres før sekvensering, vurdering av bibliotekmengde og fragmentering.
Tabell 1. Statistikk over sekvenseringsdata.
Eksempel-ID | BMKID | Rå leser | Rådata (bp) | Rene avlesninger (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figur 1. Kvalitetsfordeling langs avlesninger i hver prøve
Figur 2. Basisinnholdsdistribusjon
Figur 3. Fordeling av lest innhold i sekvenseringsdata