Bakterier komplett genom

Biomarker Technologies tilbyr sekvenseringstjeneste for å konstruere komplett genom av bakterier med null gap.Hovedarbeidsflyten for komplett genomkonstruksjon av bakterier inkluderer tredjegenerasjons sekvensering, montering, funksjonell merknad og avansert bioinformatisk analyse som oppfyller spesifikke forskningsmål.En mer omfattende profilering av bakteriegenomet styrker avsløringen av grunnleggende mekanismer som ligger til grunn for deres biologiske prosesser, som også kan gi verdifull referanse for genomisk forskning i høyere eukaryote arter

Plattform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq-plattform

PacBio oppfølger II

Kontakt oss

Tjenestedetaljer

Demo resultater

Tjenestefordeler

● Flere sekvenseringsstrategier tilgjengelig for ulike forskningsmål

● Bakterier komplett genom med 0 Gap garantert.

● Svært erfaren i bakteriegenomsamling med over 10 000 komplette genom satt sammen.

● Profesjonelt ettersalgs teknisk supportteam som oppfyller mer spesifikke forskningsbehov.

Tjenestespesifikasjoner

SekvenseringStrategi

Bibliotek

Kvalitet garantert

Beregnet behandlingstid

Nanopore 100X + Illumina 50X

Nanopore 20K

PE150

0 Gap

30 dager

PacBio HiFi 30X

PacBio 10K

Bioinformatikkanalyser

● Kvalitetskontroll av rådata

● Genomsamling

● Genomkomponentanalyse

● Annotering av genfunksjon

● Komparativ genomisk analyse

Prøvekrav og levering

Eksempelkrav:

TilDNA-ekstrakter:

Eksempeltype	Beløp	Konsentrasjon	Renhet
DNA-ekstrakter	＞ 2 μg	＞ 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

For vevsprøver:

Prøvetype

Anbefalt prøvebehandling

Prøvelagring og forsendelse

Bakterie

Observer bakterier under mikroskop og samle bakterier i deres eksponentielle fase

Overfør bakteriekulturen (som inneholder ca. 3-4.5e9-celler) til en 1,5 eller 2 ml eppendorf.(Hold deg på is)

Sentrifuger røret i 1 min ved 14000 g for å samle bakterier og fjern supernatanten forsiktig

Forsegl røret og frys bakteriene i flytende nitrogen i minst 30 min.Oppbevar røret i -80 ℃ kjøleskap.

Frys prøvene i flytende nitrogen i 3-4 timer og oppbevar i flytende nitrogen eller -80 grader til langtidsreservasjon.Prøvefrakt med tørris er nødvendig.