-
RNA-sequencing met één kern
De vooruitgang in het vastleggen van afzonderlijke cellen en de constructietechniek van individuele bibliotheken, gecombineerd met sequencing met hoge doorvoer, maakt studies van genexpressie per cel mogelijk.Het maakt een diepere en complete systeemanalyse van complexe celpopulaties mogelijk, waarbij grotendeels wordt vermeden dat de heterogeniteit ervan wordt gemaskeerd door het gemiddelde van alle cellen te nemen.
Sommige cellen zijn echter niet geschikt om in eencellige suspensie te worden verwerkt, dus zijn er andere monstervoorbereidingsmethoden nodig – kernextractie uit weefsels, dat wil zeggen dat de kern rechtstreeks uit weefsels of cellen wordt geëxtraheerd en tot een enkele kernsuspensie wordt bereid voor single-nucleus suspensie. celsequencing.
BMK biedt 10× Genomics ChromiumTM-gebaseerde eencellige RNA-sequencing-service.Deze dienst wordt op grote schaal gebruikt in onderzoeken naar ziektegerelateerde onderzoeken, zoals differentiatie van immuuncellen, heterogeniteit van tumoren, weefselontwikkeling, enz.
Ruimtelijke transcriptoomchip: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
BMKMANU S1000 Ruimtelijk transcriptoom
Ruimtelijke transcriptomics lopen voorop bij wetenschappelijke innovatie en stellen onderzoekers in staat zich te verdiepen in ingewikkelde genexpressiepatronen in weefsels, terwijl hun ruimtelijke context behouden blijft.Te midden van verschillende platforms heeft BMKGene de BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip ontwikkeld, met eenverbeterde resolutievan 5 µM, waardoor het subcellulaire bereik wordt bereikt en mogelijk wordt gemaaktresolutie-instellingen op meerdere niveaus.De S1000-chip, met ongeveer 2 miljoen spots, maakt gebruik van microwells gelaagd met kralen geladen met ruimtelijk gecodeerde capture-sondes.Een cDNA-bibliotheek, verrijkt met ruimtelijke barcodes, wordt bereid vanaf de S1000-chip en vervolgens gesequenced op het Illumina NovaSeq-platform.De combinatie van ruimtelijk gebarcodeerde monsters en UMI's garandeert de nauwkeurigheid en specificiteit van de gegenereerde gegevens.Het unieke kenmerk van de BMKManu S1000-chip ligt in zijn veelzijdigheid, die resolutie-instellingen op meerdere niveaus biedt die nauwkeurig kunnen worden afgestemd op verschillende weefsels en detailniveaus.Dit aanpassingsvermogen positioneert de chip als een uitstekende keuze voor diverse ruimtelijke transcriptomics-studies, waardoor nauwkeurige ruimtelijke clustering met minimale ruis wordt gegarandeerd.
Met behulp van de BMKManu S1000-chip en andere ruimtelijke transcriptomics-technologieën kunnen onderzoekers een beter inzicht krijgen in de ruimtelijke organisatie van cellen en de complexe moleculaire interacties die plaatsvinden in weefsels, waardoor waardevolle inzichten worden verkregen in de mechanismen die ten grondslag liggen aan biologische processen op een groot aantal gebieden, waaronder oncologie, neurowetenschappen, ontwikkelingsbiologie, immunologie en botanische studies.
Platform: BMKManu S1000-chip en Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium ruimtelijk transcriptoom
Ruimtelijke transcriptomics is een geavanceerde technologie waarmee onderzoekers genexpressiepatronen in weefsels kunnen onderzoeken terwijl hun ruimtelijke context behouden blijft.Een krachtig platform op dit gebied is 10x Genomics Visium in combinatie met Illumina-sequencing.Het principe van 10X Visium ligt op een gespecialiseerde chip met een aangewezen opvanggebied waar weefselcoupes worden geplaatst.Dit opnamegebied bevat streepjescodes, die elk overeenkomen met een unieke ruimtelijke locatie in het weefsel.De gevangen RNA-moleculen uit het weefsel worden vervolgens tijdens het omgekeerde transcriptieproces gelabeld met unieke moleculaire identificatiegegevens (UMI's).Deze streepjescodes en UMI's maken nauwkeurige ruimtelijke mapping en kwantificering van genexpressie met een resolutie van één cel mogelijk.De combinatie van ruimtelijk gebarcodeerde monsters en UMI's garandeert de nauwkeurigheid en specificiteit van de gegenereerde gegevens.Door deze Spatial Transcriptomics-technologie te gebruiken, kunnen onderzoekers een dieper inzicht krijgen in de ruimtelijke organisatie van cellen en de complexe moleculaire interacties die plaatsvinden in weefsels, wat waardevolle inzichten oplevert in de mechanismen die ten grondslag liggen aan biologische processen op meerdere gebieden, waaronder oncologie, neurowetenschappen, ontwikkelingsbiologie en immunologie. en botanische studies.
Platform: 10X Genomics Visium en Illumina NovaSeq
