-
BSA
Het Bulked Segregant Analysis-platform bestaat uit standaardanalyse in één stap en geavanceerde analyse met aangepaste parameterinstelling.BSA is een techniek die wordt gebruikt om snel fenotype-geassocieerde genetische markers te identificeren.De belangrijkste workflow van BSA omvat: 1. het selecteren van twee groepen individuen met extreem tegengestelde fenotypes;2. het samenvoegen van het DNA, RNA of SLAF-seq (ontwikkeld door Biomarker) van alle individuen om twee grote hoeveelheden DNA te vormen;3. het identificeren van differentiële sequenties ten opzichte van het referentiegenoom of daartussenin, 4. het voorspellen van kandidaat-gekoppelde regio's door middel van ED en SNP-indexalgoritme;5. Functionele analyse en verrijking van genen in kandidaatregio's, enz. Meer geavanceerde datamining, waaronder screening van genetische markers en primerontwerp, is ook beschikbaar.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Het Amplicon (16S/18S/ITS)-platform is ontwikkeld met jarenlange ervaring in projectanalyse van microbiële diversiteit, dat gestandaardiseerde basisanalyse en gepersonaliseerde analyse bevat: basisanalyse omvat de reguliere analyse-inhoud van huidig microbieel onderzoek, de analyse-inhoud is rijk en alomvattend, en analyseresultaten worden gepresenteerd in de vorm van projectrapporten;De inhoud van gepersonaliseerde analyses is divers.Er kunnen monsters worden geselecteerd en de parameters kunnen flexibel worden ingesteld op basis van het basisanalyserapport en het onderzoeksdoel, om gepersonaliseerde vereisten te realiseren.Windows-besturingssysteem, eenvoudig en snel.
-
Evolutionaire genetica
Evolutionaire genetica is een complete sequencing-service die is ontworpen voor het bieden van een alomvattende interpretatie van evolutionaire informatie van bepaalde materialen op basis van genetische variaties, waaronder SNP's, InDels, SV's en CNV's.Het biedt alle fundamentele analyses die nodig zijn voor het beschrijven van evolutionaire veranderingen en genetische kenmerken van populaties, zoals populatiestructuur, genetische diversiteit, fylogenierelaties, enz. Het bevat ook studies over genstroom, wat een schatting van de effectieve populatieomvang en de divergentietijd mogelijk maakt.
-
Vergelijkende genomica
Vergelijkende genomica betekent letterlijk het vergelijken van de volledige genoomsequenties en structuren van verschillende soorten.Deze discipline heeft tot doel de evolutie van de soort, de genfunctie en het genregulerende mechanisme op genoomniveau te onthullen door de sequentiestructuren en elementen te identificeren die bij verschillende soorten zijn geconserveerd of gedifferentieerd.Typisch vergelijkend genomicsonderzoek omvat analyses van de genfamilie, evolutionaire ontwikkeling, duplicatie van het hele genoom, selectieve druk, enz.
-
Evolutionaire genetica
Het platform voor populatie- en evolutionaire genetische analyse is opgericht op basis van de enorme ervaring die jarenlang is opgebouwd binnen het BMK R&D-team.Het is een gebruiksvriendelijk hulpmiddel, vooral voor onderzoekers die geen hoofdvak in bio-informatica hebben.Dit platform maakt fundamentele evolutionaire genetica-gerelateerde basisanalyses mogelijk, waaronder fylogenetische boomconstructie, koppelingsonevenwichtsanalyse, beoordeling van genetische diversiteit, selectieve sweepanalyse, verwantschapsanalyse, PCA, analyse van populatiestructuur, enz.
-
Op Hi-C gebaseerde Genome Assembly
Hi-C is een methode die is ontworpen om de chromosoomconfiguratie vast te leggen door het combineren van op nabijheid gebaseerde interacties en sequencing met hoge doorvoer.Aangenomen wordt dat de intensiteit van deze interacties negatief gecorreleerd is met de fysieke afstand op chromosomen.Daarom zouden Hi-C-gegevens de clustering, ordening en oriëntatie van samengestelde sequenties in een conceptgenoom kunnen begeleiden en deze op een bepaald aantal chromosomen kunnen verankeren.Deze technologie maakt een genoomassemblage op chromosoomniveau mogelijk bij gebrek aan een populatiegebaseerde genetische kaart.Elk afzonderlijk genoom heeft een Hi-C nodig.
Platform: Illumina NovaSeq-platform / DNBSEQ
-
Plant/dier De Novo genoomsequencing
De Novosequencing verwijst naar de constructie van het volledige genoom van een soort met behulp van sequencing-technologieën, bijvoorbeeld PacBio, Nanopore, NGS, enz., bij afwezigheid van een referentiegenoom.De opmerkelijke verbetering in de leeslengte van sequencingtechnologieën van de derde generatie heeft nieuwe mogelijkheden opgeleverd bij het samenstellen van complexe genomen, zoals die met een hoge heterozygositeit, een hoog percentage repetitieve gebieden, polyploïden, enz. Met een leeslengte op tientallen kilobasenniveau maken deze sequencing-lezingen het mogelijk oplossen van repetitieve elementen, regio's met abnormale GC-inhoud en andere zeer complexe regio's.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq-platform
-
Menselijke hele exome-sequencing
Whole exome sequencing (WES) wordt beschouwd als een kosteneffectieve sequencingstrategie voor het identificeren van ziekteveroorzakende mutaties.Hoewel exons slechts ongeveer 1,7% van het gehele genoom in beslag nemen, vertegenwoordigt dit rechtstreeks het profiel van de totale eiwitfuncties.Er is gerapporteerd dat meer dan 85% van de ziektegerelateerde mutaties in het menselijk genoom voorkomen in het eiwitcoderende gebied.
BMKGENE biedt uitgebreide en flexibele sequencingdiensten voor het hele exoom van mensen, waarbij verschillende strategieën voor het vastleggen van exonen beschikbaar zijn om aan verschillende onderzoeksdoelen te voldoen.
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
Specifieke locus versterkte fragmentsequencing (SLAF-Seq)
High-throughput genotypering, vooral bij grootschalige populaties, is een fundamentele stap in genetische associatiestudies, die een genetische basis biedt voor functionele genontdekking, evolutionaire analyse, enz. In plaats van diepgaande re-sequencing van het hele genoom, wordt er gebruik gemaakt van ‘reduced representation genome sequencing’ (RRGS). ) wordt geïntroduceerd om de sequentiekosten per monster te minimaliseren, terwijl een redelijke efficiëntie bij het ontdekken van genetische markers behouden blijft.Dit wordt gewoonlijk bereikt door het restrictiefragment binnen een bepaald groottebereik te extraheren, dat de gereduceerde representatiebibliotheek (RRL) wordt genoemd.Specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) is een zelf ontwikkelde strategie voor SNP-genotypering met of zonder referentiegenoom.
Platform: Illumina NovaSeq-platform -
Illumina en BGI
De Illumina-sequencingtechnologie, gebaseerd op Sequencing by Synthesis (SBS), is een wereldwijd omarmde NGS-innovatie, die verantwoordelijk is voor het genereren van meer dan 90% van 's werelds sequencinggegevens.Het principe van SBS omvat het afbeelden van fluorescent gelabelde omkeerbare terminators wanneer elke dNTP wordt toegevoegd en vervolgens wordt gesplitst om de opname van de volgende base mogelijk te maken.Omdat alle vier de omkeerbare terminator-gebonden dNTP's aanwezig zijn in elke sequencingcyclus, minimaliseert natuurlijke concurrentie de incorporatiebias.Deze veelzijdige technologie ondersteunt zowel single-read als paired-end bibliotheken, geschikt voor een reeks genomische toepassingen.De hoge doorvoercapaciteiten en precisie van Illumina-sequencing positioneren het als een hoeksteen in genomicsonderzoek, waardoor wetenschappers de complexiteit van genomen kunnen ontrafelen met ongeëvenaarde details en efficiëntie.
DNBSEQ, ontwikkeld door BGI, is een andere innovatieve NGS-technologie die erin is geslaagd de sequencing-kosten verder te verlagen en de doorvoer te verhogen.De bereiding van DNBSEQ-bibliotheken omvat DNA-fragmentatie, bereiding van ssDNA en rolling-circle-amplificatie om de DNA-nanoballen (DNB) te verkrijgen.Deze worden vervolgens op een vast oppervlak geladen en vervolgens gesequenced door combinatorische Probe-Anchor Synthesis (cPAS).
Onze kant-en-klare bibliotheeksequencing-service faciliteert klanten bij het voorbereiden van hun sequencing-bibliotheken uit verschillende bronnen (onder andere mRNA, volledig genoom, amplicon).Vervolgens kunnen deze bibliotheken naar onze sequencingcentra worden verzonden voor kwaliteitscontrole en sequencing op Illumina- of BGI-platforms.
