PacBio-transcriptoom van volledige lengte (niet-referentie)
Door Pacific Biosciences (PacBio) Isoform-sequencinggegevens als invoer te gebruiken, kan deze app transcriptsequenties van volledige lengte identificeren (zonder assemblage).Door sequenties van volledige lengte in kaart te brengen tegen het referentiegenoom, kunnen transcripten worden geoptimaliseerd door bekende genen, transcripten, coderende gebieden, enz. In dit geval kan een nauwkeurigere identificatie van mRNA-structuren, zoals alternatieve splitsing, enz. worden bereikt.Gezamenlijke analyse met NGS-transcriptoomsequencinggegevens maakt uitgebreidere annotatie en nauwkeurigere kwantificering van de expressie op transcriptniveau mogelijk, wat grotendeels ten goede komt aan de stroomafwaartse differentiële expressie en functionele analyse.