Hoogtepunten
Het is voor ons een grote eer om voor dit twee uur durende webinar zes experts op het gebied van gewasgenomica te hebben uitgenodigd.Onze sprekers zullen een diepgaande interpretatie geven van twee genomische onderzoeken van Rye, die onlangs zijn gepubliceerdNatuurgenetica:
1. Genoomassemblage op chromosoomschaal biedt inzicht in de biologie, evolutie en agronomisch potentieel van rogge
2. Een hoogwaardige genoomassemblage benadrukt de genomische kenmerken van rogge en agronomisch belangrijke genen
We zijn ook blij dat we Senior R&D-wetenschapper van Biomarker Technologies hebben om zijn ervaring met de novo genoomassemblage te delen.
Agenda
09:00 uur CET
Gastvrije opmerkingen
Zheng Hong-kun
Oprichter en CEO Biomarker Technologies
Deng Xing Wang
Voorzitter van de School voor Geavanceerde Landbouwwetenschappen van de Universiteit van Peking
09:15 uur
Verbetering van de verbetering van rogge, triticale en tarwe door gebruik te maken van hoogwaardige referentiegenoomsequenties
In dit webinar gaf prof. Wang ons algemene updates over de huidige status van het genomisch onderzoek van triticeae en demonstreerde hij het succes en de doorbraken van de twee uitstekende werkzaamheden op het gebied van roggegenoomstudies, die onlangs zijn gepubliceerd op Nature Genetics en die het hele onderzoek introduceren. groepen die leiding geven aan en bijdragen aan de werken.
09:25 uur
Graangenomica @ IPK Gatersleben
Graangrassen van de Triticeae-stam zijn een belangrijke voedselbron geweest in gematigde streken, die lange tijd werden beschouwd als een hotspot op het gebied van gewasverbetering en veredeling.Van alle gecultiveerde soorten staat deze stam bekend om hun uiterst complexe genomische kenmerken, waaronder grote genoomgroottes, hoog gehalte aan TE's, polyploïdie, enz. In deze sessie gaf prof. Nils Stein ons een algemene introductie over IPK Gatersleben en de huidige status van granen. genomisch onderzoek@IPK Gatersleben.
09:35 uur
Genoomassemblage op chromosoomschaal biedt inzicht in de biologie, evolutie en agronomisch potentieel van rogge
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Instituut voor Plantgenetica en Gewasplanonderzoek (IPK)Rogge (Secale graine L.) is een uitzonderlijk klimaatbestendig graangewas, dat op grote schaal wordt gebruikt om verbeterde tarwevariëteiten te produceren via introgressieve hybridisatie, en dat het volledige repertoire aan genen bezit dat nodig is om hybride veredeling mogelijk te maken.Rogge is allogaam en pas onlangs gedomesticeerd, waardoor gecultiveerde rogge toegang heeft tot een diverse en exploiteerbare wilde genenpool.Om het agronomische potentieel van rogge verder te vergroten, hebben we een geannoteerde assemblage op chromosoomschaal van het 7,9 Mbp roggegenoom geproduceerd en de kwaliteit ervan uitgebreid gevalideerd met behulp van een reeks moleculair genetische bronnen.We demonstreren toepassingen van deze hulpbron met een breed scala aan onderzoeken.We presenteren bevindingen over de onvolledige genetische isolatie van gecultiveerde rogge van wilde verwanten, mechanismen van structurele genoomevolutie, resistentie tegen pathogenen, lage temperatuurtolerantie, vruchtbaarheidscontrolesystemen voor hybride veredeling en de opbrengstvoordelen van rogge-tarwe-introgressies.
10:05 uur
Een hoogwaardige genoomassemblage benadrukt de genomische kenmerken van rogge en agronomisch belangrijke genen
Rogge is een waardevol voedsel- en voedergewas, een belangrijke genetische hulpbron voor de verbetering van tarwe en triticale, en een onmisbaar materiaal voor efficiënt vergelijkend genomisch onderzoek bij grassen.Hier hebben we het genoom van Weining-rogge, een elite Chinese roggevariëteit, in kaart gebracht.De verzamelde contigs (7,74 Gb) waren goed voor 98,47% van de geschatte genoomgrootte (7,86 Gb), waarbij 93,67% van de contigs (7,25 Gb) toegewezen was aan zeven chromosomen.Repetitieve elementen vormden 90,31% van het samengestelde genoom.Vergeleken met eerder gesequenced Triticeae-genomen vertoonden Daniela-, Sumaya- en Sumana-retrotransposons een sterke expansie in rogge.Verdere analyses van de Weining-assemblage werpen nieuw licht op genoombrede genduplicaties en hun impact op zetmeelbiosynthesegenen, fysieke organisaties van complexe prolamine-loci, genexpressiekenmerken die ten grondslag liggen aan vroege kopkenmerken, en vermeende domesticatie-geassocieerde chromosomale regio's en loci in rogge.Deze genoomsequentie belooft de genomica- en veredelingsstudies van rogge- en aanverwante graangewassen te versnellen.
10:35 uur
Uitdagingen, oplossingen en toekomst voor de novo-assemblage van genoom
Genoom van hoge kwaliteit is de basis van genomisch onderzoek.Hoewel de snelle ontwikkeling op het gebied van sequencing en algoritmen een veel eenvoudiger en efficiëntere genoomassemblage mogelijk heeft gemaakt, stijgen de eisen op het gebied van nauwkeurigheid en volledigheid ook met de verdieping van onderzoeksdoelen.In deze lezing zal ik de huidige populaire technologieën op het gebied van genoomassemblage bespreken met verschillende succesvolle cases en een glimp opvangen van de toekomstige ontwikkeling.
Posttijd: 08-jan-2022