BMKCloud Log in
Ik ben banner-03

Nieuws

Op nanoporiën gebaseerde transcriptoomsequencing van volledige lengte

Nanopore-sequencing onderscheidt zich van andere sequencing-platforms doordat de nucleotiden direct worden uitgelezen zonder DNA-synthese en lange reads genereren van tientallen kilobasen.Dit maakt het direct uitlezen van volledige transcripties mogelijk en het aanpakken van de uitdagingen in transcriptoomstudies.

√ Lage sequentiespecifieke bias

√ Volledige uitlezing van cDNA voor genstructuurstudies

√ Minder gegevens vereist voor hetzelfde aantal transcripties

√ Identificatie van meerdere isovormen per gen

√ Kwantificering van expressies op isovormniveau

nanoporie-1

Typische bio-informaticapijplijn

Volledige lengte-trans-bix-1024x254

Nieuwste succesvolle cases met biomarkertechnologieën

1. Vergelijkende analyses van transcriptomen van volledige lengte onthullen de ontwikkelingsdynamiek van Gnetum luofuense-stam

Tijdschrift: Grenzen in de genetica

Gepubliceerd: maart 2021

Trefwoorden: MinION |Alternatieve splitsing |APA |lncRNA |Differentieel uitgedrukte transcripties

Lees de volledige tekst

2. Unidirectionele beweging van kleine RNA's van scheuten naar wortels in interspecifieke heterotransplantaten

Tijdschrift: Natuurplanten

Gepubliceerd: januari 2021

Trefwoorden: Nanopore |Illumina |mobiele mRNA-detectie over de volledige lengte

3. Volledige transcriptoomanalyse van aspergewortels onthult het moleculaire mechanisme van zouttolerantie geïnduceerd door arbusculaire mycorrhiza-schimmels

Tijdschrift: Milieu- en experimentele plantkunde

Gepubliceerd: januari 2021

Trefwoorden: MinION |Differentieel uitgedrukte transcripties |Transcriptiefactoren |Alternatieve splitsing

4. Fysiologische karakteristieke veranderingen en transcriptoom over de volledige lengte van de wortels en bladeren van rozen (Rosa chinensis) als reactie op droogtestress

Tijdschrift: Plant- en celfysiologie

Gepubliceerd: oktober 2020

Trefwoorden: PromethION |Differentieel uitgedrukte transcripties |Functionele voorspelling |Gesplitste isovormen |TF en lncRNA

5. Analyse en uitgebreide vergelijking van PacBio en op nanoporiën gebaseerde RNA-sequencing van het Arabidopsis-transcriptoom

Tijdschrift: Plantmethode

Gepubliceerd: april 2020

Trefwoorden: GridION |PromethION |PacBio-vervolg |Illumina NovaSeq |Genoomuitlijning |Afschriftidentificatie |Alternatieve splitsing |SSR |LncRNA |Kwantificering van isovormen

Nieuws en hoogtepunten heeft tot doel de nieuwste succesvolle cases te delen met Biomarker Technologies, waarbij nieuwe wetenschappelijke prestaties worden vastgelegd, evenals prominente technieken die tijdens het onderzoek worden toegepast.


Posttijd: 08-jan-2022

Stuur uw bericht naar ons: