MICROBIEEL
Bacteriële compatibiliteit en immobilisatie met biochar verbeterden de afbraak van tebuconazol, de samenstelling en het functioneren van het bodemmicrobioom
16S-ampliconsequencing over de volledige lengte |PacBio HiFi |Alfa-diversiteit |Bèta-diversiteit
In deze studie werden 16S-ampliconsequencing over de volledige lengte door PacBio en bio-informatica-analyse geleverd door Biomarker Technologies.
Hoogtepunten
Biochar geïmmobiliseerde tebuconazol-afbrekende bacteriën Alcaligenes faecalis WZ-2 werd onderzocht op de efficiëntie van de biologische afbraak en de effecten op met tebuconazol verontreinigde grond in vergelijking met de vrij afbreekbare stam WZ-2.
1. Biochar-geïmmobiliseerd WZ-2 vertoonde een efficiëntere afbraak van tebuconazool vergeleken met vrij WZ-2 door de halfwaardetijd van tebuconazool in de bodem te verminderen van 18,7 dagen naar 13,3 dagen.
2. Biochar-geïmmobiliseerde WZ-2 was in staat om de microbiële enzymactiviteiten van de inheemse bodem te herstellen, waaronder urease, dehydrogenase en invertase, enz.
3. Het microbiële profiel in met biochar geïmmobiliseerde met WZ-2 behandelde grond, bepaald door middel van 16S-sequencing over de volledige lengte, ondersteunde sterk dat dit systeem de gezondheid van de bodem zou kunnen herstellen door de structuur van de bacteriële gemeenschap onder tebuconazolverontreiniging te verbeteren.
Experiment (gerelateerd aan sequencing)
Groepering: CK: Natuurlijke bodem;T: Grond verrijkt met tebuconazool;S: Tebuconazool bevatte grond met vrije stam WZ-2;BC: Tebuconazool bevatte grond met biochar;BCS: Tebuconazool bevatte grond met biochar geïmmobiliseerd WZ-2.
Bemonstering: Totale bodem-DNA-extractie versterkt door 16S rDNA-primers
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') en 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),vertegenwoordigt 16S rDNA van volledige lengte
Sequentieplatform: PacBio RS II
Sequencing-strategie: CCS HIFI leest
Gegevensanalyse:BMKCloudBio-informaticaplatforming maakt van goudvissen een uitstekend genetisch modelsysteem voor de fysiologie en evolutie van vissen.
Resultaat
De structuur van de microbiële gemeenschap in de bodem werd bepaald door 16S rDNA-sequencing.De OTU-rijkdom en alfa-diversiteitsindex, inclusief Chao1-, Ace-, Shannon- en Simpson-indices, werden geëvalueerd om de soortendiversiteit in elk systeem te onthullen.Na een incubatie van 60 dagen vertoonden alle indices een vergelijkbare trend, dat wil zeggen dat tebuconazool een vermindering van de soortenrijkdom en diversiteit in de bodem zou kunnen veroorzaken.Door het toevoegen van stam WZ-2 werd de gemeenschap van bodembacteriën echter gedeeltelijk hersteld in termen van zowel rijkdom als diversiteit.Er werd een beperkt verschil waargenomen tussen BC, BCS en CK, wat aangeeft dat biochar en biochar-geïmmobiliseerd WZ-2 de biologische gezondheid van de bodem effectief zouden kunnen herstellen.
In dit onderzoek werd de ongewogen paargroepmethode met rekenkundige middelen (UPGMA) toegepast om de bètadiversiteit tussen groepen aan te tonen.Zoals blijkt uit de volgende figuur, deelden BC, BSC en CK een meer vergelijkbaar patroon van microbiële samenstelling vergeleken met groep T en S, wat verder aangaf dat de introductie van biochar in met tebuconazol verontreinigde bodembioremediatie het herstel van de microbiële gemeenschap in de bodem grotendeels zou kunnen vergemakkelijken.
Figuur.UPGMA-clustering van bacteriële gemeenschap op fylumniveau onder verschillende behandelingen
Referentie
Zon, Tong, et al.“Bacteriële compatibiliteit en immobilisatie met biochar verbeterde de afbraak van tebuconazol, de samenstelling en het functioneren van het bodemmicrobioom.”Tijdschrift voor gevaarlijke materialen398 (2020): 122941.
Nieuws en hoogtepunten heeft tot doel de nieuwste succesvolle cases te delen met Biomarker Technologies, waarbij nieuwe wetenschappelijke prestaties worden vastgelegd, evenals prominente technieken die tijdens het onderzoek worden toegepast.
Posttijd: 08-jan-2022