Een belangrijk tuinbouwkenmerk dat navelsinaasappelen onderscheidt van andere veel voorkomende zoete sinaasappelvariëteiten is de aanwezigheid van een navel op de vrucht.Dit kenmerk is ook een belangrijk criterium voor de classificatie van tuinbouwvariëteiten voor zoete sinaasappel.
De klanten van BMKGENE gebruikten de zelfontwikkelde SLAF-sequencingtechnologie van BMKGENE om een onderzoek uit te voeren met de titel “Mijnbouwgenen gerelateerd aan de fruitkwaliteit in zoete sinaasappelen op basis van specifieke locus-versterkte fragmentsequencing.“
De studie omvatte het sequencen van 240 zoetoranje kiemplasmabronnen met een grote genetische diversiteit en verschillende geografische oorsprong, resulterend in 497,82 Mb aan kortgelezen gegevens.Analyse van de gegevens leverde 1.467.968 SNP-genotypes op over het gehele genoom.Door gebruik te maken van Fst-analyse identificeerde het onderzoek zes kandidaat-genen die verband houden met de aanwezigheid van een navel, vruchtgewicht en titreerbare zuurgraad, wat een basis vormde voor gerichte verbetering van zoete sinaasappelvariëteiten.
Voor grootschalige populatiesequencing is specifieke locus geamplificeerde fragmentsequencing (SLAF) kosteneffectiever en zeer effectief in vergelijking met sequencing van het hele genoom (WGS).
Klikhiervoor meer informatie over deze studie.
Posttijd: 05-dec-2023