BMKGENE leverde transcriptoomsequencingdiensten van volledige lengte met behulp van PacBio- en ONT-technologieën voor een onderzoek met de titel "Vergelijkende analyse van PacBio en ONT RNA-sequencingmethoden voor identificatie van Nemopilema Nomurai-gif", dat werd gepubliceerd in het tijdschrift Genomics.Het onderzoek had tot doel de effectiviteit van PacBio- en ONT-RNA-sequencingmethoden bij het identificeren van het gif van de kwallensoort Nemopilema nomurai te vergelijken.
De bevindingen van de studie suggereren dat ONT over het algemeen een hogere kwaliteit van de ruwe gegevens produceerde in de transcriptoomanalyse, terwijl PacBio langere leeslengtes genereerde.PacBio bleek superieur te zijn in het identificeren van coderende sequenties en niet-coderend RNA met lange keten, terwijl ONT kosteneffectiever was voor het voorspellen van alternatieve splitsingsgebeurtenissen, eenvoudige sequentieherhalingen en transcriptiefactoren.
Deze studie heeft belangrijke implicaties voor toekomstige sequencing-technologieën bij zeekwallen en benadrukt de kracht van volledige transcriptoomanalyse bij het ontdekken van potentiële therapeutische doelen voor kwallendermatitis.
Klikhiervoor meer informatie over dit artikel.
Posttijd: 20 december 2023