Gezamenlijke analyse van genoomassemblage, populatie-evolutie, genetica en moleculaire biologie is een geprefereerde manier om een compleet biologisch verhaal van het onderzoeksobject te vertellen.Vorige maand publiceerden professor Jiawei Wang en zijn team hun onderzoek over Nature Communications met de naam “Common evolutionary trajectory of short life-cycle in Brassicaceae Ruderral Weeds”, wat je misschien zal inspireren.
In deze studie werd het genoom van Cardamine occulta de novo samengesteld en geannoteerd, en werden ook 87 C. occulta-monsters verzameld vanaf de oorsprong opnieuw gesequenced.Uit de evolutionaire analyse bleek dat één evolutionaire tak het meest verspreid was, in staat zich aan te passen aan frequente verstoringen van menselijke activiteiten en zich met menselijke activiteiten te verspreiden.Deze tak was significant genetisch gedifferentieerd van verwante takken in de bloeiregulatieroute en was niet in staat te reageren op de vernalisatieroute of de fotoperioderoute.Door middel van BSA-analyse van genetische populaties en functionele verificatie van transgene planten werden FLC en CRY2 geïdentificeerd en bevestigd als de genetische basis van C. occulta om te reageren op vernalisatie- en fotoperiode-routes.
Meer informatie over dit document vindt u ophttps://www.nature.com/articles/s41467-023-35966-7
BMKGENE heeft ervaring opgebouwd met het leveren van de novo genoomassemblage en hersequencing van het hele genoom voor deze studie.We kijken ernaar uit omleveringingvertrouwde sequencingdiensten om onderzoekers te helpen hun doelen te bereiken.
Posttijd: 08 mei 2023