20 mei is Wereld Bijendag!Bijen zijn essentiële bestuivers die bijdragen aan de diversiteit en productiviteit van ecosystemen, evenals aan de productie van voedselgewassen die zowel mens als dier voeden.
De Aziatische honingbij is een belangrijke bestuiversoort die een cruciale rol speelt in de landbouw en ecosysteemdiensten.Het conceptgenoom van A. cerana werd in 2015 gepubliceerd met behulp van NGS-technologie, dat sterk gefragmenteerd was en geen steigers op chromosoomniveau had, waardoor het noodzakelijk was om completere en nauwkeurigere genoomsequenties te verkrijgen.
Een van de succesvolle cases van BMKGENE, een team van onderzoekers uit China en Australië, publiceerde een nieuwe studie met de titel “A Chromosome-Scale Assembly of the Asian Honeybee Apis cerana Genome”.In deze studie presenteren ze een zeer aaneengesloten assemblage op chromosoomschaal van het A. cerana-genoom met behulp van een combinatie van PacBio langgelezen sequencing en Hi-C-gegevens.De bijgewerkte assemblage is 215,67 Mb groot met een contig N50 van 4,49 Mb, wat een 212-voudige verbetering betekent ten opzichte van de vorige op Illumina gebaseerde versie.De nieuwe vergadering had ook een hogere volledigheid, met 97,6% van de BUSCO's aanwezig, vergeleken met slechts 86,9% in de vorige vergadering.Onderzoekers voerden nauwkeurigere en uitgebreidere genomische analyses uit, zoals het voorspellen van nieuwe genen en het detecteren van structurele variaties, wat belangrijke implicaties kan hebben voor het begrijpen van de biologie en evolutie van deze soort.
BMKEGENE beschikt over ruime ervaring met hoogwaardige genoomassemblage en kijkt ernaar uit u van dienst te kunnen zijn.
Klik hier om te lerenMeer over deze studie
Posttijd: 22 mei 2023