● Zeer ervaren: Er zijn meer dan 200.000 monsters verwerkt in BMK voor diverse monstertypen, waaronder celcultuur, weefsel, lichaamsvloeistof, enz. en er zijn meer dan 7000 mRNA-Seq-projecten gesloten die verschillende onderzoeksgebieden bestrijken.
● Strikt kwaliteitscontrolesysteem: De kernkwaliteitscontrolepunten tijdens alle stappen, inclusief monstervoorbereiding, bibliotheekvoorbereiding, sequencing en bio-informatica, worden nauwlettend gevolgd om resultaten van hoge kwaliteit te leveren.
● Meerdere databases beschikbaar voor functie-annotatie en verrijkingsstudies om diverse onderzoeksdoelen te bereiken.
● After-sales services: After-sales services die 3 maanden geldig zijn na voltooiing van het project, inclusief projectopvolging, probleemoplossing, vragen en antwoorden over resultaten, enz.
Bibliotheek | Sequentiestrategie | Gegevens aanbevolen | Kwaliteitscontrole |
Poly A verrijkt | Illumina PE150 | 6 GB | Q30≥85% |
Nucleotiden:
Conc. (ng/μl) | Hoeveelheid (μg) | Puurheid | Integriteit |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Beperkte of geen eiwit- of DNA-verontreiniging weergegeven op de gel. | Voor planten: RIN≥6,5; Voor dieren: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; beperkte of geen basislijnhoogte |
Weefsel: Gewicht (droog):≥1 gram
*Voor weefsel kleiner dan 5 mg raden wij aan om snel ingevroren (in vloeibare stikstof) weefselmonsters op te sturen.
Celsuspensie:Aantal cellen = 3×106- 1×107
*Wij raden aan om bevroren cellysaat te verzenden.In het geval dat het aantal cellen kleiner is dan 5×105.
Bloedstalen:Volume≥1 ml
Micro-organisme:Massa ≥ 1 g
Verpakking: centrifugebuisje van 2 ml (aluminiumfolie wordt niet aanbevolen)
Monsterlabeling: groeperen+repliceren, bijvoorbeeld A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Verzending:
Bio-informatica
Eukaryotisch Analyseworkflow voor mRNA-sequencing
Bio-informatica
ØKwaliteitscontrole van ruwe gegevens
ØUitlijning van het referentiegenoom
ØTranscriptiestructuuranalyse
ØKwantificering van expressie
ØDifferentiële expressieanalyse
ØFunctieannotatie en verrijking
1.mRNA-gegevensverzadigingscurve
2.Differentiële expressieanalyse-vulkaanplot
3.KEGG-annotatie op DEG's
4.GO-classificatie op DEG's